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龚丽珍
作品数:
1
被引量:1
H指数:1
供职机构:
龙岩学院生命科学学院
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发文基金:
福建省科技重大专项
福建省自然科学基金
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相关领域:
生物学
农业科学
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合作作者
杨炳辉
龙岩学院生命科学学院
曾建平
龙岩学院生命科学学院
陈小燕
龙岩学院生命科学学院
黄春芳
龙岩学院生命科学学院
刘建奎
龙岩学院生命科学学院
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机构
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龙岩学院
作者
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陈安妮
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刘建奎
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曾建平
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杨炳辉
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动物医学进展
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2016
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2012年-2014年闽西地区PRRSV流行株ORF5基因遗传变异分析
被引量:1
2016年
为了研究2012年-2014年闽西地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行毒株的分子生物学特性和变异规律,对分离自闽西多个地区25份疑似PRRS病料的10个PRRSV分离株,应用RT—PCR对其中ORF5基因进行扩增及序列分析,从而了解闽西地区PRRSV的遗传变异性。结果表明,10个毒株均为美洲型PRRSV,9株PRRSVORF5基因全长为603bp(FJ05为600bp),10个毒株ORF5基因之间的核苷酸同源性为88.4%~99.3%;与VR-2332、MLV和CH-1a毒株的核苷酸同源性为88.3%~98.8%,与我国高致病性代表毒株JXA1、WUH1、HUN4等的同源性为88.9%~99.0%,与欧洲型毒株代表毒株LV的同源性为63.8%~65.09/6。ORF5基因推导氨基酸序列变异主要发生在9—40位和58—62位,10株PRRSVoRF5氨基酸同源性为88.5%~99.5%;与VR-2332、MLV和CH-1a的氨基酸同源性为87.5%~98.5%,与我国高致病性代表毒株JXA1、WUH1、HUN4等的同源性为88.0%~99.5%,与欧洲型毒株代表毒株LV的同源性为56.6%~59.2%。遗传进化树表明,闽西地区PRRSV可以分为疫苗株(1株,10%)、中等毒力PRRSV(1株,10%)和HP—PRRSV(8株,809/6)3个亚群,其中以HP—PRRSV为主,表明闽西地区PRRSV流行毒株呈现遗传变异多样性。
黄春芳
刘建奎
龚丽珍
杨炳辉
曾建平
陈安妮
陈小燕
关键词:
猪繁殖与呼吸综合征病毒
ORF5基因
反转录-聚合酶链反应
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