廖黎
- 作品数：5 被引量：11H指数：2
- 供职机构：成都大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- 基于RNA-Seq技术分析亚抑菌浓度的四季青对耐药铜绿假单胞菌运动能力的抑制作用被引量：2
- 2022年
- 目的:通过转录组测序(RNA-Seq)技术探究亚抑菌浓度的四季青对耐药铜绿假单胞菌的影响并进行验证。方法:使用Illumina测序平台Illumina HiSeq 3000对四季青处理的耐药铜绿假单胞菌和正常对照组进行转录组测序,采用DEGseq软件分析两组细菌间差异表达基因;通过GOseq R包软件和KOBAS数据库中对差异表达基因进行GO生物富集和KEGG通路分析;体外测定亚抑菌浓度的四季青对耐药铜绿假单胞菌浮泳和蹭性运动抑制作用。结果:与正常对照组比较,亚抑菌浓度的四季青处理后的耐药铜绿假单胞菌有44个基因上调,304个基因下调;这些基因主要富集于鞭毛和纤毛依赖性细胞运动、细胞运动定位、趋化性、细胞呼吸等生物过程以及鞭毛装配、细菌趋化性、双组分系统、氧化磷酸化、TCA循环等通路;体外验证试验中,与正常对照组比较,亚抑菌浓度的四季青对耐药铜绿假单胞菌典型的鞭毛和纤毛介导的运动如浮泳和蹭行运动有显著抑制(P<0.05或P<0.01)。结论:四季青通过多靶点、多通路影响耐药铜绿假单胞菌,其中抑制鞭毛、纤毛及其介导的运动、趋化性等是关键作用机制,阐明了四季青在影响临床耐药铜绿假单胞菌致病性和耐药性等方面的应用潜力,为四季青作为抗耐药菌药物的开发和临床应用提供参考。
- 邹昆廖黎陈婉杨晨赵玉婷王镜雅鲁兰
- 关键词：铜绿假单胞菌转录组学
- 环丙沙星对小鼠肝细胞自噬研究被引量：1
- 2017年
- 目的研究环丙沙星对小鼠肝细胞的自噬作用及基因表达。方法小鼠随机分为对照组和实验组,实验组小鼠给药环丙沙星1周,采用自噬溶酶体荧光探针检测小鼠肝细胞自噬溶酶体,利用全基因组表达谱基因芯片技术筛选差异基因。结果自噬溶酶体荧光探针检测到实验组小鼠肝细胞荧光强度降低,全基因组表达谱芯片技术发现Akr1b7/Pfkfb3调节果糖及甘露糖代谢信号通路有统计学显著差异(P<0.05)。结论环丙沙星(13.5g/kg)抑制小鼠肝细胞自噬,Pfkfb3基因可能是环丙沙星给药后影响自噬以及糖代谢的靶点之一,并且可能是通过AMPK/m TORC1途径影响自噬。
- 周萍樊静梁韡袁小艳廖黎张舒
- 关键词：自噬小鼠肝细胞环丙沙星基因芯片
- 酶解法提取川贝母组培物总生物碱被引量：1
- 2016年
- 为了研究四川道地名贵药材川贝母及其组织培养物有效药用成分总生物碱的提取和含量测定方法,以及总生物碱含量的变化规律。利用纤维素酶酶解细胞壁中纤维素促进生物碱溶出原理,以酶解温度(A)、p H值(B)、酶用量(C)和酶解时间(D)为影响因素进行总生物碱的酶解法正交提取试验,结合饱和Ca(OH)2溶液浸渍和乙醇回流法提取生物碱;通过酸性染料比色法测定总生物碱含量。结果表明,总生物碱的酶解法最佳提取工艺为A3B3C2D1,采用酶解法最佳提取工艺,川贝母及其组织培养物总生物碱提取得率分别提高28.74%、42.86%,川贝母组培物的总生物碱含量超过川贝母114.07%。酶解法提高了川贝母有效药用成分总生物碱的得率,经过研发得到的川贝母组织培养物总生物碱含量呈现快速增长规律,为以名贵道地药材川贝母的新药研发奠定了理论和应用基础。
- 廖黎樊荣徐文俊刘昆王跃华
- 关键词：川贝母总生物碱酶解法正交试验
- 川贝母组培物总生物碱的体外抑菌试验被引量：4
- 2016年
- 为了研究四川名贵道地药材川贝母及其组培物的有效药用成分总生物碱含量与其体外抑菌作用强弱变化规律,采用酶解法与乙醇回流法结合提取生物碱,通过酸性染料比色法测定总生物碱含量,选取典型ATCC质控菌株和临床分离致病菌株作为供试菌,采用牛津杯法测定生物碱对供试菌株的抑菌圈大小,采用96孔板两倍稀释法,测定生物碱对供试菌株的最低抑菌浓度MIC并同时测定最低杀菌浓度MBC.结果显示:川贝母组培物的总生物碱含量超过川贝母的114.07%;川贝母组培物总生物碱含量的快速增长与其体外抑菌作用强弱呈现正比例关系.
- 廖黎樊荣徐文俊刘昆范小燕
- 关键词：川贝母总生物碱体外抑菌试验
- 铜绿假单胞菌生物被膜基因表达生物信息学研究被引量：3
- 2022年
- 目的通过生物信息学探究铜绿假单胞菌生物被膜形成的差异表达基因及可能作用机制。方法通过GEO数据库筛选获得铜绿假单胞菌生物被膜数据芯片GSE120760,GEO2R工具筛选出铜绿假单胞菌浮游状态和生物被膜状态的差异表达基因;差异表达基因通过String数据库和Cytoscape3.7.1软件中构建靶点PPI网络图,并在DAVID和KOBAS数据库中对差异表达基因进行GO生物富集和KEGG通路分析。用铜绿假单胞菌体外生物被膜模型测定5种氨基酸(D/L型)的抗生物被膜作用效果。结果由芯片GSE120760筛选得到556个差异表达基因,其中上调基因143个,下调基因413个;从差异表达基因中筛选到62个关键基因,这些基因主要与30S和50S核糖体蛋白相关;GO功能富集得到40个条目;KEGG富集到44条通路,主要涉及代谢途径、次生代谢产物的生物合成、氨基酸生物合成通路、多种氨基酸代谢、群体感应、氨酰tRNA生物合成通路等;体外验证试验中,D-氨基酸对铜绿假单胞菌生物被膜有抑制作用,而L-氨基酸对其形成无影响。结论通过生物信息学挖掘出铜绿假单胞菌生物被膜形成的关键基因与靶点,并与代谢途径、氨基酸合成和代谢、群体感应、氨酰tRNA生物合成通路等相关,为铜绿假单胞菌生物被膜的靶向抗感染药物的研发提供思路。
- 廖黎鲁兰杨晨刘昆赵玉婷
- 关键词：铜绿假单胞菌生物被膜生物信息学差异表达基因D-氨基酸L-氨基酸
