丁宁
- 作品数：1 被引量：2H指数：1
- 供职机构：南开大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：天津市自然科学基金国家基础科学人才培养基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 十字花科部分蔬菜HRD基因的克隆与生物信息学分析被引量：2
- 2014年
- 根据NCBI上得到的拟南芥HRD基因序列,利用同源序列克隆的方法,设计引物,从12种十字花科蔬菜中克隆出其核酸序列,并进行生物信息学分析,旨在验证克隆出的序列与拟南芥HRD基因是否具有同源性.对这些得到的核酸序列从DNA序列、氨基酸序列的相似性、亲/疏水性、2级结构、功能域、3级结构、同源进化树等进行了预测和较为全面的分析.结果显示经PCR扩增,都得到了大小与拟南芥HRD基因基本一致的序列,长度在555bp左右.其基因序列、氨基酸序列比对同源性分别达到93.14%和89.74%;亲/疏水性分析表明该基因编码的蛋白为亲水性蛋白;推导的氨基酸序列中均存在AP2功能结构域,属于十字花科AP2/ERF类家族转录因子基因;同源进化树分析表明它们具有很高的同源性,说明所克隆的序列与拟南芥HRD基因由同一个基因进化而来,是十字花科植物中的保守基因.
- 韩春乐王志航王经强刘驰王斌丁宁陈成彬
- 关键词：十字花科ERF非生物胁迫
