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黄邦全

作品数：1 被引量：7H指数：1
供职机构：湖北大学生命科学学院更多>>
发文基金：江苏省农业科技自主创新基金更多>>
相关领域：农业科学更多>>

合作作者

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇农业科学

主题

  • 1篇海甘蓝
  • 1篇分子标记
  • 1篇甘蓝
  • 1篇RNA-SE...

机构

  • 1篇湖北大学
  • 1篇中国科学院
  • 1篇江苏省农业科...
  • 1篇瓦赫宁根大学

作者

  • 1篇戚维聪
  • 1篇林峰
  • 1篇李坦
  • 1篇程计华
  • 1篇黄邦全

传媒

  • 1篇江苏农业学报

年份

  • 1篇2014
共 1 条 记 录，以下是 1-1
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排序方式：
基于海甘蓝RNA-Seq序列开发EST-SSR分子标记被引量：7
2014年
利用油料作物海甘蓝(十字花科)发育时期种子的RNA-Seq测序数据组装获得186 778条cDNA重叠群(Contigs)序列,通过MISA和Primer 3程序设计了6 639个EST-SSR分子标记。在这些标记中,除了单核苷酸重复(45%)外,三核苷酸重复的SSR是最常见的碱基重复类型(29%),其次是双核苷酸型(10%)、五核苷酸型(7%)、六核苷酸型(5%)和四核苷酸型(2%)型。采用电子定位的方法将1 206个EST-SSR标记定位到近缘种白菜(Brassica napa)的基因组上。依据引物在白菜基因组中的分布,挑选了20条EST-SSR引物在海甘蓝中进行PCR验证,其结果显示所有引物均能够扩增出符合预期大小的PCR片段。这些新开发的EST-SSR引物可以作为功能标记应用于海甘蓝的分类鉴定、遗传图谱构建、种质资源鉴定以及分子标记辅助育种工作中。
戚维聪程计华黄邦全李坦林峰
关键词：海甘蓝分子标记
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