杨锋
- 作品数：5 被引量：18H指数：3
- 供职机构：山西农业大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金公益性行业(农业)科研专项国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学轻工技术与工程更多>>
- 栽培黑果枸杞活性成分生物合成关键基因克隆及表达分析被引量：1
- 2020年
- [目的]本文旨在对不同生长期花色苷和原花青素含量及关键酶基因表达分析,为从分子生物学水平确定黑果枸杞最佳采收期提供理论依据,同时对生物合成途径中关键酶基因进行克隆,为揭示黑果枸杞花色苷和原花青素的生物合成机制以及利用基因工程技术进行黑果枸杞靶向育种奠定基础。[方法]分别利用pH示差法和香草醛-盐酸法测定不同时期黑果枸杞花色苷和原花青素含量;通过RT-PCR技术扩增4种关键酶基因LrDFR、LrANS、LrLAR和LrANR的cDNA全长序列,并进行生物信息学分析;利用qRT-PCR分析关键酶基因在黑果枸杞果实不同发育时期的表达情况。[结果]黑果枸杞果实花色苷在黑果成熟期含量最高(6.08 mg·g^-1 DW),原花青素在半紫半黑果期含量最高(22.3 mg·g^-1 DW);克隆得到4种关键酶基因的序列全长分别为1140 bp、1251 bp、1002 bp和1017 bp,分别编码379、416、333和338 aa的蛋白质,序列分析表明4种基因所编码氨基酸均具有所属蛋白家族的典型特征。[结论]花色苷在黑果成熟期含量最高,原花青素在半紫半黑果期含量最高,且随着果实发育和花色苷含量的增加,LrDFR和LrANS表达水平也逐渐上升,而LrLAR和LrANR则呈先上升后下降的表达模式;当黑果枸杞用于原花青素提取时,可适当提前采收期;研究结果为从分子生物学水平确定黑果枸杞最佳采收期提供理论依据,也为黑果枸杞花色苷与原花青素生物合成机制的揭示奠定基础。
- 王德富杨锋崔丽艳龙丹丹李玲玉申少斐牛颜冰
- 关键词：黑果枸杞花色苷原花青素基因克隆
- 油菜花叶病毒山西地黄分离物的全基因组序列测定与分析被引量：6
- 2016年
- 采用双链RNA（double-stranded RNA,dsRNA）技术和非序列依赖PCR扩增（sequence-independent amplification,SIA）方法对感病地黄进行分子鉴定,并测定油菜花叶病毒（Youcai mosaic virus,YoMV）山西地黄分离物（YoMV-SX）的基因组全序列。序列测定及分析发现侵染地黄的病毒为油菜花叶病毒（Youcai mosaic virus,YoMV）。获得YoMV-SX（Gen Bank登录号JX422022）全长为6 304 nt,5＇UTR长度为68 nt,3＇UTR长度为236 nt,含有4个开放阅读框（open reading frame,ORF）。全序列核苷酸一致性分析显示Yo M V-SX与Tobamovirus亚组Ⅲ中分离物的一致性为90.7%-96.0%,与同属亚组Ⅰ和Ⅱ的一致性仅为50.2%-63.3%。全序列系统进化分析表明,YoMV-SX与YoMV-Wh形成一个独立分支,亲缘关系最近。这是YoMV侵染地黄的首次报道。
- 王德富张西梅杨锋牛颜冰
- 关键词：地黄
- 锦葵脉明病毒中国蜀葵分离物cp基因序列分析被引量：4
- 2017年
- 本研究利用双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)和非序列依赖性PCR扩增技术(sequence-independent amplification,SIA)对表现出条斑症状的感病蜀葵进行了病原鉴定,结果发现侵染蜀葵的病原为锦葵脉明病毒(Malva vein clearing virus,MVCV),这是锦葵脉明病毒在国内首次报道。为进一步明确锦葵脉明病毒中国蜀葵分离物(MVCV-AR)的来源及进化关系,克隆获得其外壳蛋白(coat protein,cp)基因(Gen Bank登录号为KX619649)。通过与其他MVCV分离物的核苷酸及氨基酸序列比对分析可知,MVCV-AR与Mexico的tomato分离物(FJ561293)的核苷酸同源性最高为90.5%;与来自Italy的DS-Ba-01分离物(FM 212972)的氨基酸同源性最高为98.3%。系统进化分析表明,MVCV-AR与DS-Ba-01分离物聚为一簇,形成独立的分支。
- 杨锋牛二波王德富牛颜冰
- 关键词：蜀葵病原鉴定
- 黄芩高通量转录组测序数据组装和分析被引量：7
- 2016年
- 采用高通量测序技术对黄芩的转录组进行测序,获得了29 099 899条reads数据,拼接后得到53 353条Unigene;将所获得的Unigene与COG,GO,KEGG,Swiss-Prot,NR这5个公共数据库进行比对,结果发现,分别有10 756,21 950,8 101,20 339,29 288条Unigene可比对到以上5个数据库中;已注释的Unigene与COG数据库比对后按功能可分为25类;根据GO功能可分为三大类57个亚类;经过与KEGG数据库比对后按照代谢通路可分为116类;利用Get ORF软件进行ORF预测,获得长度大于300 nt的ORF共20 552个;通过SSR分析,共获得5 658个SSR标记。获得的转录组信息可为今后进行黄芩分子标记的开发和关键基因的克隆及功能分析等研究提供基础数据。
- 王德富成媛媛杨锋牛二波牛颜冰
- 关键词：黄芩转录组测序生物信息学分析
- 丝瓜和西葫芦病毒病病原检测及基因组全序列测定与分析
- 本研究首先利用Dot-ELISA 对采集于山西省多个地区的150 份丝瓜和西葫芦疑似病样进行检测,发现CMV 是优势病毒种类,总检出率为71.4％;接着对CMV 呈阳性反应的样品进行dsRNA 和SIA 检测,在丝瓜上发...
- 牛二波杨锋寇丽莎庞小静牛颜冰
- 关键词：丝瓜西葫芦病原检测全基因组序列分析
