白敏
- 作品数：10 被引量：39H指数：3
- 供职机构：教育部更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金陕西科技大学研究生创新基金陕西省自然科学基金更多>>
- 相关领域：理学医药卫生天文地球更多>>
- R基团搜索技术用于HIV-1逆转录酶抑制剂的分子设计被引量：5
- 2016年
- 本文采用基于R基团搜索技术的Topomer CoMFA方法对41个人类免疫缺陷病毒(HIV-1)逆转录酶抑制剂进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)分析。所得优化模型的拟合、交互验证及外部验证的复相关系数分别为0.995、0.859和0.945。采用Topomer Search技术对ZINC数据库进行R基团的虚拟筛选,得到R贡献高的基团,以活性最高的13号分子为模板进行过滤得到1个Ra基团和20个Rb基团。并以此设计得到20个新化合物分子,其中有19个化合物的预测活性值高于13号分子。研究结果表明,所建立的Topomer CoMFA模型具有良好的稳定性和预测能力,基于R基团的Topomer Search技术可以有效筛选并设计出新的HIV-1逆转录酶抑制剂,为抗艾滋病新药设计提供了理论依据。
- 仝建波白敏赵翔常佳
- 关键词：逆转录酶抑制剂定量构效关系新药设计
- 基于网络药理学探讨黄芪建中汤对胃溃疡的保护作用及机制研究被引量：20
- 2020年
- 目的:基于网络药理学预测和动物模型验证的方法,探讨黄芪建中汤对胃溃疡的保护作用及机制研究。方法:基于网络药理学预测得到黄芪建中汤治疗胃溃疡的可能作用靶点和通路,采用综合造模法(苦寒泻下法+改良obake法+饥饱失常法)复制脾胃虚寒型胃溃疡大鼠模型,黄芪建中汤水煎液灌胃干预,持续治疗21 d。观察大鼠一般生存状况、胃组织病理改变,同时采用蛋白免疫印迹法(WB)以及实时荧光定量PCR法(RT-PCR)对预测结果中相关度最高的三个靶点进行基因以及蛋白含量的测定。结果:预测黄芪建中汤主要活性成分36种,"黄芪建中汤-胃溃疡"共享靶点59个。GO生物功能注释表明共享靶点主要富集于蛋白磷酸酶结合、泛素样蛋白连接酶结合、激活转录因子结合等20个关键生物过程,而KEGG富集分析表明共享靶点与Endocrine resistance、MAPK signaling pathway、HIF-1 signaling pathway、ErbB signaling pathway等8条信号通路密切相关。动物模型验证结果:与空白对照组比较,模型对照组大鼠一般生存状况相对较差,胃组织白介素-6(IL-6)、蛋白激酶B(AKT)、半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶-3(Caspase-3)基因蛋白表达水平明显上调(P<0.05);与模型对照组比较,黄芪建中汤能够显著改善大鼠一般生存状况,促进溃疡周围组织的再上皮化,进而迁移覆盖溃疡部位,不同程度降低胃组织中IL-6、AKT、Caspase-3基因、蛋白表达水平,其中尤以黄芪建中汤16 g/kg组明显(P<0.05)。结论:黄芪建中汤对于脾胃虚寒型胃溃疡模型大鼠胃损伤具有显著保护作用体现了中药多成分-多靶点-多途径的特点,其促进胃黏膜修复的具体机制可能与降低炎性因子表达、平衡氧化/抗氧化反应、抑制细胞凋亡等多个因素有关。
- 白敏白敏段永强杨晓轶王强王强马骏
- 关键词：黄芪建中汤胃溃疡白介素-6蛋白激酶半胱氨酸
- “诸病通用药”的体例构建及辨治模式探析
- 2024年
- 《本草经集注》序录中的“诸病通用药”以其独特的“病-药”纲目体例及其临床实用性,受到医家追捧推崇,而被后世本草学著作和方书收录及发挥,为“专病专方”“专病专药”的研究与发展奠定了基础。陶弘景以《神农本草经》之“大病之主”为基础框架,以《伤寒杂病论》之方药为参考,以自身及他医用药经验为扩充创建了“诸病通用药”体例,将当时具有代表性的病症与药物主治之长进行联系、归纳和总结,创建了“病-药”纲目体例。“诸病通用药”体例的构建开辟了“专病专方”“专病专药”的先河,为临床辨治提供新的组方思路。
- 季文达马骏肖正白敏杨晓轶李应存
- 关键词：专病专方本草经集注
