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葛文谦
作品数:
1
被引量:2
H指数:1
供职机构:
青岛农业大学食品科学与工程学院
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发文基金:
山东省优秀中青年科学家科研奖励基金
国家自然科学基金
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相关领域:
生物学
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合作作者
郭瑞
青岛农业大学食品科学与工程学院
程凡升
青岛农业大学食品科学与工程学院
王海霖
青岛农业大学食品科学与工程学院
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1篇
2015
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葡萄灰霉病菌胞外分泌蛋白质组的功能预测分析
被引量:2
2015年
由灰葡萄孢菌(Botrytis cinerea)引起的灰霉病是一种危害极大的植物病害,每年都会造成作物的严重的损失。但B.cinerea也是贵腐葡萄酒品质的主要重要成因。试验采用生物信息学的方法,对B.cinerea的胞外分泌蛋白进行分析。综合利用信号肽分析软件SignalP 4.1、跨膜结构预测软件TMHMM v2.0和THUMBUP、GPI锚定位点预测软件big-Pi Predictor、亚细胞蛋白定位软件TargetP 1.1等软件,对B.cinerea全基因组中的16448个氨基酸序列进行预测。共发现有628个分泌蛋白,编码这些蛋白的ORF最短333bp,最长4476bp,平均1055bp。367个蛋白质有功能描述,其中包括214个酶类。这些酶主要包括各种糖苷水解酶、酯酶、蛋白酶、多糖聚合酶、氧化还原酶、角质酶等。本文对研究B.cinerea的侵染机制和解释贵腐酒特殊香气的原因有重要意义。
王海霖
葛文谦
郭瑞
索一平
程凡升
关键词:
蛋白质功能预测
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