金丹
- 作品数:2 被引量:5H指数:1
- 供职机构:华中农业大学生命科学技术学院更多>>
- 发文基金:福建省农科院青年科技人才创新基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- KLF15转录因子对猪AdipoR1基因调控
- 脂肪组织作为动物的内分泌器官受到人们高度关注,它能够分泌大量的生物活性分子,包括脂肪细胞因子和激素类物质。KLF15是Krüppel样因子(KLFs)家族的成员之一,是一类高度保守的转录因子,在调控哺乳动物脂肪细胞分化过...
- 朱小玥龙勤强吴艳玲金丹杨在清
- 哺乳动物Gpx基因家族进化选择和功能分歧研究被引量:5
- 2012年
- 研究哺乳动物谷胱甘肽过氧化物酶基因家族(Gpx)的亲缘关系和进化选择压力性质。从NCBI等网站获取哺乳动物Gpx基因编码区核酸序列和GPX蛋白氨基酸序列,并用MEGA、Clustal构建亲缘关系树,用SignalP和TargetP分析信号肽和亚细胞定位信息;用K estimator和PAML分析其Gpx基因家族进化先后顺序和选择压力;用Diverge分析GPX蛋白家族功能分歧。结果表明,GPX蛋白家族进化中形成两个亚类,其一包括GPX1和GPX2,其二包括GPX3、GPX5和GPX6;各GPX蛋白成员均有高度保守的GPX蛋白家族基序和高度保守的硒代半胱氨酸或半胱氨酸残基,氨基端信号肽分析显示,GPX1蛋白为胞浆线粒体型,其余家族成员均为胞外分泌型;哺乳动物Gpx1基因进化上受到严格的负选择作用,Gpx基因家族成员保守区也受到负选择作用,但用枝位点模型却检出了正选择作用,GPX蛋白家族内存在轻微的功能分歧。哺乳动物GPX蛋白家族的进化上的负选择作用表明其在哺乳动物清除自由基抗氧化方面的关键作用。
- 杨红文金丹
- 关键词:哺乳动物结构域进化分析