刘慧泉
- 作品数：10 被引量：7H指数：1
- 供职机构：西北农林科技大学植物保护学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金陕西省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学理学化学工程更多>>
- 基于链特异性RNA-seq的禾谷镰刀菌全生活史转录组分析被引量：1
- 2021年
- 为明确植物病原真菌禾谷镰刀菌Fusarium graminearum全生活史的转录组特征和基因表达模式,采用生物信息学技术对其生活史不同阶段15个时期或组织的链特异性RNA-seq数据进行分析。结果表明,共有8106个基因在所有时期均有表达,为禾谷镰刀菌生活史核心基因,占总基因数的47.2%;有性生殖和侵染过程中表达的基因数相对较多,其中有性生殖后期表达的基因数最多,达15221个;无性产孢和侵染小麦穗过程中基因表达水平整体较高,而分生孢子中基因表达水平最低。在燕麦培养基上禾谷镰刀菌气生菌丝的基因表达模式与侵染过程中的基因表达模式较为相似,而与营养生长菌丝的基因表达模式差异较大。该菌次生代谢物合成特征酶基因和分泌蛋白基因的表达模式均分成3类,即分别在侵染、营养生长和有性生殖过程上调表达,暗示其在生活史不同阶段的特异性功能。
- 曹心雨李东翱路平王秦虎江聪刘慧泉
- 关键词：禾谷镰刀菌赤霉病转录组RNA-SEQ
- 真菌细胞壁降解酶组的比较基因组学分析
- 真菌能够分泌多种细胞壁降解酶，这些降解酶能够破坏植物细胞壁，释放各种单体，这一过程不但能软化植物细胞壁利于病原真菌入侵植物体，也能为真菌提供生长发育的营养物质。大多数腐生真菌通过分泌细胞壁降解酶降解植物生物质(plant...
- 赵中涛刘慧泉安琳王晨芳许金荣
- 关键词：真菌果胶酶纤维素酶半纤维素酶
- 3'→5'核酸外切酶ERI-1调控多种RNA代谢的机制
- 2023年
- ERI-1是一种3’→5’核糖核酸外切酶,具有一个类ERI-1_3’h Exo结构域和一个SAP结构域,在真核生物中保守存在。ERI-1最初是在筛选秀丽隐杆线虫ds RNA敏感性增强突变体时发现的,是RNAi的重要调节因子。ERI-1通过与外源性RNAi组分竞争Dicer协调内源RNAi和外源性RNAi,并促进特定内源性si RNA的生成,且该功能为线虫特有。其还通过核酸外切酶活性降解si RNA及mi RNA,负向调控RNAi。裂殖酵母ERI-1通过降解异染色质相关si RNA的水平,参与调控异染色质的形成。ERI-1在r RNA的加工和成熟中发挥重要作用。此外哺乳动物ERI-1在细胞周期S期末期降解组蛋白m RNA,从而推动细胞进入G2期。本文从结构、功能等方面概述了ERI-1调控多种RNA代谢的机制,探讨了其进化丢失问题和应用前景并对后续研究提出了建议。
- 张怡然刘慧泉唐喆金巧军
- 关键词：RNA干扰小干扰RNA
- 必要的复杂性：真菌A-to-I mRNA编辑的重要功能和适应性优势
- 分子生物学中心法则强调遗传信息传递的忠实性,但该法则受到RNA编辑现象的挑战。RNA编辑通过核苷酸插入、删除、取代等转录后加工过程改变RNA序列,导致遗传信息发生改变。目前已在多种真核生物世系中发现了各种类型的RNA编辑...
