尤欢
- 作品数：3 被引量：18H指数：2
- 供职机构：云南农业大学植物保护学院更多>>
- 发文基金：国家质检总局科技计划项目更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 山茶属植物ITS的扩增及其序列特征分析被引量：8
- 2014年
- 以山茶属(Camellia)植物为实验材料,通过在PCR反应液中加入二甲基亚砜(DMSO)来改进ITS区的扩增效果,并对获得的序列进行了相关的比较分析以及系统发育分析。分析结果表明:(1)PCR反应液中添加4%的DMSO能明显提高ITS的扩增效率,并能有效防止ITS假基因的扩增;(2)与功能拷贝相比,ITS假基因序列的ITS1和ITS2区存在多处碱基缺失,GC含量明显偏低,5.8S区二级结构稳定性降低;(3)应用ITS假基因进行种水平的系统发育分析会对其真实的系统关系造成影响,提示进行系统进化研究时应警惕假基因的干扰。
- 尤欢周阿涛岳亮亮寸东义丁元明
- 关键词：DMSOITS山茶属假基因
- 植物nrDNAITS假基因研究进展被引量：2
- 2013年
- 核核糖体DNA内转录间隔区(nrDNA ITS)被广泛应用于植物系统发育研究中。近年来,发现在很多植物类群中存在ITS假基因(pseudogenes),然而这些假基因在系统发育分析中的潜在价值往往被低估,甚至在部分研究中被忽略。主要介绍假基因的生成、特性以及ITS假基因在植物系统学中的应用,并对ITS假基因的研究前景进行展望。
- 尤欢周阿涛岳亮亮寸东义李旻丁元明
- 关键词：ITS假基因进化
- 云南边境地区果实蝇属种类DNA条形码鉴定被引量：9
- 2014年
- 【目的】果实蝇属Bactrocera中有国际上重要的检疫性害虫,基于形态的物种鉴定有一定的局限性。另一方面,云南边境地区为东南亚地区实蝇入侵我国的重要通道。因此,对该地区实蝇分子鉴定方法的研究对于该属物种的快速准确鉴定具有重要意义。本研究旨在探讨DNA条形码技术在果实蝇属物种鉴定中的有效性。【方法】使用线粒体基因COI和COII序列的通用引物对果实蝇属20个物种60份样品进行PCR扩增、测序和序列分析;采取距离方法和建树方法评价2种序列的鉴别能力。【结果】COI和COII序列平均长度分别为682 bp和339 bp,种内和种间遗传差异较大,有较明显的遗传距离间隔(barcoding gap),鉴定成功率分别为91.2%和90.7%。另外,分子系统树表明华实蝇亚属Sinodacus不是单系群。【结论】COI和COII序列均能够将绝大多数果实蝇属物种进行准确鉴别,应用COI或COII序列进行果实蝇属物种鉴定具有一定的可行性。
- 尤欢周力兵邓裕亮陈国华
- 关键词：双翅目实蝇科果实蝇属COI基因COII基因物种鉴定
