严谨
- 作品数:5 被引量:4H指数:2
- 供职机构:重庆市渝北区疾病预防控制中心更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 不同灭活温度对新型冠状病毒核酸检测的影响被引量:2
- 2021年
- 目的探讨不同灭活温度处理对新型冠状病毒核酸检测的影响。方法收集该中心2020年1月25至2月25日采集的新型冠状病毒核酸检测阳性标本14份,每份标本分别采取未灭活56℃、35 min和65℃、15 min恒温金属浴灭活处理,比较未灭活标本和灭活标本循环阈值(Ct值),并进行统计学分析。结果未灭活组和56℃、35 min灭活处理组,未灭活组和65℃、15 min灭活处理组,56℃、35 min灭活处理组和65℃、15 min灭活处理组开放读码框1ab(ORF1ab)、核衣壳蛋白(N)基因扩增Ct值差异均无统计学意义(P>0.05)。在Ct值≥34的标本中未灭活组和56℃、35 min灭活处理组,未灭活组和65℃、15 min灭活处理组,56℃、35 min灭活处理组和65℃、15 min灭活处理组ORF1ab、N基因扩增Ct值差异均无统计学意义(P>0.05)。在Ct值<34的标本中未灭活组和56℃、35 min灭活处理组,未灭活组和65℃、15 min灭活处理组,56℃、35 min灭活处理组和65℃、15 min灭活处理组ORF1ab、N基因扩增Ct值差异均无统计学意义(P>0.05)。结论使用56℃、35 min灭活处理和65℃、15 min灭活处理新型冠状病毒标本对核酸检测结果无明显影响,对Ct值较大标本也未发现有明显影响,对于试验条件有限的基层检测机构可以采用上述方式处理标本以保护实验人员安全。
- 严谨陈小凤熊金萍蒋佳辰夏凤霞何九宏
- 关键词:新型冠状病毒实时荧光定量PCR核酸病毒灭活
- 芯片式数字PCR检测禽流感病毒方法的性能验证
- 2023年
- 目的 对芯片式数字PCR检测禽流感病毒的方法进行评估,并与荧光定量PCR方法进行比较。方法 分别用芯片式数字PCR(dPCR)和实时荧光定量PCR(qPCR)两种方法检测不同浓度梯度的质粒标准品,对两种方法检测结果的线性范围,一致性,批内精密度,最低检出限等方面进行比较评估。并对31份农贸市场禽流感环境标本分别用数字PCR和实时荧光定量PCR检测,利用配对卡方检验来评估两种方法阳性率的差异,并用Bland-Altman法分析与荧光定量PCR方法的一致性。结果 质粒标准品在3.05×10~2copies/mL~1.00×10~7copies/mL的浓度范围内,与dPCR检测值呈良好的线性关系,R~2=0.9969,dPCR和qPCR在线性范围内斜率之间的差异无统计学意义(F=0.996,P=0.321);dPCR在不同稀释度的批内精密度变异系数(CV)范围为2.36%~22.78%;dPCR的估计检测下限(LOD)为410(95%CI:344~570)copies/mL,qPCR的估计LOD为845(95%CI:749~1 004)copies/mL;用dPCR和qPCR检测31份农贸市场环境标本,dPCR的检出率96.8%,qPCR的检出率80.6%(Kappa=0.244,P=0.063)。结论 本研究验证了芯片式数字PCR系统的性能及其与荧光定量PCR系统的方法学比较。芯片式数字PCR在其动态范围内表现出良好的线性,R~2=0.996 9,能够准确且高精度(CV)范围为2.36%~22.78%的定量不同浓度(3.05×10~2~1.00×10~7copies/mL)的复杂样本。
- 严谨姜欣余阎琪陈小凤
- 关键词:实时荧光定量PCR
- 2007年度渝北区农村饮用井水卫生状况分析
- 2008年
- 龚志华胡迪严谨冯志强陈旼媚赵学谦
- 关键词:农村井水合格率
- 产硫化氢大肠埃希菌的分离与鉴定被引量:2
- 2021年
- 目的探讨从临床大便标本中分离并鉴定产硫化氢致病性大肠埃希菌过程,为临床提供参考。方法对来自1例腹泻患儿粪便标本的产硫化氢大肠埃希菌,采用传统分离培养、生化鉴定、血清学试验和全自动微生物分析仪、质谱(MS)鉴定、测序鉴定和多重荧光聚合酶链式反应(PCR)进行分析鉴定。结果传统的分离培养和生化鉴定结果显示为沙门氏菌。全自动微生物分析仪、MS鉴定、测序鉴定结合血清学试验结果显示为非致病性大肠埃希菌。多重荧光PCR结果显示为非5种常见致病性大肠埃希菌。结论临床工作中应充分结合传统方法和现代先进仪器、方法的优势,提高肠道病原菌的检出率和鉴定的准确率。
- 张晓玲严谨张群
- 关键词:硫化氢致病性大肠埃希菌核酸检测