周丽霞 作品数:35 被引量:115 H指数:6 供职机构: 中国热带农业科学院椰子研究所海南省热带油料作物生物学重点实验室 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 海南省自然科学基金 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 经济管理 轻工技术与工程 更多>>
油棕Aux/IAA基因家族鉴定与生物信息学分析 被引量:3 2021年 Aux/IAA基因家族是植物激素生长素(Auxin)早期反应的三大家族之一,研究Aux/IAA基因家族有利于深入探讨生长素信号转导分子机制,而油棕Aux/IAA基因家族的全基因组分析尚无报道。本研究利用生物信息学方法在油棕中鉴定到55个Aux/IAA家族基因,染色体定位分析表明其中50个分布在油棕的除第5、第13、第14、第15染色体外的不同染色体上;聚类分析将油棕Aux/IAA分为A、B两大类群,8个亚族;分析油棕Aux/IAA基因的表达模式,表明其Aux/IAA基因家族不同亚族基因的表达模式存在较大差异,其中一些基因可能与油棕的授粉受精过程相关。本研究将为油棕Aux/IAA基因家族各基因的具体功能研究提供一定的理论依据,并对油棕育种研究和高产栽培提供一定的参考。 杨蒙迪 金龙飞 周丽霞 窦雅静 曹红星 李新国关键词:油棕 生物信息学 油棕EgNAC 33基因的克隆与逆境响应表达分析 被引量:3 2020年 应用RT-PCR及RACE技术,克隆了油棕抗逆相关基因EgNAC 33的全长cDNA;应用生物信息学方法对其氨基酸序列进行了分析,同时采用qRT-PCR分析了低温、干旱及高盐胁迫处理后EgNAC 33的响应表达情况。结果表明:克隆获得的基因EgNAC 33的cDNA全长为1952 bp,含1个长约735 bp的开放阅读框,编码245个氨基酸,该基因编码的蛋白与椰子NAC蛋白的同源性最高;EgNAC 33基因受低温及高盐胁迫的诱导,其中,在8℃条件下胁迫8 h时的表达量最高,在高盐条件下胁迫24 h时的表达量最高;但在干旱胁迫下,EgNAC 33的表达量基本上不受影响。 周丽霞 曹红星关键词:油棕 生物信息学 逆境胁迫 GC-MS分析不同品种油棕果肉中的脂肪酸组分 被引量:8 2019年 [目的]分析4个品种油棕果肉中的脂肪酸组分,为棕榈油品质改良提供参考依据。[方法]以4个品种的新鲜油棕果为试验材料,参考国家标准GB/T 14772 2008提取果肉脂肪酸,利用氢氧化钾的甲醇溶液对脂肪酸进行甲酯化处理,再应用气相色谱质谱联用技术(GC-MS)分析其脂肪酸组分,同时测定油脂营养成分。[结果]4个品种油棕果肉中脂肪酸种类相同,但成分含量所占比例不同。LS30果肉中棕榈酸含量所占比例最高(53.00%),油酸含量比例最低(22.56%);SJ64果肉中棕榈酸含量比例最低(43.94%),油酸和亚油酸含量比例最高(33.24%和7.10%)。4个品种油棕果肉脂肪酸组分中,棕榈酸平均含量所占比例高达48.47%,变异系数为0.05;其次为油酸,平均含量所占比例为27.90%,变异系数为0.08。脂肪酸组分中,月桂酸与肉豆蔻酸呈显著正相关(相关系数| r |=0.90~1.00,下同),其相关系数为0.90,与其他4种脂肪酸均呈负相关;棕榈酸与油酸呈显著负相关,其相关系数为-0.93,与亚油酸呈较大的负相关性,相关系数为-0.81,与月桂酸和肉豆蔻酸呈负相关,与硬脂酸呈正相关。对油棕果肉油脂各营养成分进行方差分析,发现品种间α-维生素E含量存在显著差异(P<0.05,下同),角鲨烯和β-谷甾醇存在极显著差异(P<0.01)。通过多重比较分析,α-维生素E含量在品种SD60和XJS30间无显著差异(P>0.05),在SJ64和LS30间存在显著差异;角鲨烯和β-谷甾醇含量在4个品种间均存在显著差异。[结论]4个品种油棕果肉中均含有不饱和脂肪酸(油酸和亚油酸),其中SJ64果肉中的油酸、亚油酸,以及油脂营养成分α-维生素E和β-谷甾醇含量均最高,具有较高的营养开发价值,为今后棕榈油品质改良提供材料参考。 