王军
- 作品数：3 被引量：4H指数：1
- 供职机构：中国科学院计算机网络信息中心更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：文化科学自动化与计算机技术理学更多>>
- 基于高通量计算平台的晶体表面切割设计与实现
- 2016年
- 在进行晶体表面性质的理论研究时,周期性薄膜(slab)结构模型用在基于密度泛函理论的第一性原理计算中,用来模拟表面体系结构。本文详细描述了如何从一个晶体结构切割出指定晶面的周期性薄膜结构模型的算法,特别的,该算法能够为所切表面指定裸露原子。MatCloud材料计算平台是一个国内自主研发的高通量材料计算平台,基于MatCloud平台,我们开发了晶体表面切割模块,实现了对晶体的低密勒指数表面建模。并将该模块与高通量表面吸附模块进行集成,为自动寻找所有可能的表面活性位点,以及不同吸附位点的晶体结构的高通量筛选和性质计算提供了初始模型。
- 孙雪姣杨小渝王宗国王军武帅
- 基于高通量计算平台的过渡态搜索算法及自动流程实现被引量：1
- 2016年
- 本文针对寻找反应过程中过渡态结构的问题,基于高通量计算平台设计并实现了一种过渡态搜索算法及其自动计算流程。实现了包括中间结构自动产生功能在内的过渡态搜索的自动流程计算,具体包括计算的准备文件产生、结构筛选、结果后处理等各个流程。同时,在整个自动计算过程中还引入自动纠错机制,可以实现自动根据错误类型实现对错误的恢复与处理功能,以提高过渡态搜索计算的可靠性。最后,本文进行了H原子在Mg晶体表面扩散的研究,将计算结果与文献数据进行了对照,以验证计算结果的合理性。
- 武帅杨小渝王宗国赵旭山王军孙雪姣
- 关键词：第一性原理计算
- 在晶体表面寻找最佳吸附位点的高通量算法被引量：3
- 2016年
- 在研究原子在晶体表面的吸附现象时,研究者们往往需要依赖已有的经验与知识寻找出所有可能的吸附位点,再通过运行基于密度泛函理论(DFT)的第一性原理计算模拟软件最终找到最佳吸附位点,这是较为浪费时间的。借助于材料基因组计划(MGI)中的高通量筛选这一概念,本文提出了一个寻找晶体表面最佳吸附位点的自动化的高通量计算方法。本文主要阐述了该高通量方法中的一个重要的算法,即如何自动寻找所有可能吸附位点的算法,然后将该算法与第一性原理计算模拟软件整合,它们一起构成了寻找最佳吸附位点的高通量方法。该高通量方法的创新之处在于能够在不依赖于研究者经验与知识的前提下,自动地找出所有可能的吸附位点,并利用第一性原理计算模拟引擎,最终找到最佳吸附位点。此外,这个方法被应用于MatCloud平台。MatCloud平台是一个高通量材料计算平台,它使得整个寻找最佳吸附位点的流程自动化。
- 王军杨小渝王宗国孙雪姣武帅
- 关键词：第一性原理计算
