BRD4靶点和多种肿瘤密切相关,是具有良好成药性的热门靶点。本文选取活性较好且结构差异较大的BRD4小分子抑制剂作为训练集分子,基于配体小分子共同特征(HipHop)方法使用Discovery Studio 3.0分子模拟软件构建了药效团。药效团通过测试集验证、ROC曲线验证(SE(sensitivity)=0.93765、SP(specificity)=0.89500、(AUC)=0.956),结果表明构建得到的药效团具有较强的可靠性和较高的可信度。药效团模型含有1个芳环中心、1个疏水基团、2个氢键受体四个药效特征元素。此药效团被用于ZINC数据库进行虚拟筛选,共筛选了861203个分子,命中率为0.782%。再对筛选得到的分子经过分子对接、ADMET成药性预测、构象分析并讨论分子-蛋白相互作用模式,最终得到了21个有潜力的BRD4小分子抑制剂。
本文对纯氮氮笼N_(90)(具有D3d对称性)的分子结构和能量在B3LYP/cc-p VDZ水平下进行计算研究。全面地解析了N_(90)分子的结构,并对它进行了Atoms In Molecule(AIM)分析。图形分析和数值分析结果表明,N_(90)分子内存在多个弱相互作用力。随后本文论述了这种弱作用力与分子构型之间的相互联系,指出了分子内的弱相互作用力是纯氮大分子N_(90)的热力学稳定的一个重要因素。
