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刘京: 作品数：42 被引量：78H指数：6; 供职机构：公安部物证鉴定中心更多>>; 发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目更多>>; 相关领域：政治法律医药卫生自动化与计算机技术生物学更多>>

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东亚三族群SNP高分辨推断模型构建与效能评估被引量：3: 2021年; 单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)是法医遗传学个体识别和族群推断常用的遗传标记.本研究集合文献和公共库中祖先信息SNP位点(ancestry informative SNPs,AISNPs),应用softmax回归、支持向量机和随机森林3种算法,研究东亚北方的3个主体人群(中国北方汉族人、日本人和韩国人)的族群推断效果.我们分析了来自千人基因组计划的103份中国北方汉族人样本、104份日本人样本和亚洲多样性计划的100份韩国人样本的428个AISNP位点分型,采用多元线性回归共线性诊断筛选出67个高信息量的AISNPs位点组合,构建了softmax回归和支持向量机算法的两种族群推断模型,采用随机森林平均降准分析筛选出42个高信息量的AISNPs位点组合,并构建了随机森林算法的族群推断模型,将softmax回归、支持向量机与随机森林3种模型用于北方汉族人、日本人、韩国人的族群推断,五次十折交叉验证(training∶testing=9∶1)测试3种模型的平均准确率分别为95.19%、95.77%、94.53%.本研究建立的3种族群推断模型均可用于东亚北方三大人群的遗传推断,42 AISNPs组合的位点数目较少,更适于构建法医检测体系,具有较高的实际应用价值.; 文豪魏以梁郭晓媛孙昌春薛思瑶刘京范虹江丽; 关键词：法医遗传学支持向量机

DNA供者族群推断技术在案件中的应用被引量：2: 2019年; 对于涉外、跨区域流窜犯罪等案件,将现场遗留的生物物证作特征刻画能够为判断侦查方向提供科学依据。利用27-plexSNP族群推断体系及分析流程(能够对来自东亚、欧洲、非洲及其混合人群的DNA样本进行分型检测从而可推断其生物供体的族群来源),本文对一起案件中的死者进行了族群来源推断与分析,为案件破获提供了帮助。; 江丽赵蕾刘京赵雯婷马泉赵慧季安全李彩霞; 关键词：法医遗传学 SNP

一种用于辅助推断肤色的方法及其专用引物组: 本发明公开了一种用于辅助推断肤色的方法及其专用引物组。本发明提供了提供特异引物组，由如下108种引物组成：序列表的序列1所示引物至序列表的序列108所示的引物。本发明基于以中国人群为主、欧非人群为辅的样本结构，建立了定量...; 赵雯婷李彩霞江丽刘京孙亚男; 文献传递

用于五大洲际人群区分的SNP体系研究被引量：5: 2018年; 目的:建立针对五大洲际人群(东亚、欧洲、非洲、大洋洲和美洲)的常染色体SNP复合检测体系,验证评价其人群区分效能。方法:从The Global AIMs Nano set中筛选出28个SNP位点进行复合检测体系的构建,用该体系检测来自16个人群的712份样本,检测结果和千人基因组中的20个人群和CEPH库中的2个人群合并共计2 804份个体的分型数据,采用聚类分析方法和主成分分析方法进行体系效能评价。选取祖先成分大于90%的样本构建参考人群分型库,对140份个体样本进行群体匹配概率、个体主成分分析等人群来源推断,评估该体系在实际样本的人群来源区分能力。结果:该体系不仅能对五大洲际人群进行区分,而且对混合人群也有一定区分能力,对已知来源样本的祖先成分和人群匹配分析结果显示与其来源信息一致。结论:该体系能够实现对欧洲、东亚、非洲、美洲、大洋洲以及混合人群的区分,并能够推断个体祖先来源成分组成,在实际检案中可以进行推广应用。; 郝伟琪刘京江丽黄美莎李玖玲马泉刘超刘超李彩霞; 关键词：法医遗传学 AIMS 复合扩增

