采用ISSR分子标记的方法，对青海地方核桃品种单株进行了遗传关系研究。实验从30条ISSR引物中筛选出4条进行电泳分析，使用NTSYS pc 2．11F和Popgene 1．32软件进行数据统计分析并作图。结果表明：4条ISSR引物共获得40条谱带，平均每条引物10条谱带，引物平均多态带比率82．5％；4条ISSR引物可将所有样品完全分开，当遗传相似性阈值为0．736时可将样品分成7组。样品间的遗传相似性系数为0．550～0．975（平均0．763）。由于长期的自然变异和选择，青海地区核桃积累了较高的遗传多样性，单株间存在不同程度的亲缘关系。
