金丽
- 作品数:11 被引量:31H指数:3
- 供职机构:西北民族大学生命科学与工程学院更多>>
- 发文基金:中央高校基本科研业务费专项资金国家级大学生创新创业训练计划甘肃省农牧厅生物技术专项更多>>
- 相关领域:农业科学生物学历史地理更多>>
- 八眉猪SLA-DRA基因第4外显子多态性分析被引量:1
- 2015年
- [目的]研究八眉猪SLA-DRA基因第4外显子的多态性,确定其等位基因数以及核苷酸和氨基酸变异位点,探讨其遗传特性。[方法]采用PCR-SSCP和克隆测序的方法对八眉猪SLA-DRA基因第4外显子进行多态性检测。[结果]八眉猪SLA-DRA基因第4外显子共有3种等位基因(A、B、C),形成3种基因型(AA、BB、BC),其中B为优势等位基因,BC为优势基因型。序列对比结果表明,八眉猪SLA-DRA基因第4外显子共有3个核苷酸突变位点(c.4167A>G、c.4246A>G和c.4282C>T),其中4 167 bp的突变导致谷氨酰胺(Q)突变为精氨酸(R)。群体遗传学分析表明,八眉猪SLA-DRA基因第4外显子的多态信息含量为0.3953,杂合度为0.7241,且八眉猪在SLA-DRA基因第4外显子上偏离了Hardy-Weinberg平衡(p<0.01)。[结论]八眉猪SLA-DRA基因的第4外显子属于中度多态,并呈现出杂合子优势。
- 谭小音金丽谢德琼李晓梅张丽刘丽霞
- 关键词:八眉猪多态性SSCP克隆
- 猪SLA-DRA基因SNP位点筛选及其生物信息学分析被引量:2
- 2017年
- 以八眉猪、蕨麻猪和甘肃黑猪为研究对象,利用PCR-SSCP和测序方法对SLA-DRA基因4个外显子进行SNP位点筛选,并利用生物信息学软件预测各SNP位点对DRA基因mRNA二级结构、蛋白质二级结构和三级结构的影响。结果在3个猪种中共检测到6个DRA基因SNP位点,分别为外显子1的A^(177)G,外显子2的A^(3093)C,以及外显子4的A^(4167)G、A^(4246)G、C^(4282)T和G^(4293)A,其中A^(3093)C、A^(4167)G和G^(4293)A为错义突变,分别导致甲硫氨酸(Met)变为亮氨酸(Leu)、谷氨酰胺(Gln)变为精氨酸(Arg)和精氨酸(Arg)变为组氨酸(His)。以3个错义SNP位点为基础,构建了6种DRA单倍型,其中H1、H3和H6为主要单倍型,频率分别为0.25、0.21和0.21。生物信息学分析表明,三个猪种DRA基因单倍型的mRNA二级结构、蛋白质二级结构和三级结构与野生型均存在一定的差异。研究结果可为八眉猪、蕨麻猪和甘肃黑猪的保种和抗病育种提供理论依据。
- 刘丽霞张丽田晓静陈红寸海霞金丽谭小音谢德琼
- 关键词:SNP位点生物信息学
- Ⅰ型和Ⅲ型干扰素抗病毒作用机制的研究进展被引量:9
- 2021年
- 干扰素(interferon,IFN)是一类重要的细胞因子,直接参与上皮细胞的抗病毒免疫反应,介导天然免疫应答诱导IFN刺激基因(interferon stimulated gene,ISG)的表达,从而使机体快速建立针对病毒侵染的天然免疫防线。目前认为Ⅰ型和Ⅲ型IFN在很多功能上重叠相似,均具有抗病毒、抗肿瘤增殖和免疫调节作用。同时,在很大程度上,介导的信号通路也很相似。但Ⅰ型IFN在病毒感染早期即发挥抗病毒作用并可发挥长期免疫功能,期间反应迅速且能够强烈诱导ISG的产生,而Ⅲ型IFN则相对迟缓,且诱导ISG的能力有限,主要在天然免疫反应的黏膜免疫中发挥重要作用。此外,相关基因的表达导致IFN系统在遗传进化上出现差异,反映了物种间的差异性。本文对Ⅰ型和Ⅲ型IFN在免疫调节以及抗病毒领域方面的研究进展作一综述,以期为今后IFN介导相关免疫的研究提供参考。
