郭瑞庭
- 作品数：16 被引量：20H指数：3
- 供职机构：中国科学院天津工业生物技术研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划江苏高校优势学科建设工程项目更多>>
- 相关领域：生物学化学工程医药卫生农业科学更多>>
- 工业应用导向的蛋白质结构与功能研究进展被引量：5
- 2022年
- 在蛋白质工程、绿色生物制造以及合成生物学等研究领域中,对重要催化反应的重塑和合成路径的优化搭建,都依赖于对相关蛋白质结构与功能的深入了解。合成生物技术近年来的飞速发展对关键菌种及生物催化过程中的蛋白质的性能提出了更高要求,相关研究的关键是获得大批量、高纯度目的蛋白,并进行快速、准确的构效关系研究。中国科学院天津工业生物技术研究所建所10年来,在工业蛋白质领域进行了多年的积累,成功搭建成了蛋白质结构生物学平台;并在植物天然产物合成相关萜类合成酶、白色污染降解的聚对苯二甲酸乙二酯(polyethylene terephthalate,PET)塑料降解酶以及生物质转化利用相关酶等方面获得了一些进展,通过对这些蛋白进行结构和功能的研究,为许多研究工作提供了理论依据。蛋白质结构功能研究相关技术的不断发展,将加速合成生物学的学术和工业应用研究,推动我国生物制造领域的科技创新升级。
- 韩旭李倩韦泓丽郑迎迎商娜陈纯琪郭瑞庭郭瑞庭刘卫东
- 关键词：蛋白质工程
- 来自于Clostridium difficile中的唾液酸醛缩酶的蛋白质晶体学研究
- 酸醛缩酶(NAL Sialic acid aldolase,EC 4.1.3.3)在生物体内可逆地催化N-乙酰-d-神经氨酸(Neu5Ac)的裂解而生成N-乙酰-d-甘露糖胺(ManNAc)和丙酮酸,从而参与糖类降解途径...
- 刘卫东陈曦崔云凤冯进辉郭瑞庭吴洽庆朱敦明
- 文献传递
- 来自于Symbiobacterium thermophilum中的内消旋-二氨基庚二酸脱氢酶的蛋白质晶体学研究
- ＜正＞氨基酸脱氢酶（EC.1.4.1.X）能催化氨基酸及其对应酮酸之间的可逆氧化脱氨和还原氨化反应,可从酮酸出发以游离氨作供体进行氨基酸的生物合成,其催化副产物为水,因此,用该酶进行氨基酸的直接手性生物合成是绿色环保并且...
- 刘卫东李哲黄骏翔陈曦张大龙郭瑞庭吴洽庆朱敦明马延和
- 文献传递
- 高活性PET水解酶突变体及其应用
- 本发明公开了高活性PET水解酶突变体及其应用。本发明提供了蛋白，为如下1)‑11)中任一种：1)所示的蛋白为将野生型PET水解酶第204位的天冬酰胺突变为丙氨酸，且将第251位的精氨酸突变丙氨酸，其他位置的氨基酸残基不变...
- 韩旭刘卫东郑迎迎高健商娜李倩韦泓丽黄建文陈纯琪郭瑞庭
- 文献传递
- 来自于Symbiobacterium thermophilum中的meso -diaminopimelate脱氢酶的晶体结构研究
- 氨基酸脱氢酶(EC.1.4.1.X)能催化氨基酸及其对应酮酸之间的可逆氧化脱氨和还原氨化反应,可从酮酸出发以游离氨作供体进行氨基酸的生物合成,其催化副产物为水,因此,利用该酶进行氨基酸的直接手性生物合成是经济且环保的方法...
