陶国翔
- 作品数:5 被引量:10H指数:3
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- 发文基金:天津市卫生局科技基金更多>>
- 相关领域:理学生物学更多>>
- 木质素降解产物用于漆酶-介质体系的结构理论研究被引量:3
- 2017年
- 为从天然产物中寻找廉价、低毒、高效的漆酶新介质,利用分子模型和分子对接技术在分子水平研究木质素降解产物在漆酶-介质体系中与漆酶活性位点的结合模式与反应能力,以探明其结构特征。结果表明,10种木质素降解产物小分子介质酚羟基邻位取代基可保持与漆酶作用过程中介质构象的稳定,邻位取代基的给电子能力可增强介质自由基中间体的稳定性,介质酚羟基对位取代基的吸电子性有利于加强与Phe265间的π-π堆积作用,但对位取代基吸电子性过强反而不利于提高介质反应活性及苯氧自由基稳定性。该研究为新介质的发现及介质结构的改造与修饰奠定了理论基础与研究方向。
- 陶国翔李爱秀刘子泉张敏罗力
- 关键词:漆酶介质分子对接结构特征
- 漆酶-介质-有机磷酸酯毒物三元复合物的分子作用机制
- 2017年
- 【目的】构建漆酶-介质-有机磷酸酯毒物三元复合物(laccase-meidator-organophosphate poison ternary complex,LMO)模型,在分子水平探究漆酶-介质体系(laccase-mediator system,LMS)对有机磷酸酯毒物(organophosphate poisons,OPs)的降解机制。【方法】基于分子对接建立LMO模型,通过分子动力学模拟,考察三元体系稳定性和动态研究LMS对OPs的降解机制。【结果】在LMO中,介质结合于漆酶活性位点内部,与Asp206产生氢键作用,与中性氨基酸产生疏水作用和π-π堆积作用;介质首先生成介质中间体,进而与结合于漆酶活性位点外缘的OPs发生相互作用;分子动力学模拟发现,三元复合物达到稳定时漆酶构象发生了突变,电子受体His458远离了Ⅰ型铜离子(type-1 copper ions,T1Cu)。【结论】LMS对OPs的降解是通过漆酶的疏水作用及介质中间体完成的;LMO作用过程中漆酶的构象变化利于促进漆酶与介质间的电子传递,更有利于OPs的降解。
- 陶国翔李爱秀刘子泉张敏罗力
- 关键词:漆酶介质分子对接
- 漆酶-介质体系中介质的研究进展及应用被引量:5
- 2017年
- 漆酶是一种多铜氧化酶,利用铜离子特性催化氧化底物,消耗氧分子最终生成水,其特征底物为酚类、芳胺类等物质。由于漆酶氧化电势较低、空间阻碍等因素限制了其应用范围。后来研究者发现,在漆酶中加入一类小分子物质在一定程度上拓宽了其作用底物范畴,且提高了其催化效率。加入的小分子称为"介质",漆酶与介质共同构成漆酶-介质体系(LMS)。目前,LMS在环保、纺织、造纸等领域显示出潜在的应用价值。本文将对近年来LMS中介质的结构特点、作用方式、催化机制及其应用等多方面的研究进展进行综述。
- 陶国翔李爱秀罗力张敏战丽封加栋
- 关键词:漆酶介质
- 漆酶与ABTS间的结合模式与作用机制研究被引量:3
- 2017年
- 选择常见的电子转移介质2,2′-连氮基-双(3-乙基-苯并二氢噻唑啉-6-磺酸)(ABTS)为研究对象,通过探究漆酶与ABTS之间的结合模式,在分子水平上揭示两者的相互作用机制,为发掘漆酶新介质、拓宽漆酶应用范围奠定理论基础。首先,基于分子对接建立变色栓菌漆酶-ABTS复合物模型;然后,与枯草芽孢杆菌漆酶-ABTS复合物晶体结构进行对比,综合两复合物结合特点,在分子水平上阐明漆酶与ABTS间的作用机制。结果表明,ABTS结构中的富电子基团深入活性位点,且靠近电子接收位点组氨酸;漆酶活性位点内多个中性氨基酸与ABTS发生疏水作用,稳定结合构象;最终在漆酶作用下ABTS生成阳离子中间体发挥介导作用。
- 陶国翔李爱秀张敏刘子泉
- 关键词:漆酶ABTS分子对接
- 基于分子对接技术研究漆酶与介质间的结合模式与相互作用机制被引量:4
- 2016年
- 为深入研究漆酶-介质体系中漆酶与介质间的相互作用,基于分子对接技术计算模拟了变色栓菌漆酶与5种典型介质之间的结合模式,并在分子水平阐明了漆酶与介质的相互作用机制。结果表明,漆酶活性位点的Leu164、Asn264、Phe265、Gly392、Ala393、Ile455等氨基酸残基与介质发生疏水作用,Asp206与介质中的羟基发生氢键作用;漆酶与介质作用时His458远离了T1Cu,对漆酶氧化电势的提高具有较大贡献。为漆酶与介质结构的进一步改造以及从天然资源中挖掘新介质提供了理论指导。
- 陶国翔李爱秀封加栋张敏战丽
- 关键词:漆酶介质分子对接