周蓓
- 作品数：7 被引量：16H指数：3
- 供职机构：新疆医科大学更多>>
- 发文基金：新疆维吾尔自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学农业科学更多>>
- 利用二代测序技术进行近交系小鼠品系验证
- 2021年
- 为了对生产群中的无特定病原体(specific pathogen free,SPF)级近交系小鼠进行遗传质量检测,以确认其品系正确,未发生突变。选取2个品系(Balb/cByJ和C57BL/6J)雌雄各半,共16只小鼠,通过多重靶向多聚酶链反应(PCR),扩增包含112个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点的DNA片段,对其进行二代测序(next-generation sequencing,NGS),获得它们在这些SNP位点的基因型。经二代测序后,得到有效读取数为6118873,每个位点的平均读取数为3631,97个SNP位点在所有的小鼠中都被分型,另外15个SNP位点,至少在1个样本中没有被检出。其中,6个SNP只在一个品系的小鼠中有结果,还有2个SNP只在一种性别的小鼠中有结果。在所有样本中得到的全部SNP分型结果都符合其品系的基因型,且均为纯合子。送检的小鼠遗传特征稳定,利用二代测序技术进行SNP分型,能对近交系小鼠的遗传特性进行快速准确的评估。
- 王勃王忠连军周蓓吕晓敏从美丽赵效国
- 关键词：近交系小鼠单核苷酸多态性
- 甘草酸介导miRNAs对大鼠酒精性肝损伤的保护作用被引量：3
- 2023年
- 目的探讨miRNAs在甘草酸治疗大鼠酒精性肝损伤过程中的作用及其机制。方法将45只雄性SD大鼠随机分成甘草酸组(灌胃56%白酒和甘草酸)、模型组(灌胃56%白酒)和对照组(灌胃蒸馏水),给药8周后采集血液和肝组织。检测血清天冬氨酸氨基转移酶(AST)及丙氨酸氨基转移酶(ALT)水平;提取肝组织RNA,大鼠miRNA芯片检测,对miRNA表达量进行分析,对差异miRNA进行靶基因预测,并采用Gene Ontology(GO)和KEGG Pathway富集分析了解差异miRNA的功能,使用Cytoscape构建差异miRNA-mRNA-Pathway调控网络进一步筛选调控关键miRNA与通路,qRT-PCR对挑选的miRNA进行表达量验证分析。结果与模型组相比,甘草酸组能改善肝组织病变,降低肝血清AST和ALT水平(P<0.05)。通过比较分析甘草酸组和模型组芯片数据,共筛选出差异表达miRNA 13个(P<0.05,fold change≥1.5),其中上调10个,下调3个。差异miRNA靶基因GO分类注释显示,差异miRNA主要与细胞黏附、抗氧化活性、代谢过程、生物过程调控、细胞杀伤、免疫系统等功能相关。差异miRNA靶基因KEGG Pathway通路分析显示,MAPK信号通路、mTOR信号通路、Ras信号通路、Hippo信号通路、PI3K-Akt信号通路、wnt信号通路、细胞凋亡等信号通路可能在甘草酸改善酒精性肝损伤病变过程中发挥着重要的调控作用。结论该研究建立了甘草酸治疗大鼠酒精性肝损伤的miRNA表达谱,提示miR-615、miR-107-3p和miR-292-5p可能在甘草酸治疗酒精性肝损伤过程中起着重要的作用。
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- 关键词：酒精性肝损伤甘草酸MIRNA信号通路
- 高脂血症不同造模方法的比较研究被引量：1
- 2023年
- 目的 探讨3种不同配方对大鼠高脂血症形成时间和稳定程度的影响,寻找简单易行且经济稳定的高脂血症动物模型造模方法。方法 SD大鼠(Sprague Dawley rat, SD rat)64只(雌雄各半),体质量150~200g,随机分为4组,分别给予普通饲料、高脂饲料、高脂乳剂和自制高脂饮物喂养4周,高脂血症动物模型造模成功后,比较其血脂4项指标:高密度脂蛋白胆固醇(high-density lipoprotein cholesterol, HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(low-density lipoprotein cholesterol, LDL-C)、总胆固醇(total cholesterol, TC)和甘油三酯(triglyceride, TG)。结果 高脂饲料喂养、高脂乳剂和自制高脂饮物灌胃大鼠2周,其LDL-C、TC开始变化;灌胃3周,高脂饲料组和自制高脂饮物组大鼠血脂4项开始升高;灌胃4周,高脂乳剂组大鼠血脂4项变化最明显,自制高脂饮物组次之,高脂饲料喂养组大鼠血脂4项指标升高不显著。结论 高脂乳剂灌胃组高脂血症动物模型成模时间最早,模型最稳定。
- 连军热伊麦·穆太力普朱虎虎周蓓赵效国
- 关键词：高脂饲料高脂乳剂
- miRNAs在大鼠酒精性肝损伤中的作用研究初探
- 2023年