- 一种新的K⁃SVD字典学习地震数据去噪方法被引量：1
- 2023年
- 地震数据去噪是地震资料处理的关键步骤之一,高信噪比的数据是后续高质量处理和解释的基础。目前,已推出多种类型的去噪方法,其中稀疏表示方法虽具有利用较少的基本信号的线性组合表示大部分或者全部的原始信号,即充分挖掘数据中含有的信息,最大化利用数据的优点,但用于稀疏表示的K⁃SVD字典学习算法存在去噪结果损失了部分原始信号和计算效率不太理想等问题。为了进一步优化解决这些问题,研发了一种新的用于地震数据去噪的K⁃SVD字典学习方法。首先,从样本数据中提取随机位置的块,并删除空白块,初始化字典;然后,进行字典学习,自适应地由地震数据本身特征构造出稀疏表示数据的最新字典;最后,利用学习到的字典对含噪地震数据分块进行去噪,对去噪后的块取平均处理再重构图像块得到去噪图像,完成地震数据的去噪。合成数据和实际数据的试验结果表明:所提K⁃SVD字典学习算法的去噪效果与当前用于稀疏表示的K⁃SVD字典学习算法相比,在信噪比、计算时间以及地震数据局部特征保持方面更有优势。
- 周子翔吴娟袁成白敏白敏
- 关键词：压缩感知字典学习
- R基团搜索技术用于2-氨基-6-磺酰苯甲腈衍生物的分子设计
- 2015年
- 艾滋病对人类的健康构成了很大的威胁,因此,抗艾滋病药物的研究设计成为了当今社会的重要任务之一.本文采用基于R基团搜索技术的Topomer CoMFA方法,对60个2-氨基-6-磺酰苯甲腈衍生物分子进行了三维定量构效关系分析.所得优化模型的拟合、交互验证及外部验证的复相关系数分别为0.851、0.601和0.671;并采用Topomer Search技术对ZINC数据库进行R基团的虚拟筛选,最终得到5个Ra基团和2个Rb基团,并设计出了10个新化合物.研究结果表明:所建立的Topomer CoMFA模型具有良好的稳定性和预测能力;基于R基团的Topomer Search技术可以有效地筛选并设计出新的化合物,这为抗艾滋病新药设计提供了依据.
- 仝建波白敏赵翔常佳
- 关键词：定量构效关系新药设计
- 参七糖络丸激活Nrf2/HO-1/NQO1信号通路改善2型糖尿病小鼠骨骼肌氧化应激损伤被引量：1
- 2024年
- 目的:基于核因子E_(2)相关因子2(Nrf2)/血红素氧合酶-1(HO-1)/醌氧化还原酶1(NQO1)通路探讨参七糖络丸对2型糖尿病小鼠骨骼肌氧化应激损伤的干预作用及机制。方法:选取SPF级7周龄雄性db/db小鼠60只适应性饲养1周,按随机数字表法分为模型组、参七糖络丸低、中、高剂量组(19、38、76 g·kg^(-1)))和二甲双胍组(0.26 g·kg^(-1))灌胃,每组12只,另选12只同周龄雄性db/m小鼠为空白组。连续干预8周。检测小鼠空腹血糖(FBG);采用酶联免疫吸附测定法(ELISA)检测空腹血清胰岛素(FINS)水平,计算稳态模型胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)、胰岛素敏感指数(HOMA-ISI);口服葡萄糖耐量实验(OGTT)、胰岛素耐量实验(ITT);生化试剂盒检测骨骼肌组织超氧化物歧化酶(SOD)、谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)活性及丙二醛(MDA)、还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADPH)含量;苏木素-伊红(HE)染色观察各组小鼠骨骼肌组织病理学改变;免疫荧光法(IF)检测骨骼肌组织中活性氧(ROS)及4-羟基壬烯醛(4-HNE)水平;蛋白免疫印迹法(Western blot)检测骨骼肌组织中Nrf2、HO-1、NQO1、谷氨酸-半胱氨酸连接酶催化亚基(GCLC)蛋白的表达水平。结果:与空白组比较,模型组小鼠FBG、FINS、HOMA-IR均明显升高(P<0.05),HOMA-ISI降低(P<0.05);OGTT、ITT结果显示,小鼠血糖在各时间节点均明显升高(P<0.05),糖耐量和胰岛素耐量明显受损;骨骼肌组织中SOD、GSH-Px活力明显降低(P<0.05),MDA、NADPH含量明显升高(P<0.05);骨骼肌组织肌纤维排列疏松,细胞核紊乱,见炎细胞浸润;骨骼肌组织中ROS、4-HNE表达水平明显升高(P<0.05);骨骼肌组织中Nrf2、HO-1、NQO1、GCLC蛋白表达水平明显降低(P<0.05)。与模型组比较,二甲双胍组FBG、FINS、HOMA-IR均明显降低(P<0.05),HOMA-ISI升高(P<0.05);OGTT、ITT结果显示,二甲双胍组小鼠血糖在各时间节点均明显降低(P<0.05);骨骼肌组织中SOD、GSH-Px活性明显升高(P<0.05),MD
