李秋莹
- 作品数：2 被引量：1H指数：1
- 供职机构：中国科学院海洋研究所更多>>
- 发文基金：国家海洋公益性行业科研专项国家自然科学基金国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 海带甘露醇-2-脱氢酶基因及应用
- 本发明属于分子生物学技术领域，涉及一种海带甘露醇-2-脱氢酶基因及应用。海带甘露醇-2-脱氢酶(M2DH)基因具有序列表SED IQ No.1中的碱基序列。M2DH基因的编码蛋白具有序列表SED IQ No.2中氨基酸序...
- 段德麟邵展茹张朋艳李秋莹姚建亭
- 文献传递
- 海带转录组SSR序列特征及其相关基因功能分析被引量：1
- 2016年
- 对海带（Saccharina japonica）转录组测序数据进行分析,从70 497条Unigenes中共检测到9 237个简单序列重复（SSR）位点,并对包含SSR序列的Unigenes进行功能注释。海带转录组中SSR的类型十分丰富,其中单核苷酸和三核苷酸重复SSR的数量最多,分别占SSR总数的40.9%和39.4%,其次为四核苷酸、二核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复,分别占SSR总数的9.8%,6.1%,3.1%和0.7%。SSR重复单元类型共有147种,其重复次数的范围为5～70次。功能注释发现约50%含有SSR的Unigenes获得了注释信息,并且大多数与已知蛋白有同源性。COG、GO功能分类结果均表明,大量含有SSR序列的基因与多种生物功能有关,其中与碳水化合物代谢及参与细胞组成相关的基因数量最多。本研究结果为深入开发功能性SSR标记奠定基础,也为开展海带分子标记辅助选育提供支持。
- 李秋莹张杰姚建亭王秀良段德麟
- 关键词：转录组
