刘树虎
- 作品数：6 被引量：7H指数：2
- 供职机构：新疆大学生命科学与技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金新疆维吾尔自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 和田地区维吾尔族人群线粒体DNA遗传多样性分析
- 2017年
- 目的:分析和田维吾尔族人群线粒体DNA遗传多样性。方法:运用基因芯片技术对411个(高变区Ⅰ、编码区、高变区Ⅱ)SNP位点进行了检测和分型。结果:所测411个SNP位点中83个位点发生了突变,其中A750G、A8860G、T10873C、A25326G、T16189C5个位点的突变率为100%。依据突变位点共划分出25种单倍型。其中,单倍型H2a2a、M、G2a、HV和A有较高的频率(11.36%、9.09%、6.82%、6.82%、6.82%)。52.2%的单倍型属于亚洲单倍型,47.8%的单倍型属于欧洲单倍型,不同地区维吾尔族群体线粒体DNA单倍型有较大差异。结论:和田维吾尔族mtDNA-SNP具有较丰富的遗传多样性,具有明显的亚欧混合现象。维吾尔族母系遗传库较丰富,适用于个体识别、亲子鉴定、疾病诊断。
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- 关键词：维吾尔族单倍型
- 线粒体DNA全序列揭示罗布人母系遗传结构被引量：1
- 2018年
- [目的]探知罗布人mtDNA遗传结构与遗传多样性,构建人群mtDNA遗传数据库。[方法]运用二代测序技术对164位罗布人mtDNA全序列进行检测、分型。[结果]共检出315处突变位点包含298处多态性位点,其中A263G、A750G、A4769G、A8860G、A15326G位点突变率为100%,核苷酸多样性为0.0084,平均核苷酸配对差异数目为9.4695;划分出27个单倍型,高频单倍型有:B5b2c/31.71%、H6a1b2/18.90%、D4c2a/13.41%、H9a/9.76%,单倍型多样性为0.8360,个体识别力为0.8309;主成分和邻接系统树分析显示:罗布人与维吾尔族、蒙古族、中亚人群遗传关系近,特别与维吾尔族亲缘关系最近。[结论]现代罗布人mtDNA遗传结构具有亚欧混合现象,遗传多样性丰富;单倍型主要集中在B(39.03%)、H(29.88%)、D(15.85%);mtDNA遗传结构数据可为人群在遗传进化、族源鉴定、个体识别等方面提供依据。
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- 关键词：罗布人线粒体DNA单倍型
- 应用Y染色体SNP对新疆三个隔离人群遗传多样性的研究被引量：1
- 2018年
- 克里雅人、罗布人、刀郎人是生活在我国西部边疆沙漠腹地、人口稀少的隔离人群。基于对这三个隔离人群179人Y染色体全序列的测序和分型,得到每个个体Y染色体所有突变的SNP位点和隶属的单倍群,并对各单倍群类型和频率进行了分析。以探知三个隔离人群的Y染色体遗传结构和遗传多样性。通过研究结果表明:克里雅人群检出12个单倍群,高频单倍群有J2a1b1(25.64%),R1a1a1b2a(20.51%),R2a(17.95%),R1a1a1b2a2(15.38%);罗布人群检出16个单倍群,高频单倍群有J2a1(43.75%),J2a2(14.06%),R2(9.38%),L1c(7.81%);刀郎人群检出40个单倍群,高频单倍群有R1b1a1a1(9.21%),R1a1a1b2a1a(7.89%),R1a1a1b2a2b(6.58%),C3c1(6.58%).三个隔离人群与维吾尔族、蒙古族、撒拉族亲缘关系较近;在单倍群类型和频率上与维吾尔族最接近且无显著性差异(f=0.833,p=0.367)。此外,三个隔离人群单倍群类型和频率显示明显的亚欧混合现象,经过长期基因融合使其具有中亚人群的典型特征,适用于法医遗传学。
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- 关键词：Y染色体单核苷酸多态性
- 线粒体DNA基因组全序列揭示克里雅人母系遗传结构被引量：2
- 2018年
- 目的:探知克里雅人线粒体DNA(mtDNA)遗传结构和遗传多样性,构建人群mtDNA遗传数据库。方法:运用二代测序技术对70个来自达里雅布依的克里雅人mtDNA基因组全序列进行了测序和分型。结果:70个个体共检出变异位点256处,控制区变异位点71处,编码区变异位点185,其中多态性位点245处。A263G、A750G、A4769G、A8860G、A15326G5个位点变异率为100%。界定了20种单倍型,高频率单倍型有F1a1(15.7%)、M8a2a1(12.9%)、H1t(11.4%)、M11a2(10.0%)。主成分分析结果表明:克里雅人与维吾尔族相聚的最近,与藏族和壮族相离较远,且中亚各人群相聚的较近。多态性指标显示,克里雅人π=0.1827、HD=0.9264、DP=0.9132,遗传多样性丰富。人群邻接系统进化树结果揭示,克里雅人与新疆维吾尔族人群亲缘关系最近,与藏族人群亲缘关系远。结论:克里雅人mtDNA遗传结构与维吾尔族人群最接近、亲缘关系最近,具有明显的亚欧混合现象。这与丝绸之路贸易的兴起昌盛衰落伴随着人群交流密不可分,是人群长期基因融合的结果。
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- 关键词：线粒体DNA单倍型
- 和田维吾尔族人群Y染色体遗传多样性分析被引量：2
- 2017年
- [目的]分析和田维吾尔族人群Y染色体遗传多样性及与不同人群的差异。[方法]运用基因芯片技术检测860个Y-SNP位点,挑选相关位点利用Genomestudio进行分析。[结果]共检出24种单倍群。其中,单倍群R-M207和O-M175(38.10%、14.28%)在和田维吾尔族中具有较高的频率。主成分和聚类分析显示:和田维吾尔族人群与南亚、中亚、西部欧亚人群有较近的亲缘关系;与东亚、美洲、西伯利亚人群遗传结构之间差异比较大。[结论]1和田维吾尔族Y染色体SNP突变位点多样性丰富,其中主单倍群的多样性为55%。2和田维吾尔族Y染色体的两大主单倍群:R-M207(38.10%)和O-M175(14.28%)。3和田和吐鲁番两个维吾尔族群体单倍群频率和类型十分接近无显著性差异(F=0.833,P=0.367)。4和田维吾尔族人群的单倍群频率显示明显的亚欧混合现象。
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- 关键词：维吾尔族Y染色体
- 维吾尔族人群外周血DNA提取质量因素分析被引量：1
- 2017年
- 使用改良盐析法、改良酚/氯仿法、改良碘化钾法和试剂盒法,分别对在-80℃保存1~4年的维吾尔族人群血样提取DNA,分光光度仪检测DNA浓度和纯度,0.8%琼脂糖电泳检测,提取的DNA质量采用单因素方差分析比较。结果表明,改良碘化钾法提取DNA质量最好,其次是试剂盒法、酚/氯仿提取法,盐析法提取质量最差;冻存1~4年的血样提取的DNA浓度之间差异极显著(F=618.011,P=0.000),冻存1~4年的血样提取的DNA纯度之间差异极显著(F=27.090,P=0.000)。该研究基于经济实惠、方便操作,提取DNA质量的高低可以确定改良碘化钾法提取DNA质量最好;血样本冻存(-80℃)超过3年对提取的DNA质量有显著的影响。
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- 关键词：维吾尔族人群DNA提取单因素方差分析
