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方正: 作品数：19 被引量：28H指数：3; 供职机构：贵州师范大学生命科学学院更多>>; 发文基金：国家自然科学基金贵州省优秀科技教育人才省长资金项目贵州省优秀青年科技人才计划更多>>; 相关领域：农业科学生物学环境科学与工程文化科学更多>>

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织金洞洞穴细菌多样性及PICRUSt基因预测分析: 喀斯特洞穴具有恒温、寡营养和黑暗等特点,是一个相对封闭或半封闭的特殊生态环境.微生物是洞穴生态系统中的重要组成,在能量代谢和物质循环中起重要作用,对沉积物及洞穴发育形成具有促进作用.织金洞是高原喀斯特地貌的典型集中发育区...; 翁庆北董乙乂方正吴庆珊贺鹏亮陈千权牛晓娟王玉倩; 关键词：织金洞细菌群落

织金洞钟乳石沉积物表面可培养细菌多样性和网络分析: 2021年; 【背景】洞穴环境中蕴含丰富而独特的细菌资源,对洞穴环境中细菌的分离培养有助于了解洞穴细菌多样性及细菌资源的挖掘和利用。【目的】利用不同培养基分离细菌,探究钟乳石表面可培养细菌的多样性及其种间互作关系。【方法】通过11种培养基对织金洞内钟乳石沉积物表面的细菌进行分离纯化,并利用16S rRNA基因序列分析初步确定分离菌株的分类地位。在R软件下,通过Bipartite包分析可培养细菌属间的相互作用。【结果】从钟乳石沉积物表面共分离出206株细菌,它们隶属于4门25属45种,香农(Shannon)指数为4.78,辛普森(Simpson)指数为0.95。变形菌门(Proteobacteria)和芽孢杆菌属(Bacillus)分别为样品中可培养细菌的优势门(47.09%)和优势属(29.61%)。无机寡营养培养基有助于洞穴钟乳石沉积物细菌的分离。属水平-采样点网络分析表明,可培养细菌分布具有非随机、显著的嵌套性。芽孢杆菌属(Bacillus)、德沃斯氏菌属(Devosia)、产碱杆菌属(Alcaligenes)、节杆菌属(Arthrobacter)和短杆菌属(Brevibacterium)在细菌群落中存在较多的有效合作值(Effective Partners)和亲密度(Closeness),被其他细菌所依赖程度(Species Strength)较高,是该群落中的重要组成类群。【结论】织金洞内钟乳石沉积物表面存在丰富的细菌资源,分析细菌类群在群落中的作用应结合细菌相对丰度和网络分析。; 杨珺董乙乂吴庆珊方正牛晓娟王玉倩翁庆北; 关键词：钟乳石沉积物可培养细菌多样性织金洞网络分析

云台山白云岩表层土可培养细菌多样性被引量：5: 2015年; 运用纯培养法和基于16S rRNA基因序列的系统发育分析贵州云台山白云岩表层土可培养细菌的多样性.稀释涂布平板分离共获得131株细菌,限制性内切酶HhaⅠ和HaeⅢ对扩增的16S rRNA基因片段进行酶切分型,根据ARDRA酶切图谱划分为40个操作分类单元.16S rRNA基因序列测定和系统发育分析结果显示,这些菌株隶属于包括厚壁菌门(Firmicutes,64.89%)、β-变形菌纲(β-Proterbacteria,3.82%)、γ-变形菌纲(γ-Proterbacteria,17.56%)、放线细菌门(Actinobacteria,11.45%)和拟杆菌门(Bacteroidetes,3.82%)等5大类群,共13个属.优势菌群为芽胞杆菌属(Bacillus,53.44%),亚优势菌群为寡养单胞菌属(Stenotrophomonas,9.16%)、假单胞菌属(Pseudomonas,8.40%)和微小杆菌属(Exiguobacterium,8.40%).15.00%的有效序列与Gene Bank已知序列相似性小于等于97%,可能为潜在新类群.研究表明,云台山白云岩喀斯特地区不仅含有较为丰富的细菌物种多样性,且潜藏着许多新的微生物资源.; 王玉倩潘舟强翁庆北肖炜龚敏卢玉兵陈晓旺李敏方正; 关键词：白云岩可培养细菌 RRNA 多样性