- 齐朝妹辛凯芸杜雁飞冯婵婧曹心雨王秦虎江聪刘慧泉
- 关键词：RNA编辑有性生殖禾谷镰孢
- 小麦响应禾谷镰刀菌侵染的转录组学研究进展
- 2021年
- 由禾谷镰刀菌引起的小麦赤霉病直接为害作物穗部,不仅严重影响小麦产量,还可因为毒素污染问题威胁人畜健康。近年来对小麦与禾谷镰刀菌互作的转录组学研究带来了很多新见解,概述了小麦响应禾谷镰刀菌侵染的转录组学研究进展,主要比较了不同抗性品种、不同器官、不同籽粒发育时期的小麦穗部在禾谷镰刀菌侵染时的基因表达特征,总结了赤霉病感染时小麦的激素响应、信号传导、转录调控和防卫相关基因的表达规律,以期促进研究者对小麦响应禾谷镰刀菌侵染规律的理解。
- 李东翱刘慧泉王秦虎
- 关键词：小麦赤霉病小麦禾谷镰刀菌转录组
- 六妹羊肚菌PacBio基因组测序和DNA 6mA甲基化分析被引量：6
- 2021年
- 羊肚菌属于子囊门真菌,是世界范围内最受欢迎的食用菌之一。本研究通过PacBio单分子实时高质量核基因组组装,大小为53.57Mb,重复序列含量为17.03]%,e"包含42条重叠群(contigs),重叠群N50高达1.82Mb,其中13条重叠群两端均含有端粒重复序列,为完整的染色体。通过链特异性RNA-seq测序和转录本拼接,并结合多种基因预测策略,预测到13182个蛋白编码基因,包括267个碳水化合物活性酶,11个次生代谢产物合成基因簇。通过与内蒙古地区栽培的六妹羊肚菌菌株NZTD180501373基因组比较发现,六妹羊肚菌进化过程中可能发生过染色体重组事件,二者具有33055个SNP和48726个InDel位点差异,并且各自拥有超过6Mb的特有序列。此外,相比于梯棱羊肚菌M.importuna,六妹羊肚菌SCLS菌株中与逆转录转座酶有关的orthogroup发生了扩张,并且拥有5个成员数超过100的特有逆转录转座酶基因家族。对SCLS菌株中的DNA N6腺嘌呤甲基化(6mA)修饰进行了鉴定,发现SCLS菌株基因组中0.42%的腺嘌呤被6mA甲基化,其含量显著高于已报道的6种双核亚界(Dikarya)真菌。6mA甲基化位点在逆转录转座子上显著富集,表明六妹羊肚菌中6mA甲基化可能调控逆转录转座子的活性,这也是首次在真菌中报道6mA甲基化与转座子相关。
- 王昊明范立刚董永镕郑晓慧刘慧泉
- 禾谷镰刀菌细胞周期蛋白依赖激酶CDC2和周期蛋白依赖激酶活化激酶CAK1基因的功能研究
- 禾谷镰刀菌(Fusarium graminearum)是小麦赤霉病的优势种之一，它不但为害小麦也为害其他小粒谷物和玉米等作物。小麦赤霉病发生不仅导致作物产量和品质下降，病原菌产生的真菌毒素还为害人畜健康。该病是一种世界性...
- 马继文刘慧泉张娟玉许金荣
- 关键词：禾谷镰刀菌细胞周期
- A-to-I RNA编辑和可变剪接对禾谷镰刀菌FgBUD14基因的协同调控作用
- 禾谷镰刀菌(Fusarium graminearum)作为优势种引起的小麦赤霉病(Fusarium head blight)是一类世界性麦类流行病害,它不仅会造成小麦产量降低,还会在染病小麦籽粒中积累DON、ZEA等真菌...
- 梁洁刘慧泉江聪许金荣
- 关键词：禾谷镰刀菌RNA编辑可变剪接
- 真菌中A-to-I RNA编辑的适应性进化研究
- 由ADAR酶催化介导的A-to-I RNA编辑是动物中普遍存在的一种重要的RNA修饰机制，通过水解脱氨基作用将RNA分子中的腺苷(A)转变成肌苷(I)，而肌苷在翻译过程中被识别为鸟苷(G)，因此，发生在mRNA上的A-t...
- 王秦虎刘慧泉许金荣
- 关键词：RNA编辑适应性赤霉菌正选择
- 植物病原真菌抑制几丁质触发植物免疫反应的策略
- 2024年
- 几丁质是真菌细胞壁的重要成分,其晶体结构使真菌细胞壁具有一定的强度和硬度,对植物病原真菌侵染结构和侵染菌丝的形成具有重要作用。在植物与真菌互作过程中,植物分泌的几丁质酶可以降解真菌的几丁质产生几丁质寡糖,几丁质寡糖作为一种病原相关分子模式(PAMP),能够被植物细胞膜上的几丁质受体识别进而触发植物免疫反应。植物病原真菌为了成功侵染植物进化出了多种策略抑制几丁质触发的植物免疫反应,具体而言,植物病原真菌分泌大量的效应蛋白、多糖或几丁质脱乙酰化酶、几丁质酶、蛋白酶等效应子抑制植物的免疫反应。这些效应子被分泌到植物细胞质外体或细胞内部破坏植物免疫系统,促进病原真菌在植物细胞中获取营养物质以供其定殖和生长发育。本文综述了植物识别几丁质的分子机制以及植物病原真菌抑制几丁质触发植物免疫反应的主要策略,并对今后的研究前景进行了展望。
- 许铭徐婧刘慧泉
- 关键词：几丁质植物免疫几丁质酶
