任世龙
- 作品数：14 被引量：18H指数：3
- 供职机构：河北省农林科学院更多>>
- 发文基金：国家现代农业产业技术体系建设项目河北省优秀专家出国培训基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 谷瘟病菌无毒基因PWL家族检测及变异分析被引量：1
- 2020年
- 为了确定不同地区谷瘟病菌群体中无毒基因PWL家族的分布和变异情况,从全国谷子主产区的不同区域采集分离了252株谷瘟病菌单孢菌株,提取基因组DNA,参考目前已知稻瘟病菌中无毒基因PWL家族的核苷酸序列开发合成了5对引物,通过PCR扩增对252株谷瘟病菌进行PWL家族基因检测,并对扩增片段进行测序分析。结果表明,252个谷瘟病菌菌株都不包含PWL1基因,65个菌株包含出PWL2基因,扩增率25.8%,252个菌株都包含PWL3与PWL4基因,扩增率100%。谷瘟病菌PWL3基因与稻瘟病菌中同源基因相比,在基因编码区存在849 bp的碱基插入,插入片段与non-LTR retrotransposon:MGL的相似度为96.7%,利用此差异可通过PCR技术快速区分谷瘟病菌与稻瘟病菌。谷瘟病菌PWL2基因存在多处单核苷酸变异,通过分析将其划分14个单倍型,分别为P1~P14。单倍型P1占绝对优势包含46个菌株,以此为基础衍生出其他主要单倍型,其次为单倍型P12包含7个菌株,并且多地区都存在特异性单倍型,说明我国谷瘟病菌种群具有较高的遗传多样性。谷瘟病菌中不存在PWL1无毒基因,PWL2无毒基因仅存在部分菌株中,PWL3和PWL4无毒基因存在所有谷瘟菌株中,PWL3和PWL4无毒基因对应的抗病基因在谷子上有重要的应用价值。
- 申浩冉白辉任世龙王璐王永芳全建章董志平李志勇
- 关键词：谷子基因克隆无毒基因
- 利用SRAP分子标记分析谷瘟病菌遗传多样性
- 2023年
- 了解谷瘟病菌的变异和群体结构,为今后谷瘟病的防控及抗病品种培育提供理论基础。利用20对SRAP引物对采自9个地区的90株谷瘟病菌菌株进行了PCR扩增,利用NTSYSpc-2.11F软件进行数据分析,通过UPGMA方法进行聚类分析,使用Popgene 32软件计算各群体间的遗传多样性指数。结果表明,筛选出了8对引物用于谷瘟病菌的遗传多态性分析,这8对引物共扩增出条带1728条,其中多态性条带1492条,多态性比率为86.34%。对90株病原菌进行聚类分析,其相似性系数为0.77~0.85,遗传相似系数为0.802时,所有菌株被分为27个遗传宗谱(L1~L27),其中L1为绝对优势组群,共包含来自山东、河北、山西、河南和辽宁5个省份的29株谷瘟病菌,占总菌株的32.22%。经Popgene 32软件计算分析,9个地区谷瘟病菌的Nei′s遗传多样性指数(H)为0.1414~0.2881,Shannon′s信息指数(I)为0.1960~0.4416,河北夏谷区Nei′s遗传多样性指数和Shannon′s信息指数最高,遗传多样性最丰富,而海南群体遗传多样性最低。对不同地区谷瘟病菌群体比较,吉林群体与海南群体的遗传亲缘关系最远,而河北夏谷区群体与河北春谷区群体的亲缘关系最近。可见,不同地区谷瘟病菌的遗传多样性丰富,各菌株间存在遗传分化,但菌株间的遗传分化与地理来源无明显相关性。
- 刘佳张梦雅任世龙王永芳马继芳全建章刘磊董志平白辉李志勇
- 关键词：谷子SRAP
- 谷瘟病菌交配型基因克隆和不同地区交配型基因检测被引量：3
- 2018年
- 为明确我国谷子产区谷瘟病菌交配型基因及其分布情况对谷瘟病菌群体结构分析的重要意义。根据已知稻瘟病菌交配型基因MAT1-1-1(Gen Bank登录号AB080672.2)和MAT1-2-1(Gen Bank登录号AB080673.2)的部分序列设计3对特异性引物,利用PCR技术对186株谷瘟病菌交配型基因进行扩增检测,比对分析谷瘟病菌和稻瘟病菌的交配型基因MAT1-1-1的alpha盒子部分氨基酸序列和MAT1-2-1高迁移率蛋白盒子氨基酸序列。结果显示,引物JPX1-1-S3/JPX1-1-A3对谷瘟病菌交配型基因MAT1-1-1的扩增效果较好,而JPX1-2-S1/JPX1-2-A1对谷瘟病菌交配型基因MAT1-2-1的扩增效果较好。序列比对发现谷瘟病菌与稻瘟病菌交配型基因极为相似,但并不完全相同。对2010-2016年采自河北、山东、山西、陕西、吉林、黑龙江、辽宁、内蒙古、新疆和海南等采集地点的共186株谷瘟病菌单胞菌株的交配型基因进行检测,发现夏谷区交配型为MAT1-1的谷瘟病菌占69.15%,而交配型为MAT1-2的菌株仅占26.60%,其余4.25%菌株为双交配型菌株。春谷区交配型为MAT1-1的谷瘟病菌占38.55%,而交配型为MAT1-2的菌株仅占56.63%,其余4.82%菌株为双交配型菌株。建立了谷瘟病菌交配型基因PCR检测体系,通过该方法检测多数谷子种植区存在MAT1-1与MAT1-2 2种交配型的谷瘟病菌菌株,且总体上2种交配型菌株比例接近1∶1。但不同地区交配型菌株所占比例有一定差异,并且自然界中存在谷瘟病菌两性菌株。快速检测谷瘟病菌的交配型等位基因和不同区域谷瘟病菌交配型基因分布对研究谷瘟病菌群体结构与遗传分析具有重要意义。
