孙勇 作品数:12 被引量:68 H指数:4 供职机构: 中国热带农业科学院热带生物技术研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 公益性行业(农业)科研专项 国家重点基础研究发展计划 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 轻工技术与工程 更多>>
蛋白质组学关键技术的优化改进及其在热带作物研究中的应用 王旭初 郭安平 庞永奇 黄启星 王丹 常丽丽 孙勇 易小平 孔华 郭运玲 该项目通过优化改进已有的BPP蛋白提取方法和传统的考马斯亮蓝染色技术,得到适合于含多酚、多糖类热带作物的蛋白提取方法,并发明一种新的GAP凝胶染色技术,提高了蛋白染色的灵敏度和稳定性。同时针对热带地区高温高湿度的环境条件...关键词:关键词:蛋白质组学 品种选育 巴西橡胶树REF/SRPP家族基因的克隆及表达分析 被引量:5 2016年 巴西橡胶树(Hevea brasiliensis)胶乳是天然橡胶的主要来源,橡胶延伸因子(REF)和小橡胶粒子膜蛋白(SRPP)作为胶乳中的两大主要蛋白,被认为参与了橡胶的合成和调控。目前,NCBI蛋白数据库已经登录了巴西橡胶树REF/SRPP家族的6个成员,我们通过研究又获得8个新的REF/SRPP基因家族成员,Hb REF154、Hb REF221、Hb REF296、Hb REF542、Hb SRPP178、Hb SRPP203、Hb SRPP216、Hb SRPP234。这14个成员编码蛋白都具有保守的REF结构域,有两个成员还具有ATP合酶亚基结构域,一个成员具有甲基结合结构域。进化分析显示橡胶树REF/SRPP家族成员与产胶植物REF/SRPP家族成员在进化上较为接近。q PCR分析发现该家族成员都响应割胶刺激表达升高,除Hb REF138外其它成员都响应乙烯处理表达降低。通过shotgun数据分析发现,除Hb REF221外的13个成员都存在于橡胶粒子或C-乳清组分中,Hb REF138、Hb REF154、Hb REF175和Hb REF258主要存在于橡胶粒子中,Hb REF542、Hb SRPP216是橡胶粒子中所特有的,Hb REF296和Hb SRPP200是C乳清中所特有的。该研究结果揭示了REF/SRPP家族成员及其基本的表达特性,为深入研究该家族成员在巴西橡胶树产胶中的具体作用提供了一定的基础。 冯伟强 仝征 靳翔 王丹 孙勇 蒙雪茹 王旭初关键词:巴西橡胶树 SRPP 克隆 基因表达 一种适用于胰蛋白酶解磷酸化多肽的富集方法 本发明公开了一种适用于胰蛋白酶解磷酸化多肽的富集方法,使用TiO<Sub>2</Sub>作为吸附用介质,使用除杂液对吸附后的TiO<Sub>2</Sub>介质进行分次除杂洗脱,使用洗脱液对除杂后的TiO<Sub>2</S... 王丹 孙勇 仝征 常丽丽 彭存智 徐兵强黑暗条件下木薯叶绿体比较蛋白质组学初步研究 被引量:2 2015年 以"华南8号"木薯叶绿体为研究材料,采用改进酚抽法提取总蛋白,通过一维和二维电泳,经Image Master分析,得到差异蛋白点进行质谱鉴定。结果表明:改进酚抽法可以从木薯叶绿体中提取高质量总蛋白;获得分离性好、分辨率及重复性较高的双向电泳图谱;比较黑暗条件下1,3,5 d木薯叶绿体的蛋白质表达谱,发现186个差异表达蛋白点;经MALDI-TOF MS质谱鉴定,获得28个差异蛋白,这些蛋白主要参与光合作用、碳固定、能量代谢、脯氨酸代谢、胁迫防御等代谢途径。本研究初步阐述了木薯叶绿体在黑暗条件下的蛋白质组变化,在蛋白质水平上鉴定出部分蛋白质的表达可能受光调控。 徐兵强 贺庭琪 王力敏 王丹 孙勇 王旭初 郭安平关键词:暗处理 比较蛋白质组学 质谱 生物质谱技术研究进展及其在蛋白质组学中的应用 被引量:27 2015年 随着蛋白质组学的快速发展,生物质谱技术在蛋白质组学中的应用不断深入,逐渐成为这一领域的核心技术。为系统揭示生物质谱技术在蛋白质组学中的具体应用,综述了生物质谱仪器的快速发展和其在蛋白质鉴定、翻译后修饰和蛋白质定量分析等方面的应用和研究进展。