基于全基因组测序的法医单核苷酸多态性系谱推断研究: 2023年; 目的通过全基因组测序(whole genome sequencing,WGS)获得高密度单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)分型数据,评估分型准确性,研究建立WGS数据用于法医SNP系谱推断的方法。方法通过华大MGISEQ-200RS测序平台对样本进行深度为30×的WGS,从测序数据中提取Wegene GSA芯片中的645199个常染色体SNP位点,质控过滤后运用IBS/IBD算法计算预测亲缘关系,并对样本的族群来源进行分析。结果从测序数据中提取的SNP分型与Wegene GSA芯片分型的一致率大于99.62%。测序获得的SNP数据使用IBS算法可预测1~4级亲缘关系,4级亲缘预测置信区间准确性达100%,使用IBD算法可预测1~7级亲缘关系,7级亲缘预测为有亲缘关系的准确性达100%,通过高深度WGS数据获取的SNP系谱推断能力与芯片预测结果无显著差异。同时,WGS数据用于族群推断与调查结果一致。结论WGS技术可应用于法医SNP系谱推断,为案件侦破提供线索。; 谢全桂虚赵雯婷方之晓徐景怡刘京李彩霞; 关键词：单核苷酸多态性全基因组测序亲缘关系

基于二代测序技术检测X-STR基因座的试剂盒及其专用引物组合: 本发明公开了基于二代测序技术检测X‑STR基因座的试剂盒及其专用引物组合。本发明提供的引物组合，由序列表中序列1至序列32所示的32种DNA分子组成。实验证明，采用本发明提供的基于二代测序技术检测X‑STR基因座的试剂盒...; 季安全王乐叶健余政梁刘京武波吴浩; 文献传递

一种在27个群体中识别中国青藏高原藏族群体个体的方法和系统: 本发明提供一种在27个群体中识别中国青藏高原藏族群体个体的方法和系统，所述方法包括提取个体的DNA；获得所述DNA的87个藏族特异高原适应SNP位点的基因型；将所述各特异性位点的基因型利用STRUCTURE软件获得所述个...; 江丽李彩霞赵雯婷刘京黄美莎

一种对男性个体进行Y-SNP分型的方法和系统: 本发明提供一种对男性个体进行Y‑SNP分型的方法和系统，该方法包括获得所述男性个体的DNA，获得所述DNA 10个Y‑SNP位点的基因型，所述10个Y‑SNP位点为M130，M174，M89，M201，M304，M9，M...; 江丽李彩霞赵雯婷刘京赵蕾; 文献传递

对未知关系个体进行系谱推断的自动分析系统被引量：1: 2022年; 基于短串联重复序列(short tandem repeat,STR)和单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)的亲缘关系推断在群体遗传学、法医学等领域应用广泛,但目前没有成熟的系统可以实现针对STR数据和SNP数据的自动批量化处理。为弥补这一空白,项目组开发了一款基于STR数据和SNP数据的DNA系谱推断系统(DNA Genealogy Analyzer Version 1.0,DGA v1.0),该系统可运用STR和SNP亲缘关系预测算法计算未知亲缘关系群体中的所有亲缘关系。系统核心算法部分基于Python语言实现,前端部分采用HTML和CSS语言编写,整体采用Python的Flask框架开发。该系统与已有分析方法相比,结果一致性为100%,运算效率提高了800%以上,在群体遗传学等领域有重要应用价值。; 张文杰李彩霞于迪管珊珊童梦洁范虹刘京

27个常染色体AIM-SNP的筛选和验证被引量：2: 2017年; 目的构建27个常染色体AIM-SNP组合用于未知个体种族来源推断。方法通过对Hap Map数据库中描述祖先遗传信息标记的908个AIMs位点(非洲、欧洲、东亚人群)筛选,选出27个AIMs位点组合,利用相关软件同时与数据库908个AIMs不同子集合的分析进行对比,验证其推断祖先来源的可行性。结果应用本研究27个AIMs的SNP多态性分析方法可以正确推断未知样品祖先起源,估算祖先成分比例。结论本研究建立的常染色体27个AIMs的SNP多态性分析方法可准确推断来自于欧洲、非洲、东亚3大祖先血统个体的祖先来源,是SNP多态性分析用于个体种族来源推断的一种有效方法,在法医实践中可以用于DNA检验中未知DNA供者洲际人群祖先来源推断。; 魏丽魏以梁刘京江丽孙启凡王英元李彩霞; 关键词：法医物证学 AIMS

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