甜菜夜蛾核多角体病毒潜伏感染昆虫细胞研究: 病毒持续感染在野外昆虫宿主种群中普遍存在。在某些条件刺激下，持续感染可转变为增殖性感染，并引发流行病。杆状病毒持续感染对昆虫种群动力学以及病毒流行病学的研究具有重要意义。在某些条件刺激下,持续感染可转变为增殖性感染,并引...; 翁庆北方正邵景许李敏; 关键词：生物防治甜菜夜蛾核多角体病毒昆虫细胞

5株解钾菌解钾能力和抗旱效应的比较被引量：1: 2020年; 为筛选适用于制备干旱地区生物菌肥的解钾菌,以钾长石粉作为唯一钾源,研究5株解钾菌(LG1、LG8、WG33、WG36和WG40)的解钾能力,将5株解钾菌的发酵液接种到玉米幼苗,模拟干旱,研究其对玉米幼苗抗旱性的影响。结果表明,5株菌株都具有一定的解钾能力,大小顺序为WG33>LG1>WG40>WG36>LG8,WG33的解钾能力最强,经过发酵培养后其上清液中可溶性钾含量达到7.73 mg/L。接种5株解钾菌后,进行干旱处理,玉米幼苗株高增幅均大于对照,丙二醛含量降低、过氧化物酶(POD)和超氧化物歧化酶(SOD)活性提高,说明5种解钾菌均可提高玉米幼苗的抗旱性。; 冯晓英周桂雄吴庆珊方正王玉倩牛晓娟翁庆北; 关键词：玉米抗旱效应

金钗石斛根际土壤放线菌的分离及抑菌活性筛选被引量：4: 2018年; 采用6种培养基对金钗石斛(Dendrobium nobile Lindl.)根际土壤放线菌进行了分离,通过16S r DNA序列分析对分离菌株进行初步鉴定。以大肠杆菌(Escherichia coli)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)、金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、白色念珠菌(Candida albicans)、马铃薯晚疫病菌(Phytophthora infestans)和灰葡萄孢(Botrytis cinerea)为指示菌,测定分离菌株的抑菌活性。结果显示:从金钗石斛根际土壤中分离获得164株放线菌,并划分为10个不同操作单元(Operational taxonomic units) OTUs,分别隶属于纤维菌属(Cellulosimicrobium)和链霉菌属(Streptomyces),其中,链霉菌属为优势属,占分离菌株的93. 90%;获得的164株放线菌中有19株链霉菌属菌株具抑菌活性,占分离菌株的11. 58%,其中菌株g62和G29对枯草芽孢杆菌、大肠杆菌、金黄色葡萄球菌等细菌均表现出显著的抑菌活性,H2对枯草芽孢杆菌、大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、白色念珠菌和灰葡萄孢均具有抑菌活性,可见,g62、G29和H2具有广谱抑菌活性。; 方正詹伟詹伟安忠琦牛晓娟牛晓娟张传博; 关键词：金钗石斛根际土壤放线菌链霉菌属抑菌活性

