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胭脂鱼微卫星富集文库的构建及其应用前景展望被引量：6: 2009年; 以湖北武汉和四川宜宾人工增殖放流的胭脂鱼子一代酒精浸泡鳍条样本为材料,提取完整基因组DNA,选用人工合成的生物素标记(AAAG)7探针,采用FIASCO(fast isolation by AFLP of sequences containing repeats)磁珠富集法构建胭脂鱼(Myxocyprinus asiaticus)微卫星富集文库。以MseI-N引物组和设计合成的微卫星核心序列引物(AAAG)5,用双引物PCR法筛选含有微卫星的阳性克隆,从54个阳性克隆中共获得22个微卫星序列,其中完美型(perfect)共15个(占68.2%),非完美型(imperfect)6个(占27.3%),混合型(compound)1个(占4.5%);(AAAG/TTTC)n序列在胭脂鱼的基因组DNA中含量非常丰富。根据微卫星侧翼序列最终设计并合成了18对胭脂鱼微卫星引物,经其有效性检验后,可应用于胭脂鱼遗传多样性、种群遗传结构等进一步研究及人工增殖放流效果评估。; 杨钟史方阙延福熊美华徐念朱滨; 关键词：胭脂鱼微卫星富集文库

三峡库区长鳍吻鮈种群遗传多样性的初步研究被引量：12: 2009年; 用磁珠富集法构建了长鳍吻鮈(AAAG)n富集文库,从中分离并鉴定得到13个微卫星位点。对三峡库区重庆江段的40尾长鳍吻鮈群体进行了遗传多样性的初步研究,其中6个位点呈现多态性(1个位点为中度多态,5个位点为高度多态),等位基因数目为4～11个,观测杂合度在0.20～0.85。这些多态性位点将为长鳍吻鮈及其近缘种的种群遗传研究提供有力的遗传学资料。; 徐念史方熊美华阙延福杨钟朱滨胡菊香常剑波; 关键词：微卫星三峡库区种群遗传多态性位点

利用微卫星标记评估乌江彭水水电站对泉水鱼的遗传多样性影响被引量：16: 2009年; 乌江彭水水电站建成后形成阻隔,可能对生境连通性及坝上坝下鱼类的交流产生不利,影响到物种遗传多样性和群体遗传结构。本研究通过磁珠富集法构建了泉水鱼(Pseudogyrincheilus procheilus)微卫星文库,建立了泉水鱼微卫星DNA分子标记体系,并利用这些微卫星分子标记初步评估了乌江彭水水电站对泉水鱼的遗传多样性影响。用6对具多态性的引物对乌江中35尾野生泉水鱼样本进行遗传多样性分析,结果显示,6个位点共检测到28个等位基因;每个位点平均杂合度为0.6536,平均多态信息含量为0.6085,平均Shannon多样性指数为1.2752;卡方检验得出2个位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡,且其中1个位点中出现了无效等位基因。实验初步表明乌江流域泉水鱼的遗传多样性较为丰富,但可能受到了水电站阻隔的干扰。; 史方徐念熊美华王翔杨钟阙延福朱滨胡菊香常剑波; 关键词：微卫星标记水电站

微卫星标记分析乌江流域白甲鱼群体的遗传多样性被引量：10: 2009年; 以乌江流域白甲鱼(Onychostoma sima)为材料,构建了白甲鱼微卫星富集文库。对乌江彭水电站坝上、坝下种群进行PCR扩增,得到5个多态位点,其等位基因数目3～6;多态信息含量0.4465～0.7116;观测杂合度0.4444～0.9310;期望杂合度0.4902～0.7624;Hardy-Weinberg平衡偏离指数-0.4171～0.2380,各位点两两之间不存在显著的连锁不平衡现象。实验初步表明:乌江流域白甲鱼的遗传多样性较为丰富,但彭水水电站的建立已经对其造成了一定程度的影响。; 熊美华史方徐念阙延福杨钟胡菊香朱滨; 关键词：白甲鱼微卫星乌江流域

福尔马林固定白鲟(Psephurus gladius)标本的DNA提取及其相近种微卫星引物的适用性被引量：4: 2008年; 白鲟是是世界上最大的淡水鱼之一,为我国独有,被誉为"长江中的活化石".目前白鲟群体已极度濒危,获取其新鲜材料非常困难,因此本文以保存于中科院水生所标本馆的福尔马林固定白鲟标本为研究材料,尝试从其肌肉、心脏、鳍条和肝脏组织提取白鲟基因组DNA,并检验相近种匙吻鲟和中华鲟微卫星引物对白鲟有无适用性.实验包括福尔马林固定白鲟标本从组织预处理到消化、抽提等步骤的整体优化过程;通过一系列对比试验分析在不同条件下提取到基因组DNA片段大小的差异,最终实现了福尔马林固定白鲟标本基因组DNA的稳定提取,并提出后续实验的延伸设想加以完善.; 杨钟朱滨常剑波; 关键词：福尔马林微卫星

中华倒刺鲃微卫星标记筛选及特征分析被引量：5: 2011年; 以乌江流域中华倒刺鲃（Spinibarbus sinensis）为材料,构建了中华倒刺鲃微卫星富集文库。以乌江彭水电站所采集的32个个体的基因组DNA为模板,进行PCR扩增,结果筛选出8个多态性微卫星位点,其等位基因数4~10,多态信息含量0.6072~0.8515;观测杂合度0.5625~1.0000,期望杂合度0.6791~0.8795,Hardy中华倒刺鲃微卫星标记筛选及特征分析Weinberg平衡偏离指数-0.2009~0.3805;卡方检验结果表明,3个位点不同程度地偏离了Hardy中华倒刺鲃微卫星标记筛选及特征分析Weinberg平衡（P〈0.05）;各位点两两之间不存在显著的连锁不平衡现象。; 熊美华史方徐念阙延福杨钟胡菊香朱滨; 关键词：中华倒刺鲃微卫星多态性

长江胭脂鱼人工放流子一代遗传多样性初步研究被引量：4: 2010年; 运用微卫星分子标记对长江中、上游的80尾人工增殖放流的胭脂鱼人工放流子一代个体的遗传多样性和种群遗传结构进行了分析。用磁珠富集法构建了胭脂鱼(AAAG)n富集文库,从中分离并鉴定得到22个微卫星位点,最终设计合成18对引物。对胭脂鱼子一代进行了遗传多样性的初步研究,其中5对引物呈现多态性,等位基因数目为2～8个;多态信息含量0.2957～0.8038;Shannon多样性指数0.5466～1.8840;观测杂合度0.3056～0.7222;期望杂合度0.3658～0.8381;Hard-Weinberg遗传偏离指数(D)-0.1818～0.4287。结果表明,胭脂鱼人工放流子一代处于较高的遗传多样性水平,但很大程度上仍受到人类活动的影响。; 杨钟史方阙延福熊美华朱滨徐念; 关键词：胭脂鱼种群遗传多态性位点

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杨钟