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严晓华
作品数:
2
被引量:17
H指数:1
供职机构:
南京工业大学理学院
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相关领域:
生物学
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合作作者
邵建峰
南京工业大学理学院
邵伟
南京工业大学电子与信息工程学院
刘国庆
南京工业大学理学院
赵剑
南京工业大学理学院
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刘国庆
传媒
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南京工业大学...
年份
2篇
2012
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不同DNA序列映射对频谱3-周期性的影响
2012年
DNA符号序列经过数值映射后其数字序列所具有的频谱3-周期性被认为是用来区分编码区和非编码区的一个重要特征。将常见映射分为4类,讨论了各类映射之间的关系;使用Parzen窗口密度估计法确定不同映射下的3-周期信噪比阈值,并利用在该阈值下的分类正确率指标对不同映射进行了评价;依据移动序列信噪比曲线给出敏感性、非震荡性2种指标,比较了不同映射在利用3-周期性进行基因编码区域识别上的优劣性。
邵建峰
邵伟
严晓华
赵剑
关键词:
基因识别
敏感性
DNA序列信号3-周期特性
被引量:17
2012年
在利用离散傅里叶变换(DFT)对数值化映射后的基因序列进行频谱分析中,DNA序列信号频谱3周期性被认为是用来区分编码区和非编码区的一个重要特征。给出推广后的频谱信噪比(SNR)定义,该定义具有更广的适用性并且适合快速计算;对不同种类生物基因的编码和非编码区域的信噪比进行计算和统计分析,在此基础上提出3种分类阈值确定方法;对影响信噪比和阈值确定的因素。
邵建峰
严晓华
邵伟
刘国庆
关键词:
功率谱
信噪比
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