生物质谱技术的进步加快了蛋白质组学研究的进程,但样品的复杂性和庞大数据的处理是生物质谱技术面临的不可避免的挑战。相信随着生物质谱技术的不断完善和改进,它必将会在蛋白质组学研究中发挥更加重要的作用。 杨倩 王丹 常丽丽 孙勇 靳翔 王旭初关键词:质谱技术 蛋白质组学 植物糖基化蛋白质组研究技术策略及研究进展 2016年 综述了植物糖基化研究的主要策略以及植物糖蛋白质组学研究的最新进展,旨在为更好地开展植物糖蛋白质组研究提供技术线索及研究思路。 孙勇 王丹 仝征 常丽丽 王力敏 王旭初关键词:糖蛋白 蛋白糖基化 N-糖链 生物质谱 香蕉枯萎病致病分子机理与防治研究进展 被引量:18 2012年 香蕉枯萎病是一种由尖孢镰刀菌古巴专化型引起的土传毁灭性病害,一直严重危害世界香蕉生产,从而引起广泛关注和深入研究,但其致病机理到目前还不清楚。本文综述了香蕉枯萎病菌侵染寄主的过程、致病毒素的成分分析、致病相关基因、香蕉的抗病性和枯萎病防治等方面的研究进展,为全面、深入地揭示香蕉枯萎病致病的分子机理和开展新的防治途径提供研究方向和思路上的启发。 孙勇 曾会才 彭明 王旭初 易小平关键词:香蕉 香蕉枯萎病 香蕉枯萎病菌 致病机理 香蕉幼苗叶片响应低温胁迫的比较蛋白质组学研究 被引量:13 2015年 香蕉是中国热带地区重要的经济作物,香蕉产业受寒害的影响极为严重。明确香蕉植株响应低温胁迫的分子调控机制有可能为培育和筛选出相对抗寒的香蕉品系提供研究基础。应用比较蛋白质组学对7℃低温处理0、3、5和7天的巴西蕉幼苗叶片总蛋白进行分析,发现有85个蛋白质点的表达丰度在低温胁迫后发现明显变化,通过质谱成功地鉴定了其中的82个蛋白,这些蛋白质主要参与蛋白质的加工及翻译后修饰、糖与能量代谢、光合作用等生理学过程。研究结果暗示低温环境下,香蕉幼苗叶片可能通过改变光合作用相关酶、糖类与能量代谢相关酶的表达量来调节能量与碳代谢,保证碳养分供应及吸收,同时通过超氧化物歧化酶清除系统来提高香蕉抵御低温的能力。研究结果将为研究香蕉抗寒的分子机制提供新线索,为香蕉抗寒育种提供新的候选蛋白。 孙勇 王丹 仝征 杨倩 常丽丽 王力敏 何丽平 王旭初关键词:香蕉叶片 光合作用 低温胁迫 比较蛋白质组学 华南8号木薯块根形成期叶绿体蛋白质组学分析 2015年 以‘华南8号’木薯块根形成期叶绿体为材料,采用改进酚抽法提取总蛋白,通过一维和二维电泳,经Image Master分析,获得了木薯叶绿体的蛋白质表达谱,发现(397±31)个蛋白点;挖取2-DE凝胶上相对丰度较高的蛋白点275个,利用改进的酶解方法进行胶内酶解,经MALDI-TOF MS质谱鉴定,获得208个蛋白点,对应143种蛋白质,这些蛋白主要参与光合作用、光合生物碳固定、氧化还原调节、氨基酸代谢、蛋白质代谢和转运等途径。结果为后期从蛋白质组水平深入研究木薯叶绿体高光效机制提供一定参考。 徐兵强 贺庭琪 王力敏 王丹 孙勇 常丽丽 王旭初 郭安平关键词:木薯 叶绿体 蛋白质组学 质谱 水稻种子蛋白双向电泳方法的建立和质谱初步分析 被引量:1 2015年 为了建立适用于水稻(Oryza sativa L.)种子蛋白质组分析的双向电泳方法,本研究比较了三氯乙酸/丙酮法和改良的酚提取法对水稻种子蛋白的提取效果,不同蛋白提取液上样量、不同p H梯度(p H 3~10和p H 4~7)IPG胶条对水稻种子蛋白的分离效果。结果表明:在目前的双向电泳体系下,采用改良的酚提取法,24 cm p H 4~7线性IPG胶条,上样量1 200~1 500μg的条件可以获得分辨率高、重复性好、胶内蛋白点适用于后续质谱分析的双向电泳图谱。最后本实验通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF-MS)对10个随机挑选的胶内蛋白质点进行了初步蛋白质鉴定分析,进一步确定了改良的酚提取法可以适用于水稻种子蛋白质双向电泳分析。 朱方超 贾瑞宗 孙勇 王雪君 徐林 孔华 郭运玲 郭安平关键词:水稻种子 蛋白组学 双向电泳