- 刘卫东李哲黄骏翔陈曦张大龙郭瑞庭吴洽庆朱敦明
- 玉米赤霉烯酮水解酶耐热性的分子改造被引量：3
- 2019年
- 内酯水解酶ZHD101对玉米赤霉烯酮降解效果显著,是目前研究最广泛的玉米赤霉烯酮降解酶,但由于热稳定性较低,无法满足饲料生产制粒过程中的温度要求。作者利用理性设计和分子改造在其分子中引入二硫键,以提高ZHD101的热稳定性。通过在分子引入七对半胱氨酸双突变(A110C/P196C、S136C/R189C、D143C/P181C、S147C/P181C、D199C/A202C、L200C/A231C、R204C/G205C)以形成潜在的二硫键,研究其对热稳定性的影响。结果表明,突变体S136C/R189C和D143C/P181C在50℃加热处理2 min后的残余活性高于野生型,其中突变体D143C/P181C的残余活性是野生型的2倍,且室温下活力损失小于10%。在此基础上设计四突变(S136C/D143C/P181C/R189C),热稳定性和活力并不优于双突变D143C/P181C。本研究结果为提高ZHD101在饲料工业上的应用潜力打下了基础。
- 许中霞刘桂智刘卫东郭瑞庭李华钟郑迎迎
- 关键词：玉米赤霉烯酮热稳定性二硫键
- 金黄色葡萄球菌脱水鲨烯脱氢酶(CrtN)和DNA结合蛋白Sso7d的融合表达
- 2018年
- 分子质量相对小的DNA结合蛋白Sso7d可以帮助蛋白折叠,提高蛋白表达量并有助于晶体生长.为解决金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)脱水鲨烯脱氢酶(dehydrosqualene desaturase,Crt N)蛋白较难在大肠杆菌(Escherichia coli)中进行可溶表达的问题,借助小分子DNA结合蛋白Sso7d,将其与Crt N基因通过重叠PCR(Overlapping PCR)连接起来,连至p ET-46 Ek/LIC载体上,在大肠杆菌BL21(DE3)中进行带有6-His标签的融合表达.通过核酸电泳及序列测定进而确定所连接基因的正确性,经Ni-NTA亲和层析与凝胶过滤层析对目的蛋白进行纯化,利用聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)和免疫印迹(Western blot)对目的蛋白进行确证.通过对Crt N-Sso7d以及Sso7d-Crt N进行分析比较,发现Crt N-Sso7d的表达量较高且能得到较多高纯度蛋白,这将被用来进行后续蛋白结晶和结构解析工作.
- 赵元蕾郑迎迎郭瑞庭贾士儒刘卫东
- 关键词：DNA结合蛋白金黄色葡萄球菌纯化
- 内酯酶及利用内酯酶降解α-玉米赤霉烯醇的方法
- 本申请公开了一种内酯酶，其氨基酸序列系为将序列编号5第167个氨基酸由缬氨酸(Valine)突变成组氨酸(Histidine)的序列，该内酯酶用于提高对α-玉米赤霉烯醇的降解效率。本申请还公开了一种降解α-玉米赤霉烯醇的...
- 郭瑞庭郑迎迎许中霞陈纯琪彭卫刘卫东刘嚞睿马延和
- 文献传递
- 黑曲霉内切葡聚糖酶AnCel5A的表达纯化与晶体优化被引量：3
- 2019年
- 来源于黑曲霉(Aspergillus niger)的β-1,4-内切葡聚糖酶(AnCel5A)是糖苷水解酶第5家族成员,水解纤维素分子无定形区的β-1,4-糖苷键,在纤维素的降解过程中发挥关键作用。本研究通过对AnCel5A的结晶条件初筛,获得并优化AnCel5A晶体以期解析其蛋白质晶体结构。将截去N端信号肽的AnCel5A蛋白在Pichia pastoris X33/pPICZαA中进行表达,发酵液上清透析除盐并进行Endo H去糖基化酶切,后续依次通过离子交换层析、疏水层析,获得高纯度蛋白。通过坐滴气相扩散法对AnCel5A的结晶条件进行初筛,在CryoI screen kit (A6)孔中长出了初始晶体,经优化获得了更好的晶体。蛋白晶体于台湾新竹同步辐射中心(NSRRC)BL15A1线站进行了X射线衍射数据收集,结果显示其分辨率达到1.8?。
- 颜俊杰李玉洁郑迎迎陈纯琪郭瑞庭李华钟刘卫东
- 关键词：内切葡聚糖酶纯化
- 高活性PET水解酶突变体及其应用
- 本发明公开了高活性PET水解酶突变体及其应用。本发明提供了蛋白，为如下1)‑11)中任一种：1)所示的蛋白为将野生型PET水解酶第204位的天冬酰胺突变为丙氨酸，且将第251位的精氨酸突变丙氨酸，其他位置的氨基酸残基不变...
- 韩旭刘卫东郑迎迎高健商娜李倩韦泓丽黄建文陈纯琪郭瑞庭
- 文献传递
