刘宇
- 作品数：9 被引量：13H指数：2
- 供职机构：中国海洋大学食品科学与工程学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金山东省博士后创新项目山东省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生化学工程更多>>
- 利用InDel标记解析中国花生地方品种的遗传多样性与群体结构被引量：1
- 2020年
- 为揭示InDel标记对我国地方花生品种遗传多样性和遗传结构的解析能力,本研究利用13个多态性InDel标记检测4个典型生物学类型的90份中国花生地方品种材料。共扩增出42的等位基因,平均3个;Nei’s多样性指数变幅为0.011~0.705,平均0.443;Shannon’s信息指数变幅为0.034~1.497,平均0.758。龙生型、普通型、珍珠豆型与多粒型花生的Nei’s遗传多样性指数分别为0.3198、0.4407、0.4435和0.4372,结果表明龙生型的遗传多样性明显小于其它生物学类型。种质间的遗传相似系数范围为0.077~1.000,平均为0.636;且普通型与龙生型花生之间遗传相似系数最高,为0.636。群体分析结果表明密枝亚种与疏枝亚种、不同植物学类型之间遗传分化较小,且普通型与珍珠豆型遗传结构相似,龙生型与多粒型花生遗传结构不同。利用非加权平均法(UMPGA)聚类分析将90份花生材料划分为两类(G1、G2),其中G1包括全部的龙生型、61.90%的普通型以及20.00%的珍珠豆型。本研究结果表明InDel标记能够有效地揭示栽培种花生的遗传变异,可为花生杂交亲本的选择以及优异基因的挖掘提供重要参考。
- 刘宇刘宇李春娟闫彩霞闫彩霞赵小波孔青孙全喜王娟王娟
- 关键词：INDEL标记花生中国地方品种
- 酶法合成RNA的相关技术研究进展被引量：1
- 2016年
- 近些年来RNA相关研究发展迅速,从质和量两方面对RNA合成技术提出了更高的要求。RNA合成方法包括化学合成和酶法合成两种。目前已商业化的RNA化学合成法能够实现长度小于90个碱基的RNA合成,但合成费用相对较高,使许多研究难以展开。相对于化学合成,酶法合成具有效率高、条件温和的特性,能够合成长序列,是一种高效、低耗的RNA合成方案。酶法合成的技术流程包括转录和加工两步,其中转录的模型主要分为线性转录和滚环转录两种,不同的模型产生的初始转录产物特性不同,需要采用相应的加工方式对其进行处理才能获得准确的目的 RNA产物。近年来研究者们不断地研究探索RNA的酶法合成,发现并构建了多种转录模型和初始转录物的加工方案,将从酶法合成RNA的转录模型和加工技术的原理、特点和问题等方面进行概述,以期为后续酶法合成RNA的进一步研究和选择性应用提供参考。
- 王静潘孝明刘宇梁兴国
- 关键词：RNA酶法合成
- 新型猪胃蛋白酶原突变体真核表达体系构建
- 2017年
- [目的]构建4种新型猪胃蛋白酶原突变体真核表达体系。[方法]以含有猪胃蛋白酶原基因的环状质粒pPICZαA-PGA为模板,对猪胃蛋白酶活性关键氨基酸Asp32和Asp215相关的S35、G76、T216和T218 4个位点定点突变;突变质粒鉴定后电转化至毕赤酵母X-33;qPCR鉴定高mRNA表达转化子;以甲醇诱导表达4 d后SDS-PAGE及酶活测定检测目的蛋白。[结果]成功构建4种新型猪胃蛋白酶原突变体mPG-S35A、mPG-G76A、mPG-T216A和mPG-T 218A;阳性克隆率超过90%;SDS-PAGE检测到清晰的目的蛋白条带,分子量约为48 k Da,4种突变体的酶活分别是11.3 U/mL、22.6 U/mL、16.9 U/mL、13.7 U/mL。[结论]SDS-PAGE检测到4种分子量48 k Da的突变猪胃蛋白酶原清晰条带,四者酶活在11.3~22.6 U/mL之间,成功构建4种新型猪胃蛋白酶原突变体在毕赤酵母以外分泌表达的体系。
- 郭辉刘宇郑屿佳武燕月董平梁兴国
- 关键词：定点突变
- InDel在种间进化关系研究中的解析力初探
- 2020年
- 系统发育分析是揭示物种间进化关系的重要方法。由于插入/缺失(Insertion/Deletion,InDels)变异情况的复杂性,大多数研究进行系统发育分析时往往只考虑单核苷酸碱基替换(Single nucleotide polymorphism,SNPs),忽略了InDels的遗传变异信息。为揭示InDels在系统发育分析中的解析力,本研究对花生属13个物种叶绿体基因组全序列的遗传变异信息(SNPs和InDels)进行统计和处理,首先依据全部SNPs变异所构建系统树的拓扑结构,确定的NJ树分支系统关系揭示所需SNPs饱和变异数目。结果显示,当SNP数目达到3000个之后,拓扑结构持续保持稳定。研究发现InDels能够增加系统发育树中某些节点的分辨率,但其解析力低于同等数目的SNP的解析力。综上,InDels作为主要遗传变异形式之一,能够为准确解析系统进化关系提供有力支持。
- 刘宇刘宇李春娟闫彩霞赵小波孙全喜孙全喜王娟
- 关键词：系统发育分析
- 核酸在黑鱼胃蛋白酶中的消化
- 饮食核酸是一种重要的营养素,然而关于核酸在鱼胃内的消化研究鲜有报道.本文研究了黑鱼胃蛋白酶对核酸的消化情况.提取并纯化黑鱼胃蛋白酶,通过SDS-PAGE和HPLC鉴定黑鱼胃蛋白酶的纯度,并将黑鱼胃蛋白酶的主要成分SP2(...
