王德春
- 作品数：1 被引量：3H指数：1
- 供职机构：密歇根州立大学更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 大豆高密度SNP标记遗传图谱构建方法的比较被引量：3
- 2013年
- 以对大豆猝死病抗性不同的大豆品系U01-390489×E07080所衍生的F4:5代96个家系的C2连锁群上50个多态性SNP标记位点为基础数据,对比分析了利用Joinmap4.0及Icimapping 2个软件不同计算方法所构建的遗传图谱的异同及优劣.结果表明,Icimapping构建的图谱长度较Joinmap4.0所建图谱短,Icimapping包含的几种算法构建的图谱长度相近,Joinmap中Regression的计算方法所构建的遗传图谱与soybase上的一致图谱长度最为接近,Maximum Likelihood算法得出的图谱长度与Fixed Order算法图谱长度相近.Icimapping的构建的图谱中,较多的标记聚集于同一位点,其中的几种算法相近.Joinmap中regression算法的图谱结果乱序标记较多,Maximum Likelihood构建的图谱乱序标记较少,与Fixed Order的结果更为接近.研究结果表明,Joinmap的Maximum Likelihood算法更适合于高密度的SNP标记的图谱构建.
- 谭瑞娟文自翔顾翠华王德春宋启建PERRY Cregan邢小萍李洪连
- 关键词：大豆单核苷酸多态性
