李晓云
- 作品数：1 被引量：1H指数：1
- 供职机构：江苏大学基础医学与医学技术学院血液学与血液学检验系更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- URI1蛋白生物信息学分析及在人体组织中的表达被引量：1
- 2013年
- 目的分析人非经典前折叠素RPB5相互作用因子1(URI1)蛋白的特性、结构和变异体,观察URI1蛋白在人组织中的表达。方法通过多种网络分析工具,预测和分析URI1的基本特性及结构。用人组织微阵列免疫组化染色方法检测其在多种组织/细胞中的表达。结果 URI1编码1个535个氨基酸的蛋白质,该蛋白质性质不稳定,无跨膜片段,N末端无信号肽,非分泌型蛋白质,其mRNA在组织中广泛表达。URI1具有11个潜在的泛素化位点,其中6个为高度可信,5个为中度可信。有48个潜在的磷酸化位点(35个在丝氨酸位、11个在苏氨酸位、2个在酪氨酸位)。在第287氨基酸位有一糖基化位点,在第291、371氨基酸位也可能发生糖基化修饰,未发现乙酰化位点。蛋白质结构预测α螺旋(H)占39.63%,N端具有1个PFD功能域。URI1在多种组织/细胞广泛表达并存在明显差异表达,与基于高密度微阵列技术的BioGPS mRNA表达谱数据吻合。结论用生物信息学技术预测了URI1蛋白的结构和功能,为URI1蛋白的相关研究提供了信息。
- 谷俊侠冉德园梁玉婷乔龙威李晓云吕耀娟郑其平
- 关键词：变异体生物信息学