- 金丽金丽周建华马忠仁(审校)
- 关键词:干扰素天然免疫系统信号转导
- 烟台黑猪SLA-DQB基因外显子2多态性及其与仔猪腹泻的关联分析被引量:5
- 2016年
- 采用PCR-RFLP方法对烟台黑猪DQB基因外显子2的多态性进行研究,并对该位点与仔猪腹泻的关联进行了分析。结果表明,在烟台黑猪DQB基因外显子2上共检测出4种等位基因(A、B、C、D),7种RFLP带型(AA、BB、CC、AB、AC、BC、AD),该位点具有较丰富的多态性。卡方适合性检验显示,烟台黑猪的DQB基因外显子2没有达到Hardy-Weinberg平衡(P<0.05)。最小二乘法分析结果表明,烟台黑猪的性别和DQB外显子2的基因型均对仔猪腹泻无显著影响(P>0.05),而性别与基因型的互作效应对仔猪腹泻具有极显著的影响(P<0.01),在公猪群体中,AD基因型仔猪腹泻评分高于AA基因型个体(P<0.05),在母猪群体中BB、AC、BC、CC基因型仔猪腹泻评分高于其他基因型仔猪(P<0.05)。
- 母童王国梅杨启瑞金丽张海龙张丽田晓静刘丽霞
- 关键词:SLA-DQB仔猪腹泻PCR-RFLP多态性
- 八眉猪DQB基因多态性及其与仔猪腹泻的相关性研究被引量:3
- 2016年
- 为了探讨SLA-DQB基因作为猪抗病育种辅助选择标记的可能性,试验采用PCR-RFLP方法对八眉猪SLA-DQB基因外显子2的多态性及其与仔猪腹泻的相关性进行研究。结果表明:八眉猪SLA-DQB基因外显子2多态性并不丰富,仅检测出3个等位基因和5种基因型,其多态信息含量为0.23,遗传杂合度仅为0.24;八眉猪DQB基因外显子2变异程度比较低。该群体偏离了HardyWeinberg平衡(P<0.01)。仔猪腹泻与性别不相关(P>0.05),与DQB基因外显子2的基因型之间呈现极显著相关(P<0.01),AA和AB基因型腹泻评分均极显著高于AC、BB和CC基因型(P<0.01)。不同性别DQB外显子2的基因型对仔猪腹泻的影响不同。在公猪中,AB基因型个体的腹泻评分高于AA、AC、BB、CC个体(P<0.05);而在母猪中,AA和AB腹泻评分极显著高于AC、BB和CC(P<0.01),可见性别影响了DQB外显子2基因型与腹泻之间的关系。说明八眉猪DQB基因外显子2多态性较低,其基因型对仔猪腹泻有影响,可作为猪抗病育种的选择标记。
- 王国梅母童金丽张海龙张丽田晓静刘丽霞
- 关键词:八眉猪仔猪腹泻
- 关于机体抵抗戊型肝炎病毒的免疫机制研究进展被引量:2
- 2020年
- 戊型肝炎(Hepatitis E,HE)是HE病毒(HEV)引起的以粪-口途径传播为主的传染性疾病,该病毒所引起的临床感染症状主要表现为急性肝炎[1]。其病原HEV是一种单股正链的RNA病毒,目前已经发现8种HEV基因型(HEV-1~HEV-8),其中HEV-1和HEV-2只能感染人类,而HEV-3和HEV-4的侵染宿主谱很广(包括人、家畜以及野生动物)。
- 金丽金丽苏强张德荣张德荣张德荣刘俊林胡永浩李倬
- 关键词:急性肝炎RNA病毒戊型肝炎HEV
- PEDV N蛋白的原核表达纯化及B细胞抗原表位预测分析被引量:3
- 2020年
