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张瑞
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1
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供职机构:
哈尔滨医科大学
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发文基金:
国家自然科学基金
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相关领域:
医药卫生
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合作作者
韩晓乐
哈尔滨医科大学
刘永晶
哈尔滨医科大学
张强
哈尔滨医科大学
赵宁
哈尔滨医科大学
许艳
哈尔滨医科大学
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2017
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基于miRNA-TF调控网络识别乳腺癌亚型关键调控子
2017年
目的挖掘乳腺癌各亚型关键调控子并评估其预后能力。方法整合TCGA数据库中乳腺癌样本基因表达、拷贝数变异和DNA甲基化数据,分亚型筛选癌症相关基因。以此为基础,挖掘各亚型的四类motif,将同亚型四类motif合并构建各亚型miRNA-TF调控网络。随后,挖掘每个网络hub节点,并对其预后能力进行评估。结果各调控网络中的10个hub miRNA分别为乳腺癌亚型关键调控子。结论基于miRNA-TF调控网络能有效识别出乳腺癌亚型预后相关生物标志物。
韩晓乐
赵宁
刘永晶
严自创
张强
周元帅
张瑞
许艳
关键词:
MIRNA
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