陶佳妮
- 作品数：4 被引量：1H指数：1
- 供职机构：武汉轻工大学食品科学与工程学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：轻工技术与工程自动化与计算机技术化学工程更多>>
- 咖啡豆α-半乳糖苷酶的同源建模及分析被引量：1
- 2016年
- 为进一步了解咖啡豆α-半乳糖苷酶的结构,对咖啡豆α-半乳糖苷酶的理化性质、二级结构及三级结构等进行了理论分析和预测,并在三级结构的基础上进行同源建模研究。分析表明,该酶呈酸性,亲水,稳定。二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,其空间结构与大米α-半乳糖苷酶相似度较高,以此为模版构建了可靠的三维结构模型。模型的一侧是由8个α-螺旋和8个β-转角形成的球状结构,另一侧是8个β-转角。实验结果为咖啡豆α-半乳糖苷酶的空间结构和催化活性位点的研究提供了理论依据。
- 陶佳妮李赟姚娣沈汪洋陈轩周坚
- 关键词：蛋白质结构分析同源建模
- 环糊精与咖啡豆α-半乳糖苷酶的分子对接研究
- 2015年
- 通过分子对接方法研究3种主要的环糊精(α-环糊精、β-环糊精及γ-环糊精)与咖啡豆α-半乳糖苷酶的相互作用模型与分子机理。结果表明,咖啡豆α-半乳糖苷酶活性口袋中的关键氨基酸残基为:Trp31、Trp179、Asp200,环糊精中的关键基团为:次甲基上的羟基、亚甲基上的羟基。环糊精覆盖在咖啡豆α-半乳糖苷酶亲水活性空腔的表面,从而抑制其活性,β-环糊精的抑制作用较为明显。分子对接结果为酶法合成α-半乳糖基-环糊精的相互作用研究提供了理论依据。
- 陶佳妮李赟姚娣陈轩李芳孙威周坚沈汪洋
- 关键词：环糊精活性位点分子对接
- 环糊精与咖啡豆α-半乳糖苷酶相互作用的三维结构研究
- 为进一步了解咖啡豆α-半乳糖苷酶的结构,本实验对咖啡豆α-半乳糖苷酶的物理性质及化学性质,二级、三级结构等进行了理论预测和分析,随后在其三级结构的基础上进行了同源建模研究。分析一级结构发现,其主肽链由378个氨基酸组成,...
- 陶佳妮
- 关键词：同源建模环糊精活性位点分子对接
- 文献传递
- β-环糊精抑制α-半乳糖苷酶的动力学模拟
- 2017年
- 为进一步了解β-环糊精与α-半乳糖苷酶的作用机制,在前、中期采用同源建模、分子对接的基础上,采用对复合物体系进行分子动力学模拟,并计算出均方根偏差、温度、密度以及总能量四个衡量指标,对体系动力平衡的稳定程度进行评价,得到了动力学模拟轨迹是稳定的结果,再采用MMPBSA能量计算及分解的方法,对β-环糊精与α-半乳糖苷酶之间的相互作用进行能量计算,确定了两者的结合是一个自发的过程,且能够达到一个稳定的状态,并得到了β-环糊精对α-半乳糖苷酶的抑制作用主要是由范德华相互作用能和静电作用能产生的结论。
- 邹伟王敏陶佳妮姚娣李赟王雪松沈汪洋
- 关键词：Β-环糊精Α-半乳糖苷酶分子动力学模拟
