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李珍
作品数:
1
被引量:3
H指数:1
供职机构:
上海海事大学信息工程学院
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发文基金:
国家自然科学基金
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相关领域:
生物学
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合作作者
牟晓阳
生物化学系
孔薇
上海海事大学信息工程学院
杨旸
上海交通大学
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河北师范大学...
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2015
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基于miRNA调控网络研究其在乳腺癌病理学分型中的作用
被引量:3
2015年
目前microRNA(miRNA)转录后的调控作用在乳腺癌(breast cancer,BC)致病机理探寻中受到广泛关注.但在病理分型中,人们对于miRNA如何与其靶标基因相互作用来调控乳腺癌的分型还知之甚少.本文通过结合基因表达数据和序列信息预测miRNA在乳腺癌分型中的作用.首先,使用T统计针对健康、非浸润及浸润性乳腺癌样本提取差异表达的miRNA和mRNA;然后,利用HCtarget算法预测表达显著miRNA的靶基因;最后,构建miRNA和mRNA调控网络并进行富集性分析.分子生物学分析显示,10个显著表达的miRNA的靶基因广泛参与MAPK信号通路、Wnt信号通路、雌激素信号通路等与乳腺癌密切相关的通路.而hsa-miR-200c,hsa-miR-205和hsa-miR-145调控强度变化贯穿乳腺细胞由正常到非浸润再到浸润的整个过程,可以作为识别乳腺癌潜在的分子标志物,为乳腺癌发病机理研究提供了方法和依据.
孔薇
李珍
牟晓阳
杨旸
关键词:
乳腺癌
病理学分型
MIRNA
靶基因
调控网络
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