周丽霞 雷新涛 曹红星关键词:油棕 甲酯化 低温胁迫下油棕WRKY转录因子基因的表达特性分析 被引量:10 2018年 【目的】研究低温胁迫下WRKY转录因子基因表达特性,并分析其与油棕抗寒性的相关性,为阐明WRKY转录因子在油棕生长和低温响应机制中的功能和作用提供理论参考。【方法】以油棕品种XJS30和SJ64为材料,对其进行低温驯化处理(0 h、1 d和7 d)及冷处理(10℃4 h、8℃4 h、6℃4 h、4℃4 h和2℃4 h),利用实时荧光定量PCR(qPCR)检测不同处理时间的WRKY1、WRKY7、WRKY22、WRKY40和WRKY55基因表达特性,并分析其与油棕抗寒性的相关性。【结果】WRKY1和WRKY7基因在低温驯化结束时的表达量较冷处理结束时高,说明其在低温驯化过程中对XJS30的抗寒性构成发挥调控作用。WRKY22、WRKY40和WRKY55基因均在XJS30冷处理中表达量最高,说明其在冷处理过程中对XJS30的抗寒性发挥调控作用。WRKY1基因在低温驯化结束时的表达量较冷处理结束时低,说明其在冷处理过程中对SJ64的抗寒性发挥调控作用。WRKY7基因在低温驯化结束时的相对表达量较冷处理结束时高,说明其在低温驯化过程中对SJ64的抗寒性构成发挥调控作用。【结论】油棕的WRKY1、WRKY7、WRKY22、WRKY40和WRKY55基因均属于低温应激反应型基因。 周丽霞 曹红星关键词:油棕 WRKY转录因子 低温胁迫 海水胁迫对椰子幼苗生理特性的影响 被引量:4 2018年 【目的】探讨海水胁迫对5个品种椰子幼苗生理指标的影响,为耐盐性椰子品种选育和推广种植提供参考依据。【方法】分别用质量浓度为1.7‰、2.3‰、3.4‰和6.8‰的海水浇灌文椰78F1、文椰2号、文椰3号、文椰4号和马哇椰子种果进行育苗,测定分析其种果的发芽率、发芽势及幼苗的细胞膜透性、丙二醛(MDA)含量、游离脯氨酸(Pro)含量、超氧化物歧化酶(SOD)活性和过氧化物酶(POD)活性。【结果】随着海水质量浓度的增加,椰子种果的发芽势和发芽率逐渐降低,幼苗叶片的细胞膜透性逐渐变大,Pro和MDA含量及SOD和POD活性呈上升趋势。其中,与CK(自来水)相比,在2.3‰海水胁迫下,马哇椰子和文椰2号的发芽势和发芽率降幅均较小,文椰4号的发芽势和发芽率降幅最大;文椰4号叶片的细胞膜透性升幅最大,约91.3%,马哇椰子和文椰2号的细胞膜透性升幅较小(分别为30.7%和33.1%);文椰4号的MDA含量升幅最大,MDA含量升幅较小的为文椰2号和马哇椰子;当海水质量浓度为2.3‰、3.4‰和6.8‰时,文椰4号的Pro含量升幅最大,文椰2号和马哇椰子的Pro含量升幅相对较小;当海水质量浓度为2.3‰时,文椰2号和马哇椰子的SOD和POD活性升幅较大,文椰4号的SOD和POD活性升幅较小。相关性分析结果表明,Pro含量与细胞膜透性和SOD活性呈显著正相关(P<0.05),与MDA含量呈极显著正相关(P<0.01),其余指标间无显著相关性(P>0.05)。【结论】海水盐度2.3‰是进行椰子幼苗耐盐性鉴定的适宜质量浓度;文椰2号和马哇椰子对盐胁迫反应相对迟钝,耐盐性相对较佳,可作为耐盐性椰子品种进行育苗和推广种植。 周丽霞 曹红星 刘艳菊关键词:椰子 海水胁迫 耐盐性 生理指标 油棕基因组DNA 3种提取方法的比较研究 被引量:8 2013年 采用CTAB小样提取法、PVP法和SDS-CTAB改良法,分别从油棕嫩叶和老叶中提取基因组DNA,并通过紫外分光光度计、琼脂糖凝胶电泳和PCR反应进行检测。研究结果表明:用CTAB小样提取法提取的油棕嫩叶总DNA的质量最好,纯度最高;用其他2种方法提取的DNA的质量均较差。 周丽霞 肖勇 杨耀东 马子龙关键词:油棕 基因组DNA 椰子保守microRNA预测和特征分析 被引量:2 2014年 根据释放的椰子转录组序列和miRBase数据库中的microRNA (miRNA)序列信息,分析椰子中保守miRNA及其相应靶基因的特征.根据miRBase数据库中植物miRNA序列,共预测了41个miRNA,分别属于22个miRNA家族.这些miRNA家族中13个家族在植物中非常保守,miRBase至少在19个物种中检测到,而miR902、miR2673和miR414这3个家族不保守,仅在1~2个物种中检测到.