- 本研究旨在对猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)N基因进行克隆构建、表达与其B细胞抗原表位性质的预测。将PEDV的N基因进行PCR扩增,克隆到原核表达载体pET-28a(+)中,经酶切验证获得阳性克隆,将阳性克隆在表达菌E.coli BL21(DE3)中表达。通过对表达条件及纯化条件的优化,获得高纯度表达蛋白。利用生物信息同源模型化软件Swiss-Pdb Viewer建立PEDV-N蛋白的3D结构,并根据生物信息学软件DNA-Star预测PEDV-N蛋白的二级结构、抗原性、亲水性和表面可及性分析,综合分析预测其B细胞抗原表位。经预测PEDV-N蛋白氨基酸序列中存在13个B细胞优势抗原表位区域。研究结果将进一步为PEDV-N蛋白体外表达产物的应用及研制基因工程疫苗提供理论基础。
- 郭富城金丽金丽粟雨芯李方琳陈士恩陈士恩
- 关键词:猪流行性腹泻病毒N蛋白
- 小反刍兽疫病毒宿主细胞受体的研究进展
- 2022年
- 小反刍兽疫(PPR)是由小反刍兽疫病毒(PPRV)引起的一种接触性的病毒性传染病是我国农业农村部规定的、已被列入世界卫生组织的Ⅰ类动物疫病之一,主要宿主是绵羊和山羊。小反刍兽疫在世界范围内广泛传播,危害严重,其发病率高达1 00%,并且病死率占90%~100%,其对养殖业的发展造成严重的经济损失。目前,PPRV有两种已知的细胞受体,即淋巴细胞信号活化分子(SLAM)和脊髓灰质炎病毒受体4(Nectin-4),为防止PPRV在全世界范围内传播,研究人员需要深入了解病毒与宿主受体的相互作用关系,而PPRV受体及其诱导免疫抑制的机制研究是控制PPR的关键。因此本文针对PPRV细胞受体与病毒宿主的相互作用以及与麻疹病毒相关的其他病毒诱导的免疫抑制等问题进行阐述。
- 王慧慧金丽蒲飞洋李易聪程燕
- 关键词:麻疹病毒PPRV免疫应答
- 牛病毒性腹泻病毒Npro蛋白的原核表达及裂解效率被引量:4
- 2019年
- 为了研究牛病毒性腹泻病毒N pro蛋白的催化切割效率,首先扩增GSTZ毒株的N pro基因,克隆至原核表达载体pET-28a(+)上,使其在表达菌E.coli BL21(DE 3)中表达,确定正确的N pro基因碱基序列,然后构建含有切割位点的pET-28a-N pro-GFP重组融合质粒,在原核表达系统中研究Npro蛋白的切割效率。结果显示,GSTZ毒株的N pro蛋白成功地在原核表达系统中表达,重组融合蛋白质N pro-GFP在原核表达系统中的切割效率约为60.28%。
- 常秋燕郭富城冶昡青李凌浩王悦萦刘萍苏强马鹏马鹏李林杰马晓霞金丽
- 关键词:牛病毒性腹泻病毒原核表达
- 八眉猪SLA-DRA基因第2外显子多态性分析被引量:3
- 2016年
- 为了解八眉猪SLA-DRA基因第2外显子的多态性,采用PCR-SSCP和克隆测序的方法对八眉猪SLADRA基因第2外显子进行分型,并对不同等位基因进行核苷酸与氨基酸序列分析。结果显示,222头八眉猪中共检出2种等位基因(A和B)和3种基因型(AA,BB和AB),其中A等位基因和AA基因型的频率最高,为优势基因和优势基因型。对不同SSCP带型的对应片段进行测序分析,发现该基因仅有一个核苷酸突变位点(c.3093 A→C),为错义突变,使甲硫氨酸(Met)变为亮氨酸(Leu),并且该氨基酸位于抗原结合位点上。群体遗传学分析发现,八眉猪遗传杂合度(He)为0.351 4,多态信息含量(PIC)为0.308 8,且经χ2适合性检验,八眉猪在此位点上没有偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。八眉猪SLA-DRA基因第2外显子的多态性较低。
- 金丽谭小音母童王国梅张丽刘丽霞
- 关键词:八眉猪PCR-SSCP