林权卓
- 作品数：5 被引量：36H指数：3
- 供职机构：华南农业大学动物科学学院更多>>
- 发文基金：广东省科技计划工业攻关项目广东省海洋渔业科技推广专项项目农业部渔业生态环境重点开放实验室开放基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 双棘黄姑鱼IGF2基因克隆及其在卵巢发育中的作用研究被引量：7
- 2015年
- 运用RT-PCR和RACE技术,首次克隆了双棘黄姑鱼(Protonibea diacanthus)的IGF2 cDNA。双棘黄姑鱼IGF2cDNA全长842bp,其中开放阅读框为648bp,5′非翻译区为125bp,3′非翻译区为69bp。IGF2前体mRNA编码215个氨基酸,成熟肽为71个氨基酸残基的多肽。多重氨基酸比对结果显示,双棘黄姑鱼与其他鱼类IGF2氨基酸序列高度保守。同源性分析表明,双棘黄姑鱼IGF2氨基酸序列与同属鲈形目的斜带石斑鱼、金头鲷、罗非鱼同源性分别为95.8%、95.3%和91.2%。系统进化树结果与同源性分析结果相似,双棘黄姑鱼IGF2基因首先与同属鲈形目的斜带石斑鱼、金头鲷、罗非鱼类聚,再与虹鳟、牙鲆、黄颡鱼的IGF2和斑马鱼IGF2b基因聚为一支,最后与斑马鱼IGF2a类聚为鱼类IGF2基因。组织分布结果表明,IGF2基因在双棘黄姑鱼各组织中表达广泛。RT-PCR结果显示,双棘黄姑鱼卵巢成熟期和退化期的IGF2表达量显著高于发育期,推测IGF2的表达可能促进了双棘黄姑鱼卵巢的成熟。
- 林权卓沈卓坤杨宪宽王树启赵会宏
- 关键词：双棘黄姑鱼基因克隆
- 珠江和长江水系赤眼鳟D-loop基因序列遗传变异分析被引量：8
- 2012年
- 利用PCR技术扩增得到珠江和长江水系共29个赤眼鳟(Squaliobarbus curriculus)线粒体DNA D-loop基因片段,并测定其序列。对599 bp的D-loop基因序列进行分析,共检测到24个单倍型,25个单突变位点,39个简约信息位点。在81个突变位点中,转换位点50个,颠换位点14个,插入或缺失位点17个;A+T的含量(68.8%)明显高于C+G的含量(31.2%)。5个水域个体间的遗传变异率在0到6.03%之间。单倍型多样性(H)为0.977 8,平均核苷酸差异数(K±SD)为17.271 0,核苷酸多样性(π)为0.029 7。对5个群体D-loop序列进行分化指数分析,结果表明:不同水系群体间有显著的遗传差异,而同一水系内的不同群体间差异不显著。对5个群体进行分子方差分析,结果表明:5个群体间存在显著性遗传差异。分子系统树显示:两大水系5个不同水域赤眼鳟29个个体的系统树明显分为两支:珠江15个个体聚为一支,长江14个个体聚为另一支,且都有较高的置信度。可见,长江和珠江群体间已经出现了明显的遗传变异,是因珠江和长江的地理隔离导致的生殖隔离。但在同一水系内,群体间的遗传距离和群体内的遗传差异不显著,系统树也是两大水系内的不同水域混杂在一起,说明同一水系不同水域间没有出现遗传分化,分属"长江群体"或"珠江群体"。
- 杨慧荣赵会宏刘丽陈彦珍林权卓黄宏辉
- 关键词：线粒体D-LOOP长江
- 双棘黄姑鱼IGF3基因克隆及表达模式分析被引量：3
- 2016年