- 任世龙杨振立白辉王永芳全建章董志平李志勇邢继红
- 关键词：交配型PCR检测
- 谷子种子白发病菌带菌检测及种群多态性分析被引量：3
- 2019年
- 为检测不同地区谷子种子携带白发病菌Sclerospora graminicola的情况以及种群多态性,以我国谷子不同主产区收集的95份代表性谷子品种种子为材料,提取种子基因组DNA并作模板,利用白发病菌28S rRNA序列设计特异性引物进行PCR扩增,将所获得的PCR产物测序后与白发病菌28S rRNA序列进行比对。结果表明,特异性引物Sg-28S-403-F/Sg-28S-1221-R对白发病菌具有高度的特异性,扩增出819 bp的特异性目标片段,有效检测灵敏度为0.125 ng/μL。在95份谷子种子中,26份种子检测出特异性扩增条带,所有扩增条带对应序列与白发病菌28S rRNA序列的相似性达98%以上,并且带菌种子全部来自春谷区。分析26份阳性样品的28S rRNA序列,得到58个变异位点和34种单倍型,其中单倍型SG2出现频率最高,内蒙古、陕西、山西、河北和辽宁省区的白发病菌都具有该单倍型,表明不同地理来源的白发病菌28S rRNA序列存在差异,SG2为优势单倍型。
- 宋振君李志勇王永芳任世龙白辉董志平
- 关键词：种子带菌单倍型
- 中国不同地理来源谷瘟病菌rDNA-IGS序列分析被引量：8
- 2017年
- 由谷瘟病菌引起的谷瘟病是我国谷子的主要病害之一,谷瘟病发生可造成谷子大量减产。为了研究谷瘟病菌群体遗传结构和进化关系,本研究对64个谷瘟病菌的r DNA-IGS序列进行扩增检测和测序分析,结果表明,谷瘟病菌之间IGS序列的长度存在着明显的多态性。进一步序列分析发现,IGS序列中重复单元(GGGGGTGCAGGGTA和CATTTTT)的重复次数的不同是造成序列长度差异的主要原因,并且发现IGS基因序列具有寄主特异性。采用最大似然法对所获得的IGS序列进行系统发育树分析,将谷瘟病菌划分为3个谱系。谷瘟病菌遗传分化明显,具有丰富的多样性,分析表明影响谷瘟病菌IGS基因遗传分化的环境因素主要为寄主因素。研究结果为今后深入研究谷瘟病菌群体遗传结构提供理论支持。
- 任世龙白辉董立董志平全建章李志勇邢继红
- 关键词：谷子基因间隔区多态性
- 一种可以区分谷瘟病菌与稻瘟病菌的PCR检测鉴定方法
- 一种可以区分谷瘟病菌与稻瘟病菌的PCR检测鉴定方法，属于植物真菌分子生物学检测技术领域，包括以下步骤：A、DNA提取：分别提取谷瘟病菌和稻瘟病菌的DNA；B、引物设计：利用谷瘟病菌无毒基因PWL3编码区插入849bp的反...
- 李志勇白辉王永芳任世龙董志平董立马继芳全建章刘磊
- 谷瘟病菌无毒基因鉴定与分析
- 谷瘟病菌(Magnaporthe oryzae)与谷子寄主之间的互作关系和水稻与稻瘟病菌之间一样,符合Flor的"基因对基因"学说.谷瘟病菌在侵染谷子的过程中,谷子所携带的抗病基因与谷瘟病菌无毒基因的编码产物相互作用,进...
- 任世龙白辉王永芳邢继红李志勇董志平
- 关键词：无毒基因
- 利用SRAP标记分析谷瘟病菌遗传多样性
- 由谷瘟病菌(Magnaporthe oryzae)引起的谷瘟病是谷子生产中的重要病害之一,研究不同地区谷瘟病菌群体遗传多样性对了解谷瘟病菌的遗传变异和指导病害防控具有重要意义。本研究采用序列相关扩增多态性(sequenc...
- 李志勇任世龙白辉董志平邢继红
- 关键词：谷子SRAP标记遗传分化
- 文献传递
- 谷瘟病菌无毒基因鉴定与分析
- 谷瘟病菌(Magnaporthe oryzae)与谷子寄主之间的互作关系和水稻与稻瘟病菌之间一样,符合Flor的'基因对基因'学说。谷瘟病菌在侵染谷子的过程中,谷子所携带的抗病基因与谷瘟病菌无毒基因的编码产物相互作用,进...
- 任世龙白辉王永芳邢继红李志勇董志平
- 关键词：无毒基因
- 文献传递
- 一种可以区分谷瘟病菌与稻瘟病菌的PCR检测鉴定方法
- 一种可以区分谷瘟病菌与稻瘟病菌的PCR检测鉴定方法，属于植物真菌分子生物学检测技术领域，包括以下步骤：A、DNA提取：分别提取谷瘟病菌和稻瘟病菌的DNA；B、引物设计：利用谷瘟病菌无毒基因PWL3编码区插入849bp的反...
- 李志勇白辉王永芳任世龙董志平董立马继芳全建章刘磊
- 文献传递
