蔡莎莎
- 作品数：2 被引量：10H指数：2
- 供职机构：贵州大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：博士科研启动基金贵州省科学技术基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 贵州不同产地薤白nrDNA ITS序列分析及亲缘关系研究被引量：7
- 2017年
- 采用PCR直接测序法,对产自贵州11个不同地区的薤白(Allium macrostemon Bunge)18个样品进行核糖体DNA ITS序列测定,并结合Gen Bank中下载的来自四川汶川、陕西汉中以及韩国的薤白ITS序列进行对比分析。结果显示,贵州不同产地的薤白ITS序列长度为534~537 bp,其中G+C含量为50.5%~51.1%,平均含量为50.9%,有16个变异位点,包括T-C、T-G、A-G间的转换以及T-A、G-C间的颠换。以单花韭(Allium monanthum Maxim.)为外类群,结合GenBank中下载葱属部分植物序列,基于贝叶斯法和最大简约法构建系统聚类树的结果显示,葱属部分植物可分为4支,其中薤白聚为一支并支持薤白作为一个单系类群,而不同产地的薤白又可分为4小支,其中来自贵阳清镇、六盘水平寨、安顺平坝、黔西南兴仁、铜仁思南的薤白亲缘关系较近,表明基于nrDNA ITS序列能鉴别不同产地薤白的亲缘关系。
- 杨鹏舒建锋蔡莎莎赵财
- 关键词：薤白ITS序列亲缘关系
- 基于ITS的贵州省30个树种的DNA条形码研究被引量：3
- 2018年
- 本文对贵州省19科26属30种林木树种植物ITS序列进行PCR扩增及测序,用MEGA 5. 0软件对序列进行比对分析序列信息,用最近距离法计算种内及种间遗传距离,通过邻接法构建系统发育树。结果表明,供试树种的DNA总长度为506～684 bp,其中平均G+C含量为64%,种内平均遗传距离为0. 013,种间平均遗传距离为0. 236;基于ITS序列构建的聚类树显示,对30种林木树种的鉴定成功率为83%,因此,推荐ITS序列作为林木树种DNA条形码的候选序列。
- 成宇蔡莎莎舒剑锋袁昊伍颖凃翠杨鹏赵财
- 关键词：林木树种DNA条形码ITS