- 以双棘黄姑鱼(Protonibea diacanthus)为实验对象,通过RACE方法克隆得到IGFs家族成员IGF3。双棘黄姑鱼IGF3 c DNA全长1 184 bp。氨基酸一致性分析显示,双棘黄姑鱼IGF3与尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)一致性最高,仅为58.0%;与自身IGF1的2个亚型及IGF2相比,一致性分别低至26.2%、25.2%和21.9%。系统进化树显示鱼类IGF3基因先与IGF2聚类,再与IGF1汇聚构成IGF家族,最后IGFs与胰岛素聚类。组织表达模式显示IGF3在双棘黄姑鱼心脏、性腺、脑区均有表达,在性腺中表达最强。实时定量PCR结果表明,IGF3在精巢发育期表达量显著高于其他时期,呈显著下降趋势;在卵巢成熟期的表达量显著高于其他时期。此外,雌鱼在成熟期前、中、后脑IGF3的表达量显著高于其他时期,而雄鱼各脑区IGF3表达趋势呈多样性。上述结果表明,IGF3可能参与了双棘黄姑鱼精巢发育和卵巢成熟期生殖功能的调节,且前脑可能主要参与了IGF3在性腺表达的反馈调节。
- 林权卓陈奕彬胡娟王树启杨宪宽沈卓坤赵会宏
- 关键词：双棘黄姑鱼基因克隆
- 双棘黄姑鱼促性腺激素释放激素基因的克隆及系统进化分析被引量：2
- 2015年
- 通过同源基因克隆方法得到双棘黄姑鱼促性腺激素释放激素(GnRH)的3个基因:cGnRH、sGnRH、sbGnRH,其开放阅读框为258、273bp和261bp,分别编码85个、90个和86个氨基酸,3个基因的信号肽为23个氨基酸,核心十肽分别是QHWSHGWYPG、QHWSYGWLPG和QHWSYGLSPG,这3种核心十肽经生物信息学分析均高度保守。氨基酸序列比对分析表明,双棘黄姑鱼与同科美国红鱼GnRHs基因亲缘性最近,它们的cGnRH和sGnRH的氨基酸同源性达100%,两种鱼sbGnRH的同源性也高达92.2%。用MEGA 4.0构建GnRHs Neighbour-joining系统进化树,结果显示双棘黄姑鱼cGnRH先于同科的美国红鱼聚类,再与星点东方鲀、斑马鱼和虹鳟等共同聚类;双棘黄姑鱼sGnRH则先后与其他鱼类sGnRH、cGnRH、sbGnRH聚类;而双棘黄姑鱼sbGnRH先后与其他鱼类的sbGnRH、cGnRH和sGnRH聚类。
- 杨宪宽赵会宏林权卓陈奕彬刘丽杰刘燕李治虎
- 关键词：双棘黄姑鱼促性腺激素释放激素基因克隆系统进化
- 赤眼鳟线粒体D-loop和Cyt b基因序列的对比分析被引量：18
- 2012年
- 研究了长江和珠江野生赤眼鳟Squaliobarbus curriculus共4个群体24个个体的线粒体控制区(D-loop)和细胞色素b(Cyt b)基因序列,通过PCR扩增与测序,分别获得了长度为598 bp和752 bp的D-loop和Cyt b基因片段。分析表明,D-loop序列共定义了18个单倍型,存在34个简约信息位点,67个多态性位点,发生转换40次,颠换15次,插入/缺失14次。A、T、C、G平均含量分别为33.7%、35.1%、17.5%、13.7%。Cyt b序列共定义了18个单倍型,存在68个简约信息位点,72个多态性位点,发生转换60次,颠换15次,无插入/缺失位点。A、T、C、G平均含量分别为29.3%、26.4%、29.8%、14.5%。Cyt b除简约信息位点百分比大于D-loop外,多态位点百分比和单突变位点百分比均小于D-loop,说明D-loop具有较快的进化速率。D-loop序列的单倍型多样性(H)、平均核苷酸差异数(K)、核苷酸多样性(π)分别0.963 8、16.543 5和0.028 4,Cyt b的H、K和π分别为0.971 0、31.855 1和0.042 6,显示赤眼鳟具有较高的遗传多样性水平,且遗传变异主要存在于群体间。分析群体间的遗传距离和FST值,D-loop和Cyt b都一致表明:长江和珠江水系间存在明显的遗传分化,系统树和分子变异等级分析(AMOVA)也支持这一观点。同一水系群体间的遗传差异较小,Cyt b则更小;不同水系群体间的遗传差异较大,Cyt b则更大。故,Cyt b呈现出"小则越小,大则越大"的态势。分析其原因,可能与D-loop和Cyt b进化速率密切相关。
- 杨慧荣赵会宏蒙子宁刘丽林权卓
- 关键词：线粒体D-LOOPCYT
