齐芬芳
- 作品数：6 被引量：3H指数：1
- 供职机构：贵州大学更多>>
- 发文基金：贵州省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学文化科学环境科学与工程生物学更多>>
- 基于结构变异的香猪抗病基因的资源挖掘
- 香猪作为贵州地方特色猪种，以肉质香嫩、基因纯合、富含微量元素、纯净无污染等独特优点而著称，具有良好的经济效应。与此同时，香猪适应性好、抗病力强、耐粗饲，故而挖掘香猪的抗病基因具有重要的意义。基因组水平的结构变异能够影响基...
- 齐芬芳冉雪琴王嘉福
- 关键词：抗病基因
- 流式细胞仪在本科生“分子生物学”课程实验教学中的应用与实践被引量：2
- 2020年
- 为了能够让本科"分子生物学"实验课程更为新颖和丰富,提高大型仪器流式细胞仪的使用效率,根据分子生物学课程的实验教学特点,结合理论教学的同时,在实验课程教学中使用流式细胞仪开展细胞凋亡和细胞周期检测实验。通过实验课的开展,锻炼学生基本实验技能,为今后科研工作打下良好的实验基础。
- 牛熙李升齐芬芳
- 关键词：流式细胞仪分子生物学实验课程
- 香猪MAP3K4基因结构变异多态性和基因表达研究
- 2023年
- 基于前期比较基因组学分析,在香猪的丝裂原活化蛋白激酶激酶激酶4(mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4,MAP 3K4)基因第15内含子中发现一个189 bp的结构变异(MAP3K4-I15-sv189)。为探究该结构变异(structural variation,SV)在香猪群体中的多态性分布及其对基因表达的影响,本研究设计一对特异性引物,建立MAP 3K4基因SV的PCR检测技术,分析香猪群体中该结构变异的基因类型;采用RT-qPCR研究结构变异不同基因型之间基因的差异表达。结果显示,香猪群体中MAP3K4-I15-sv189位点存在两种基因型,DD型和ID型(D为缺失基因,I与参考基因一致),其中D等位基因的频率为97.35%;大白猪群体中检测到3种基因型,DD型、ID型和II型,D等位基因频率为80%。相比之下,香猪的D等位基因频率显著高于大白猪的相应值(P<0.05)。采用生物信息学方法分析结构变异区域得到多种剪接元件和重复元件,可能影响MAP 3K4基因的表达。比较香猪各组织中MAP 3K4基因的表达量,发现该基因在肺组织的表达量最高。进一步检测肺组织中3种结构变异类型的相对表达量,显示:DD型>ID型>II型,表明SV的缺失可能促进MAP 3K4基因的表达。本研究表明,香猪MAP 3K4的结构变异MAP3K4-I15-sv189以缺失型为主,缺失型可促进肺组织MAP 3K4基因的表达。研究结果有助于解析香猪易感肺部疾病的分子机制。
- 徐婷婷齐芬芳黄世会牛熙李升冉雪琴王嘉福谢健
- 关键词：香猪多态性
- 基于结构变异的香猪抗病基因的资源挖掘
- 香猪作为贵州地方特色猪种,以肉质香嫩、基因纯合、富含微量元素、纯净无污染等独特优点而著称,具有良好的经济效应。与此同时,香猪适应性好、抗病力强、耐粗饲,故而挖掘香猪的抗病基因具有重要的意义。基因组水平的结构变异能够影响基...
- 齐芬芳冉雪琴王嘉福
- 关键词：抗病基因
- 文献传递
- 毒死蜱降解菌腺苷酸激酶基因的分离及结构特征被引量：1
- 2011年
- 本研究以1株有机磷农药毒死蜱的降解菌施氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri)75为研究材料,从该菌基因组中克隆到腺苷酸激酶(adenylate kinase,ADK)基因。序列长810 bp,包含完整的ADK基因编码区648 bp,编码215个氨基酸组成的ADK75蛋白。经比对分析,施氏假单胞菌75的ADK基因与假单胞菌属的相应基因相似性最高达99.5%;对ADK75的二级和三级结构分析结果显示,ADK75蛋白具有典型的腺苷酸激酶结构特点,与同属的ADK蛋白相比,AMPbd结构域和LID结构域分别有3～13与5～16个氨基酸差异,这些氨基酸变化可能与施氏假单胞菌75能够以毒死蜱作为唯一碳源生长的代谢特点有关。
- 齐芬芳冉雪琴王嘉福
- 关键词：有机磷农药降解菌腺苷酸激酶基因
- 施氏假单胞菌75 mRNA差异显示PCR方法的建立
- 2013年
- 为丰富原核生物基因表达差异的研究方法,将应用于真核生物中的差异显示PCR方法应用于原核生物基因差异表达的研究,以1株有机磷农药乐果的降解菌施氏假单胞菌(Pseudomonas stutzer)75为研究材料,以5′末端依赖性的RNA外切酶(Terminator Exonuclease)降解其中的16S rRNA和tRNA,并用随机引物替代锚定引物,改良真核生物差异显示PCR,建立原核生物mRNA差异显示PCR的试验体系。以LB培养基培养的菌株为对照组,以无机盐培养基(乐果为唯一碳源)为试验组。结果表明:提取总RNA,通过5′-磷酸基团依赖的核酸外切酶降解法获得mRNA,经逆转录,用双随机引物扩增获得253个差异基因,16S rRNA、tRNA的污染较少,其中之一为硫酸盐运输蛋白基因。
- 颜穗冉雪琴王嘉福齐芬芳
- 关键词：施氏假单胞菌