- 刘宇张艳芳王静潘孝明曹敏杰董平梁兴国
- 关键词：黑鱼核酸饲料胃蛋白酶
- 一种快速高效提取花生叶片DNA的简化方法被引量：1
- 2019年
- 为获得适用于高通量测序的高质量花生叶片DNA,本方法取第三对真叶为实验材料,设计烧制圆球状枪头和离心管装置代替研钵研磨,并在CTAB法的基础上在杂质沉淀前快速分离DNA等简化方法提取DNA。琼脂糖凝胶电泳检测结果表明DNA条带清晰、完整性高。经超微量分光光度计检测,DNA浓度范围在104～131ng/μL,OD_(260)/OD_(280)为1.7～2.0,OD_(260)/OD_(230)大于2.0,说明杂质少,可获得高纯度,高浓度的DNA。此方法与常用的植物基因组DNA提取方法相比,具有成本低、时间短、质量高的优点,可用于基因组重测序、分子生物学技术以及分子标记筛选等后续研究,可提高花生分子育种与筛选工作效率。
- 刘宇刘宇李春娟闫彩霞赵小波孔青孙全喜王娟王娟
- 关键词：花生DNA提取
- 突变G76A和T216A猪胃蛋白酶原的表达及其对核酸消化的影响
- 基于前期研究发现猪胃蛋白酶具有消化核酸的作用,为了进一步研究胃蛋白酶调控核酸消化活性的活性位点并分析胃蛋白酶调节核酸消化的机理,我们首先将含有突变目的片段的质粒载体转入巴斯德毕赤酵母X-33细胞中,之后培养转化成功的酵母...
- 郭辉刘宇郑屿佳武燕月董平梁兴国
- 关键词：胃蛋白酶核酸活性位点定点突变
- 基于简化基因组的花生InDel标记开发和功能解析被引量：6
- 2019年
- InDel在基因组中的分布密度仅次于SNP,可作为动植物群体遗传分析、分子辅助育种等研究领域的有效分子标记。花生是世界范围内重要的油料作物之一。目前,花生栽培种全基因组已经公布,为准确挖掘花生基因组信息提供了重要参考。本研究通过169份花生核心种质的GBS(Genotyping-by-sequencing)测序和比对,共获得大小分布在1～14 bp范围内的10401个InDels。染色体Arahy.16上分布的InDels最多,达741个;而在染色体Arahy.08上分布的最少,有263个。参考基因组注释信息,仅有1167个InDels分布在功能基因相关区域。经GO注释,InDel分子功能主要包括催化活性(catalytic activity)和结合(binding);生物过程主要涉及代谢过程(metabolic process)、单组织过程(single-organism process)和细胞过程(cellular process)。经KEGG通路分析发现,InDels所在的基因区域的功能主要与代谢相关。本研究开发出全基因组水平的InDel标记,并做了相应功能分类和注释,为进一步分子验证和利用提供丰富的基因资源。
- 王娟刘宇刘宇李春娟闫彩霞赵小波
- 关键词：功能分析
- 花生栽培种InDel有效标记筛选与评估被引量：4
- 2020年
- 为获得花生栽培种中有效的InDel标记,本研究基于花生简化基因组检测到的InDel信息,经PCR扩增以及电泳检测验证引物的有效性与多态性,利用生物统计学软件检测InDel标记的多态性水平。结果表明,在花生基因组上设计的39对引物在覆盖4个植物学类型的21份花生中均可获得扩增产物,其中14对引物具有多态性,为总引物数的35.9%,有3对引物位于基因编码区;Shannon指数为0.1914~1.2951,均值为0.5794;多态性信息量(PIC)为0.0907~0.6746,均值为0.3496。本研究筛选获得的InDeI标记可为花生栽培种遗传图谱构建和分子标记辅助育种提供有效的遗传标记。
- 刘宇刘宇闫彩霞李春娟孔青孔青孙全喜王娟
- 关键词：花生多态性