甘蓝型油菜HIPPs基因家族的鉴定与表达分析被引量：1: 2022年; 重金属相关异戊二烯化植物蛋白(HIPPs,heavy metal-associated isoprenylated plant proteins)是金属离子在植物细胞内安全运输的关键蛋白,在植物体金属离子稳态的维持过程中发挥重要作用。目前关于HIPPs基因家族的研究多集中于模式植物水稻(Oryza sativa L.)和拟南芥(Arabidopsis thaliana (L.) Heynh.),在甘蓝型油菜(Brassica napus L.)中报道相对较少。本研究通过生物信息学的方法在甘蓝型油菜全基因组(Darmor-bzh v10)中鉴定到了不均匀分布在19条染色体上的104个BnaHIPPs基因。蛋白理化性质分析发现其氨基酸数目在120~630 aa,蛋白分子量在13827.56~64467.05 ku,平均等电点为8.07,蛋白平均疏水指数在-1.146~-0.17之间。基因表达模式分析发现它们在不同组织和发育时期的表达模式具有一定的时空表达特性,在根中的表达量最高。镉胁迫处理条件下BnaHIPPs的表达模式发生了改变,BnaA08p24150、BnaA09p41730和BnaC06p45180在根和叶片中的相对表达水平都发生了上调。系统进化关系显示BnaHIPPs基因被分为5个亚家族。此外,共线性分析显示在BnaHIPPs基因的进化过程中,大多数的BnaHIPPs都是以片段复制的形式参与BnaHIPPs基因家族的扩张过程,仅发现BnaC05p3800、BnaC05p3810、BnaC05p3820和BnaC05p3830以串联重复的形式参与BnaHIPPs的复制事件。本研究结果将为甘蓝型油菜BnaHIPPs基因家族的进一步研究奠定基础。; 钱方胡利娟余婕冯群左丹方正朱斌伍晓明; 关键词：甘蓝型油菜重金属基因表达

高效纤维素降解菌的分离筛选: 堆肥是目前处理畜禽粪便最有效的方法.但由于堆体中富含纤维素,传统堆肥时间长,影响堆肥效率,在堆肥过程中加入高效纤维素降解菌是提高堆肥效率的有效途径.本研究采用刚果红透明圈法和滤纸条崩解试验,从牛粪、羊粪、菌渣、腐烂秸秆等...; 贺鹏亮吴庆珊方正牛晓娟陈千权王玉倩翁庆北; 关键词：纤维素降解菌酶活力青霉属

生物化学与分子生物学实验教学改革与探讨被引量：3: 2020年; 实验教学是每门生物学课程的必要补充,生物化学及分子生物学实验是各生物学实验门类的基础,现有实验方案中实验设计不太理想,且部分实验涉及危化品。为了在传统实验教学基础上优化实验方案和教学内容,通过增加学生自主设计性实验,同时采用优化实验设计的方式避免危化品,使生物化学及分子生物学实验教学更为安全和高效。; 方正翁庆北; 关键词：生化教改

金钗石斛根际可培养细菌多样性及抑菌活性研究被引量：6: 2018年; 根际土壤微生物对植物根系发育和植物生长具有重要促进作用.为探究金钗石斛根际土壤细菌的多样性,利用稀释涂布平板法和16S r DNA序列分析技术,对贵州贵阳、金沙和赤水三地栽培的金钗石斛根际土壤中的细菌进行分离和初步鉴定.同时,通过双层平板打孔法和对峙培养法筛选具抑菌活性菌株.结果表明,从金钗石斛根际土壤共分离了1010株细菌,包括67个OTUs,隶属于厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门α亚群(aProteobacteria)、变形菌门β亚群(β-Proteobacteria)、变形菌门γ亚群(γ-Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria)的32个属.其中厚壁菌门(54.5%),芽孢杆菌属(Bacillus,44.5%)为优势类群.不同地栽培的金钗石斛根际土壤细菌群落组成存在差异,Shannon-Wiener指数为2.80~2.94.此外,通过筛选共获得23株抑菌活性菌株,其中,JCSHGTTB03-24和CYSHGTR2A05-20两株菌对多种植物病原菌具抑菌活性.金钗石斛根际土壤细菌具丰富的多样性和潜在的生物活性.研究为今后金钗石斛栽培和农业生物防治提供了宝贵的微生物资源.; 安忠琦詹伟吴庆珊方正王玉倩余天华翁庆北; 关键词：金钗石斛根际细菌抑菌活性

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