- 目的 探讨miRNAs在大鼠酒精性肝损伤病变过程中的作用及其机制。方法 将30只雄性SD大鼠随机分成模型组和对照组,模型组灌胃56%白酒,对照组灌胃蒸馏水,连续8周;解剖取肝组织,采用大鼠miRNA芯片对肝中miRNAs进行检测,对其表达量进行分析,对差异miRNA进行靶基因预测,并采用Gene Ontology(GO)和KEGG Pathway富集分析了解差异miRNA靶基因的功能,使用Cytoscape构建差异miRNA-mRNA-Pathway调控网络进一步筛选调控关键miRNA与关键通路,RT-qPCR对挑选的miRNA进行表达量验证分析。结果 通过比较分析模型组和对照组芯片数据,共筛选出差异表达miRNA 12个(P<0.05,Fold change≥2),其中上调2个,下调10个。差异miRNA靶基因GO分类注释显示,差异miRNA与信号转导、代谢过程、抗氧化活性、细胞杀伤、酶调控活性、生物调控等生物功能密切相关。差异miRNA靶基因KEGG Pathway通路分析显示,AMPK信号通路、PI3K-Akt信号通路、Hippo信号通路、Wnt信号通路、癌症、自噬、胰岛素抵抗、Ras等信号通路可能在酒精性肝损伤病变过程中发挥着重要的调控作用。通过构建差异miRNA-mRNA-Pathway调控网络筛选出的Hub miRNA和通路有miR-145-5p、miR-107-3p、miR-297、Hippo信号通路、癌症、PI3K-Akt信号通路、AMPK信号通路等。qRT-PCR结果显示挑选验证miRNA表达变化趋势和基因芯片结果一致。结论 本研究建立了大鼠酒精性肝损伤miRNA表达谱,提示miR-145-5p、miR-107-3p及miR-297可能在肝酒精性病变过程中起着重要的作用。
- 从美丽从美丽刘涛周蓓周蓓孙建新
- 关键词：酒精性肝损伤MIRNA靶基因信号通路
- 大鼠酒精性肝损伤模型RNA可变剪切变化分析被引量：4
- 2018年
- 目的了解大鼠酒精性肝损伤模型中RNA的可变剪切变化情况。方法模型组大鼠连续灌服56°白酒8周,对照组给予同等剂量的蒸馏水,采集血液,测定血清丙氨酸氨基转移酶(ALT)及天门冬氨酸氨基转移酶(AST)水平,剖取大鼠肝组织,提取RNA,运用全基因组表达谱芯片检测分析可变剪切变化,采用Gene Ontology(GO)和Pathway富集分析了解差异可变剪切的编码RNA的功能。结果共筛选到4 662个差异可变剪切的RNA(Splicing Index<-3或>3,P<0.05),其中差异可变剪切的编码RNA有3 989个,差异可变剪切的非编码RNA有673个,对差异可变剪切的编码RNA进行GO和Pathway富集分析,结果显示,主要与氧化还原酶活性、氧代谢、外源性转运蛋白活性、脂肪酸的生物合成、脂肪酸的降解、过氧化物酶体、谷胱甘肽代谢等功能或通路有关。结论酒精性肝损伤大鼠模型肝脏组织中存在着大量差异可变剪切的RNA,提示这些RNA的可变剪切可能在肝脏酒精性病变的发生发展中起着重要的作用。
- 从美丽周蓓吕晓敏孙建新赵效国
- 关键词：酒精性肝损伤基因芯片
- 应用基因芯片技术分析甘草酸改善大鼠酒精性肝损伤的作用机制被引量：4
- 2022年
- 目的运用基因芯片技术检测甘草酸对大鼠酒精性肝损伤保护作用的分子机制。方法 45只大鼠随机分为3组:模型组、甘草酸组、正常对照组,连续灌服56度白酒8周,处理动物,测定血清谷丙转氨酶(ALT)和谷草转氨酶(AST)水平;抽提肝脏RNA,全基因组表达谱芯片检测,运用GO和KEGG Pathway富集分析。结果与正常对照组比较,模型组血清AST和ALT含量显著升高,差异有统计学意义(t=7.784,P<0.05;t=11.366,P<0.05),肝组织出现显著的肝损伤;与模型组相比,甘草酸组能显著改善肝组织病变,降低血清AST和ALT含量,差异有统计学意义(t=6.448,P<0.05;t=7.526,P<0.05)。芯片结果分析显示,甘草酸组与模型组共筛选出7 482条差异可变剪切RNA(Splicing Index<-3或>3,P<0.05),其中差异可变剪切编码RNA为6 512条。对差异可变剪切编码RNA进行GO和Pathway富集分析,结果显示,主要与乙醇分解代谢、肝星状细胞活化、氧化还原酶活性、氨基酸合成代谢、脂肪酸的生物合成、Notch信号通路等功能或通路有关。结论甘草酸在改善大鼠酒精性肝损伤病变过程中存在大量差异可变剪切编码RNA,提示甘草酸可通过调节多基因可变剪切改善酒精性肝损伤病变。
- 从美丽古丽拉莱·多力坤周蓓王忠吕晓敏
- 关键词：基因芯片酒精性肝损伤甘草酸
- 对SPF大鼠脱毛实例的饲料影响研究被引量：6
- 2016年
- 目的针对本中心SPF级实验大鼠易发生的脱毛现象分析其原因,以对实验大鼠的养殖管理提供更加科学的建议。方法通过观察本单位SPF实验大鼠脱毛的特点,对生长繁殖群常用大鼠饲料的灭菌效果和营养成分进行检测,结合检测结果改进饲料配方,进行治疗试验并观察效果。结果饲料高压灭菌后维生素和微量元素含量变化量较大,使用辐照灭菌饲料以及将维生素含量调整后大鼠脱毛改善情况最明显。结论饲料经过高压灭菌后营养中的维生素含量损失可能是造成SPF大鼠脱毛的重要原因,在日常饲养中使用辐照饲料更加科学。
- 周蓓从美丽孙建新赵效国
- 关键词：脱毛饲料营养
