蔡曼
- 作品数:4 被引量:13H指数:2
- 供职机构:石河子大学经济贸易学院新疆生产建设兵团绿洲生态农业重点实验室更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 基于小麦淀粉合成酶SSⅡa氨基酸序列的生物进化分析
- 2015年
- 选取小麦淀粉合成关键酶SSⅡa,通过生物信息学分析,探究其在进化过程中与其它生物的亲缘关系,看其是否可以作为生物进化的依据。利用克隆得到的小麦SSⅡa基因翻译氨基酸序列,并在NCBI上做BLAST同源比对,并于Swiss Prot非冗余蛋白数据库获得不同生物的同源氨基酸序列进行生物信息学分析。共比较了47种生物的氨基酸序列,其中包括6种藻类、1种苔藓、1种蕨类、1种菌类和38种陆生被子植物。结果显示:小麦淀粉合成酶氨基酸序列与其它生物的同源性为37%-99%,并表现出较高的保守性。通过构建系统进化树,发现淀粉合成酶氨基酸序列可以大体的反映生物进化关系,其氨基酸序列可以用来判定生物进化过程中亲缘关系的远近。
- 韩俊杰王昊龙蔡曼李咏李卫华
- 关键词:氨基酸序列系统进化树
- 小麦淀粉合成相关酶基因SSⅡa、SBEⅡa和SBEⅡb表达序列多态性及对淀粉质量分数的影响被引量:3
- 2016年
- 为了探究小麦淀粉合成相关酶SSⅡa、SBEⅡa和SBEⅡb基因表达序列核苷酸多态性及其与淀粉质量分数的关系,根据GenBank中已公布的基因序列设计特异引物,克隆基因的表达序列并测序,通过Clustal X2比对分析,用Dnasp 5.0计算核苷酸多态性信息,并建树做单倍型与淀粉质量分数的相关分析。结果表明,克隆得到3个基因的ORF(Open reading frame)序列,NCBI/Blast同源比对SSⅡa、SBEⅡa和SBEⅡb与GenBank中已登记的序列的同源性分别为98.19%、98.64%和99.04%。在SSⅡa、SBEⅡa和SBEⅡb中分别发现40、14和18个SNP位点,其中共包括4个InDel。在SSⅡa中,其第2外显子区为变异富集区,Tajima’s D检验D值均不显著。可见,这3个基因的多态性信息均较丰富,其单核苷酸多态性与小麦淀粉质量分数之间存在一定的对应关系。
- 韩俊杰王昊龙李咏蔡曼李卫华
- 关键词:小麦
- 陆地棉GhSAD2基因克隆与表达特征研究被引量:9
- 2016年
- Δ9硬脂酰ACP脱氢酶基因(GhSAD2)是脂肪酸合成代谢过程中关键的去饱和酶基因,为明确该基因在棉花脂肪酸合成代谢中的功能,该研究克隆了陆地棉GhSAD2基因,并对该基因的序列特征、进化关系及表达特性进行分析。序列分析显示,GhSAD2基因(GenBank登录号为KX197920)cDNA全长1 188bp,编码396个氨基酸,具有脂肪酸去饱和酶家族2个高度保守的组氨酸簇EENRHG和DEKRH,分别位于氨基酸的185和271位。系统进化分析显示,GhSAD2基因与可可树的同源基因进化关系非常接近。qPCR分析显示,GhSAD2基因在叶中的表达量高于茎和根,且在花后25d的种子中表达量达到最高值。低温胁迫诱导结果表明,GhSAD2基因在不同程度低温处理下均有上调表达,6h表达量最大,之后逐渐下调。研究表明,GhSAD2基因可能对棉子油不饱和脂肪酸的合成具有重要作用,同时在棉花抗寒方面也起一定的生理作用。
- 蔡曼李卫华王娟王旭文孔宪辉余渝刘丽
- 关键词:陆地棉基因克隆低温胁迫
- 陆地棉GhSAD2基因表达载体的构建、转化及抗寒性初步分析被引量:1
- 2017年
- 为研究Δ9-硬脂酰-ACP脱氢酶基因的功能及其与植物抗寒性的相关性,以陆地棉GhSAD2基因(KX197920)为目的基因,构建植物表达载体pBI121-GhSAD2,将该表达载体通过电击法导入根癌农杆菌GV3101中,采用根癌农杆菌介导的叶盘法转化烟草。通过PCR和GUS活性染色鉴定外源GhSAD2基因是否导入并整合到烟草基因组上转录表达。将转pBI121-GhSAD2型和野生型烟草置于4℃下处理48 h后,检测其电解质渗漏率并观察其表型。研究结果证明目的基因GhSAD2已整合到烟草及棉花的基因组中,共获得转基因植株9株,转化率为75%。陆地棉GhSAD2基因能够显著增强非低温驯化植物烟草的抗寒性,从而提高植物细胞的低温防御能力,为进一步探究该基因的功能鉴定了基础。
- 蔡曼蔡曼李卫华柳延涛余渝孔宪辉王娟王旭文
- 关键词:陆地棉表达载体构建