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神农架川金丝猴投食群TRIM5 alpha基因的变异及其进化分析: 2016年; 目的:本研究探索神农架大龙潭川金丝猴TRIM5alpha蛋白序列的特征、变异、该基因进化特点以及该基因的遗传多样性,对金丝猴的保护和研究具有重要的意义。方法:从神农架川金丝猴投食群随机选择41个个体,采集毛发并提取基因组DNA,设计引物,对其TRIM5 alpha基因编码序列进行PCR扩增和测序,最后对序列进行比对和分析。结果:在神农架川金丝猴投食群41个个体中,TRIM5alpha基因不存在与Cyp A假基因序列融合的现象。与恒河猴序列不同而与人类相似的是,川金丝猴中没有发现TFP339-341型,而只发现△△Q339-341型。41个个体TRIM5alpha蛋白序列没发现任何非同义突变位点,显示该基因在该种群中具有很低的遗传多样性。编码序列的进化分析表明,Coiled-coil结构域和SPRY结构域在进化中经历了明显的正向选择,Ring结构域和B-box结构域则经历了纯化选择。结论:川金丝猴TRIM5 alpha基因存在很多独特变异位点,且经历了明显的正向选择。对投食群的研究表明该基因编码序列在该种群中多样性很低,这从侧面反映了该总群较低的遗传多样性。针对这种情况,建议在种群复壮的工作中,适当引入一批有效的建群者。; 张杜郭雪杨万吉刘宏伟梁伊丽刘学端; 关键词：川金丝猴抗病毒 ALPHA 进化

一组基于转录组测序开发的川金丝猴EST-SSR引物和试剂盒: 本发明公开了一组基于转录组测序开发的川金丝猴EST‑SSR引物和试剂盒。本发明提供17对川金丝猴EST‑SSR标记引物如SEQ ID NO:1～SEQ ID NO:34所示，这些EST‑SSR标记在9只川金丝猴个体中具有...; 刘学端张杜梁伊丽胡琪刘宏伟郭雪尹华群高飞; 文献传递

一种基于分子标记培育人类疾病动物模型的方法: 本发明公开了一种基于分子标记培育人类疾病动物模型的方法，属于动物模型培育技术领域。所述基于分子标记培育人类疾病动物模型的方法，具体包括以下步骤：(1)构建模式动物染色体水平的高质量基因组图谱；(2)筛选模式动物的人类疾病...; 周智君何天琼文依信张杜周俊康刘倩支文玲欧阳伶宣

一种提取毛发DNA的方法: 本发明公开了一种毛发总DNA提取方法,该方法基于PCR缓冲液法和CTAB法改良之后得到。该方法取毛发近毛囊段，经过无水乙醇和蒸馏水洗涤干燥后，在加有SDS和蛋白酶K的PCR缓冲液中消化后，加入RNA酶去除RNA，然后在高...; 刘学端张杜梁伊丽刘宏伟尹华群

一组基于转录组测序开发的川金丝猴EST-SSR引物和试剂盒: 本发明公开了一组基于转录组测序开发的川金丝猴EST‑SSR引物和试剂盒。本发明提供17对川金丝猴EST‑SSR标记引物如SEQ ID NO:1～SEQ ID NO:34所示，这些EST‑SSR标记在9只川金丝猴个体中具有...; 刘学端张杜梁伊丽胡琪刘宏伟郭雪尹华群高飞; 文献传递

一种基于转录组测序开发SSR引物的方法: 本发明公开了一种基于转录组测序开发SSR引物的方法。该方法基于已有的全基因组序列数据及其注释，针对其基因组外显子序列筛选候选SSR位点并设计SSR扩增引物。然后基于多个个体转录组测序的数据进行ePCR验证，最终筛选出多态...; 刘学端张杜梁伊丽胡琪刘宏伟郭雪尹华群高飞

一种基于转录组测序开发SSR引物的方法: 本发明公开了一种基于转录组测序开发SSR引物的方法。该方法基于已有的全基因组序列数据及其注释，针对其基因组外显子序列筛选候选SSR位点并设计SSR扩增引物。然后基于多个个体转录组测序的数据进行ePCR验证，最终筛选出多态...; 刘学端张杜梁伊丽胡琪刘宏伟郭雪尹华群高飞; 文献传递

一种提取毛发DNA的方法: 本发明公开了一种毛发总DNA提取方法,该方法基于PCR缓冲液法和CTAB法改良之后得到。该方法取毛发近毛囊段，经过无水乙醇和蒸馏水洗涤干燥后，在加有SDS和蛋白酶K的PCR缓冲液中消化后，加入RNA酶去除RNA，然后在高...; 刘学端张杜梁伊丽刘宏伟尹华群; 文献传递

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张杜