- 裴晓丽梁永林段永强朱向东宋冰白敏赵芸慧赵思晨刘中唐苏蓓蓓
- 关键词：2型糖尿病胰岛素抵抗骨骼肌
- 从“天人合一”考辨五脏苦欲补泻理论被引量：2
- 2023年
- 五脏苦欲补泻理论是五行归属思维下运用五行生克理论,依五脏生理特性之欲、病理状态之苦,假借药物之味调节人体脏气平和而衍生的用药理论及组方配伍原则,体现了中医的“天人合一”整体观。《辅行诀五脏用药法要》与《黄帝内经》中的五脏苦欲补泻理论体例相近,或因《黄帝内经》于流传过程中失其原貌而致二书内容及内涵上有着明显差异,使得学界对此众说纷揉。故文章基于“天人合一”整体观,从“五行-五味-五脏”之间的关系对五脏所欲的补、泻之味以及五脏所苦的急食之味进行考辨,以期溯本清源、阐明五脏苦欲补泻之理及规律。
- 季文达马骏肖正白敏杨晓轶李应存
- 关键词：天人合一黄帝内经
- HIV-1逆转录酶抑制剂的3D-QSAR和分子对接研究被引量：3
- 2016年
- 采用分子对接和三维定量构效关系研究了二芳基苯胺衍生物与HIV-1非核苷类逆转录酶的相互作用,并运用经典的三维全息原子场作用矢量的方法(3D-HoVAIF)和多元线性回归方法(MLR)研究了药物分子的化学结构与生物活性之间的关系.MLR建模得出的复相关系数(R_(cum))为0.949、留一法交互校验复相关系数(QCV)为0.799,从该结果可以看出,三维定量构效关系对化合物的抗艾滋病活性具有比较好的预测能力.最后,运用分子对接研究了小分子药物和大分子HIV-1逆转录酶的氨基酸活性残基之间的结合模式,对今后设计合成新的抗艾滋病药物具有很好的指导作用.
- 仝建波吴英纪白敏
- 关键词：HIV-1逆转录酶三维定量构效关系多元线性回归分子对接
- 基于新型氨基酸描述符SVICE对肽类药物进行QSAR研究被引量：5
- 2014年
- 采用20种天然氨基酸的47个information indices描述符、33个connectivity indices描述符和44个eigenvalue-based indices描述符分别进行主成分分析,得出一种新的氨基酸描述符-SVICE.将其分别对三肽血管收缩素转化酶(ACE)、抗菌十八肽(AMP)、苦味活性二肽(BTT)序列表征后,建立结构与活性的SMR-MLR模型,并采用内外部双重验证的方法检验模型的稳定性.所建模型相关统计参量如下:复相关系数(Rcum2)、留一法(LOO)交互校验复相关系数(RCV2)和外部样本校验复相关系数(Qext2)分别为0.988,0.964,0.985;0.990,0.970和0.855;0.949,0.887,0.830.结果表明,运用SVICE描述符建立的MLR模型拟合、预测能力均较好,能较好解释肽类药物的活性与结构间的关系从而为新的强活性肽类药物的分子设计和改造提供了指导.
- 仝建波常佳赵翔白敏
- 关键词：氨基酸定量构效关系多元线性回归
- 5,6-二氢-2-吡喃酮作为HIV-1蛋白酶抑制剂的3D-QSAR和对接研究被引量：2
- 2017年
- 本文采用分子对接法研究了24个5,6-二氢-2-吡喃酮衍生物与HIV-1蛋白酶的相互作用,并采用三维定量构效关系(3D-QSAR)研究了药物分子化学结构和生物活性之间的关系.最终得到模型的复相关系数(R_(cum)~2)为0.961、留一法交互校验复相关系数(Q_(cv)~2)为0.897,外部交互验证复相关系数(Q_(ext)~2)为0.880,从结果可以看出三维定量构效关系对化合物的抗艾滋病活性具有比较好的预测能力.然后通过分子对接研究了配体小分子和HIV-1蛋白酶活性氨基酸残基之间的结合模式,这些信息对于以后设计合成新的抗艾滋病药物具有一定的指导作用.
- 仝建波吴英纪白敏占培
- 关键词：定量构效关系分子对接
