雷凯
- 作品数：4 被引量：2H指数：1
- 供职机构：四川大学华西医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：理学自动化与计算机技术更多>>
- 1,1’-二萘基骨架的探针分子对氨基酸/氨基酸衍生物识别的研究被引量：2
- 2012年
- 对1,1’-二萘基骨架的3个探针分子,采用Hyperchem和Gaussian 03先后进行分子力学优化、分子动力学模拟、半经验和HF/STO-3G水平几何构型优化。用AutoDock Vina将优化后的探针分子、配体分子α-氨基酸/α-氨基酸衍生物进行对接实验,获得相应的复合物的最佳作用模式并计算它们之间的亲和能。结果表明,理论计算所获得的探针分子与配体分子α-氨基酸/α-氨基酸衍生物之间的结合模式,与根据实验数据所推断的作用模式几乎完全相同;所计算的复合物之间的亲和能,也与实验测定的结合常数间有相同的变化趋势。
- 范文杰雷凯向明礼杨明理
- 关键词：分子识别分子力学分子模拟
- 联萘基咪唑鎓探针分子选择性识别色氨酸对映异构体的量子化学研究
- 2013年
- 为了用分子力学方法探明联萘基咪唑鎓探针选择性识别D-型色氨酸的作用机制,采用量子化学手段在HF/6-31G(d)//B3PW91/6-31G(d,p)水平对一联萘基咪唑鎓探针与D-型和L型色氨酸间的相互作用,从作用模式分析、电荷转移、态密度分析、轨道相互作用以及计算结合能等多个方面进行了研究。结果表明:在该水平计算的结合能值与实验测定复合物稳定常数之间能正确相关。根据计算结果,从静电相互作用的角度能够解释该联萘基咪唑鎓分子选择性识别D-型色氨酸的实验现象。
- 谷鑫雷凯肖蓉杨明理向明礼
- 关键词：色氨酸量子化学
- WZ系列T790MEGFR抑制剂强效抗肿瘤功效的内在机制探讨
- 2013年
- 为深究WZ系列抑制剂强效抑制突变型表皮生长因子受体(T790M EGFR)的内在机制,用密度泛函理论(DFT)在B3LYP/6-31G(d)计算水平上对进入临床试验阶段的T790M EGFR不可逆抑制剂HKI-272及WZ系列抑制剂进行了研究。结果表明,WZ系列抑制剂在参与Michael加成反应的能力、与T790M EGFR形成的氢键的强度等方面,都优于HKI-272。抑制剂中的参与形成氢键的氢键供体N原子所带的NBO电荷与抑制剂的抗肿瘤功效高度相关。
- 雷凯刘祥均陈俐娟杨明理向明礼
- 关键词：表皮生长因子受体密度泛函理论
- 蛋白质序列比对方法的研究进展
- 2012年
- 先导化物的发现是新药研发流程中首要环节。基于靶点结构的药物设计在先导化物的发现过程中具有十分重要的作用和地位。在靶点三维结构缺乏的情况下,用计算机模拟的方法来预测是获得其结构的一条重要渠道。同源建模是应用最为广泛的蛋白质三维结构模拟方法,而蛋白质序列比对是同源建模中的关键一环。对蛋白质的序列比对、比对结果评价、比对结果优化等内容进行论述,并对相关方面的最新进展作介绍。
- 邵明峰雷凯陈俐娟向明礼
- 关键词：同源建模