这些预测的miRNA的成熟序列长度大多为21个碱基(59.5%),而前体序列的长度大多为50~100个碱基(61.9%).分析miR396家族前体序列时发现,成熟miRNA和成熟miRNA*(成熟miRNA形成发卡结构互补的序列)序列很保守,但是中间的序列变异很大.此外,预测miRNA的靶基因发现保守的miRNA家族的靶基因为一些重要的转录因子家族,与植物的生长发育相关,而不太保守的miRNA家族的靶基因编码与表型控制相关的蛋白. 夏薇 李静 周丽霞 杨耀东 肖勇 马子龙关键词:椰子 靶基因 油棕转录组SSR标记开发研究 被引量:13 2014年 从NCBI网站下载40 728条油棕EST,结合文献报道的油棕果肉转录组序列信息,通过聚类拼接和处理,得到全长为32 637.947 kb的无冗余序列20 054条。在这些序列中共检索出4 538个SSR,检出率为22.6%。其中以单核苷酸重复基序为主导类型,出现频率为51.2%,二核苷酸、三核苷酸重复基序的出现频率分别为20.4%和17.9%。随机挑选了400对SSR引物进行PCR多态性检测,获得29对PCR多态性引物,并随机选取11对引物进行验证,在4种不同来源的油棕样本中表现出多态性。 周丽霞 肖勇 杨耀东关键词:油棕 转录组 SSR 基于SRAP分子标记的不同种壳厚度油棕种质资源遗传多样性分析 被引量:5 2020年 【目的】分析不同种壳厚度油棕种质资源的遗传多样性及群体结构,为油棕种质资源的有效利用及新品种选育提供理论依据。【方法】选取厚壳种BM8和无壳种L2T对288对SRAP引物组合进行筛选,从中筛选出扩增条带清晰、稳定及多态性好的SRAP引物组合,利用其对46份不同种壳厚度的油棕种质材料进行多态性扩增,基于扩增结果,利用NTSYS 2.1的非加权组平均法(UPGMA)计算遗传相似系数并构建聚类图,利用POPGENE 1.32计算遗传多样性指数。【结果】从288对引物组合中共筛选出15对SRAP引物,利用其对46份油棕种质材料进行PCR扩增,共扩增出303条条带,其中多态性条带183条,平均每条引物扩增出12.2条,多态比率为60.4%。46份油棕种质材料的观测等位基因数(Na)为1.0982~1.3264,平均1.6024;有效等位基因数(Ne)为1.1092~1.15976,平均1.4803;Nei’s基因多样性指数(H)为0.0572~0.1093,平均0.1937;I为0.0927~0.1648,平均0.3115。薄壳种油棕的遗传多样性指数与无壳种油棕较接近,且二者均高于厚壳种油棕,说明薄壳种和无壳种油棕的遗传多样性高于厚壳种油棕。厚壳种油棕与无壳种油棕的遗传一致度最小(0.7728),但二者间的遗传距离最大(0.2556)。厚壳种油棕与薄壳种油棕间的遗传一致度最大,(0.8396),且二者间的遗传距离最小(0.1748)。在遗传相似系数为0.59时,46份供试油棕种质被分为4个类群,其中,厚壳种油棕种质材料均分布在第I类群,薄壳种油棕种质材料(除Eg14分布在第I类群外)和无壳种油棕种质材料均分布在II、III和IV类群。【结论】46份油棕种质材料的遗传多样性整体较丰富,其中薄壳种油棕和无壳种油棕的遗传多样性较厚壳种油棕丰富,二者可作为优良育种材料进行亲本选配,选育出高产油率的油棕新品种。 周丽霞 曹红星关键词:油棕 种壳 厚度 SRAP 聚合酶链反应-直接测序法检测凝血因子ⅴ基因突变 2014年 凝血因子ⅴ是凝血过程中一种重要的辅因子,其10号外显子1691(mRNA)位鸟嘌呤核苷酸被腺嘌呤核苷酸所取代(即1691G→A),从而导致该基因有一个点突变,突变后的凝血因子ⅴ对抗凝血系统中一种血浆蛋白质C产生抗性,使血栓发生的风险大大增加。通过设计了两对不同的引物,利用PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳和Sanger测序法,检测凝血因子ⅴ1691是否发生了点突变(即1691G→A),从而建立一种简单、快速、准确地检测单基因遗传突变的方法。 周丽霞 肖勇 杨耀东关键词:凝血因子V 基因突变 PCR