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张竞涛
作品数:
1
被引量:1
H指数:1
供职机构:
北京交通大学
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发文基金:
国家自然科学基金
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相关领域:
生物学
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合作作者
李金龙
北京交通大学
徐青
北京交通大学
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徐青
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张竞涛
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年份
1篇
2014
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MSAP荧光检测初始数据的自动分析研究
被引量:1
2014年
目的:建立能够实现甲基化敏感扩增多态性(MSAP)荧光检测初始数据自动分析的方法。方法:以17周龄的北京油鸡为实验材料,应用荧光标记的MSAP方法对肌肉组织基因组DNA甲基化水平进行检测,对获得的MSAP荧光检测初始数据通过直接取整法、整区间放置法和半区间放置法等3种计算机处理方法进行分析和比较。结果:对于MSAP荧光检测初始数据的自动转换,半区间放置法与标准的人工转换方法最接近(P>0.05),整区间放置法次之(P>0.05),而直接取整法与标准的人工转换方法差异最大,达到显著水平(P<0.05)。结论:整区间放置法和半区间放置法适用于MSAP荧光检测初始数据的自动分析,建立了基于半区间放置法的在线自动分析软件MSAP Analyst,可实现MSAP荧光检测初始数据的自动分析。
陈秋博
邹智元
李金龙
张竞涛
徐青
关键词:
甲基化
甲基化敏感扩增多态性
荧光检测
北京油鸡
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