邓丽丽
- 作品数:15 被引量:129H指数:9
- 供职机构:西南林业大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室开放基金更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 基于高通量测序的云南松转录组分析被引量:20
- 2016年
- 采用新一代高通量测序技术平台Illumina Hiseq 2 000对云南松转录组测序,得到的数据进行de novo组装,获得80 000条Unigenes,N50为1 881 nt、平均890 nt。与公共数据库进行比对,注释到NR、NT、Swiss-Prot数据库的Unigenes分别为43 434、46 415、29 418条。将Unigenes与COG数据库比对,有14 792条Unigenes成功注释,根据功能大致分成25类;与GO数据库比对,有26 743条Unigenes获得注释,按功能分为细胞组分、分子功能和生物过程3大类55亚类,其中参与的生物过程较多;以KEGG数据库参考,有25 873条Unigenes参与128条代谢途径分支,以代谢相关的通路较为集中,并找到与木质素合成关键酶的Unigenes。这些研究极大地扩充了云南松的基因资源,将有助于云南松基因的发掘与利用、分子标记的开发及其种质资源遗传改良的研究等。
- 蔡年辉邓丽丽许玉兰徐杨周丽王大玮田斌何承忠段安安
- 关键词:云南松转录组
- 云南松EST-SSR引物在其近缘种中通用性的研究被引量:9
- 2016年
- 根据云南松EST序列设计了32对SSR引物,从中随机选取7对引物,对不同群体云南松及细叶云南松、马尾松等近缘种进行了PCR,研究云南松EST-SSR引物在近缘物种中的通用性。结果表明:所选择的7对引物对云南松不同群体及其近缘种的扩增成功率均为100%;且7对引物在云南松不同群体的多态性比例均为100%,在细叶云南松、马尾松、高山松、油松和思茅松等近缘种中分别为71.43%、85.71%、85.71%、85.71%和100%;云南松EST-SSR引物具有较高的通用性,且这些引物可用于分析云南松及其近缘种间的遗传关系。
- 徐杨邓丽丽周丽蔡年辉李德龙段安安许玉兰
- 关键词:云南松近缘种
- 茎干通直与扭曲云南松种子萌发特性比较被引量:3
- 2017年
- 以云南松通直与扭曲2种不同茎干类型植株种子为试材,对其发芽特征进行了比较分析。结果表明:发芽率、发芽势、平均发芽时间、平均发芽系数、日均发芽率、发芽指数、峰值和发芽值8个发芽指标变异较大,通直和扭曲2种茎干类型的变异系数分别为8.13%~41.20%和9.45%~42.35%;茎干扭曲类型云南松发芽指标变异系数稍大于茎干通直类型,茎干通直类型表现较稳定,但两者差异未达到显著水平;除发芽势外,其余7个指标在各类型内单株间均存在极显著差异,但8个指标在通直与扭曲2种茎干类型间差异不显著。因此,2种茎干类型云南松种子发芽特征差异不明显。
- 蔡年辉许玉兰邓丽丽唐红燕李根前
- 关键词:云南松茎干
- 云南松不同类型群体种子形态及萌发特征比较被引量:12
- 2016年
- 为了探究云南松通直和扭曲天然群体表型变异规律,对2种类型群体的种子形态及其萌发特征进行比较。结果表明,云南松种子性状的平均表型分化系数为9.87%,表型变异主要来源于群体内。群体内各种子性状均存在极显著的差异,群体间除了种翅长度外,其他均存在显著或极显著的差异,2种类型群体间的种子重量不存在显著差异,通直群体的种子形状指数高于扭曲群体,但种翅形状指数低于扭曲群体。从萌发特征来看,2种类型群体的发芽过程相似,通直群体的发芽率、发芽势和日均发芽率稍高于扭曲群体,由此表明,在相同条件下,云南松通直群体在种子萌发初期具有一定的优势。
- 邓丽丽张代敏徐杨周丽陈诗蔡年辉许玉兰
- 关键词:云南松形态性状
- 云南松转录组SSR的分布及其序列特征被引量:28
- 2015年
- 分析云南松转录组中的SSR位点信息的分布及其序列特征,为SSR引物的开发做前期工作.从80 000条转录组Unigene序列中,搜索到2 455个SSR,出现频率为3.07%,分布的平均距离29 kb.SSR以三、二核苷酸占优势,分别占总数42.73%和27.25%,而以四核苷酸的较少,仅占总数的0.98%.重复片段长度12~25 bp,其中近90%的集中在12~20 bp,平均16.09 bp.AT/AT与AGC/CTG和AAG/CTT为二、三核苷酸优势重复基元,分别占基元总数的16.66%、9.65%和8.39%.从2 899对引物中随机挑选32对引物用于检测,24对成功扩增.云南松转录组SSR位点出现的频率较高,分布距离较近,基元类型丰富,重复次数较高,具有较高的多态性潜力.云南松转录组产生的Unigene是开发SSR的有效来源,获得的SSR引物可为云南松种质资源的遗传变异研究提供更多的标记.
- 蔡年辉许玉兰徐杨邓丽丽周丽王大玮何承忠段安安
- 关键词:云南松SSR转录组
- 云南松不同海拔群体的针叶性状表型多样性研究被引量:18
- 2016年
- 为揭示云南松(Pinus yunnanensis Franch.)不同海拔群体表型变异程度和变异规律,以天然分布的云南松为研究对象,采用巢氏方差分析、相关分析等方法,调查云南省丽江、宁蒗和元谋3个地点不同海拔群体的针叶表型性状。结果表明:云南松表型性状在群体间和群体内均存在极其丰富的变异。丽江采样地点群体间平均表型分化系数(VST)为29.96%,小于群体内变异(70.04%);表型变异系数(CV)为24.93%,变化幅度13.63%~35.09%。宁蒗采样地点群体间平均表型分化系数为26.74%,小于群体内变异(73.26%);表型变异系数变化于11.96%~37.19%,平均24.18%。元谋采样地点群体间平均表型分化系数为27.79%,小于群体内变异(72.21%);表型变异系数波动于14.28%~41.3%,平均23.41%,群体内的变异是表型变异的主要来源。9个不同群体的Shannon-Wiener多样性指数为1.940 3,表明云南松群体有较高的表型多样性。相关分析表明,云南松针叶表型性状及多样性指数与海拔高度间的相关性不显著。
- 徐杨周丽蔡年辉邓丽丽王大玮段安安何承忠许玉兰
- 关键词:云南松表型多样性海拔
- 云南松茎干弯曲、扭曲特性的研究现状及展望被引量:12
- 2016年
- 云南松是分布于我国西南亚热带山地的重要树种,具有喜光、耐干旱瘠薄、适应性强、木材用途广等特点,在当地林业生产和生态经济建设中占有重要地位。但是,云南松林分中出现弯曲、扭曲等不良个体的比例逐渐增加,优良基因资源逐渐减少。文章就茎干扭曲、弯曲植株的表现,扭曲、弯曲发生规律,对植株生长和木材的影响、成因等方面的研究现状进行阐述。提出加强对茎干扭曲、弯曲特性的基础研究,结合营林措施减少林分衰退,并探讨扭曲、弯曲材利用等研究方向。
- 蔡年辉许玉兰李根前邓丽丽李伟王大玮
- 关键词:云南松木材纹理营林措施
- 云南松不同茎干类型群体遗传多样性研究
- 云南松是我国西南地区的乡土树种,是分布区域的主要用材树种,云南松不仅耐干旱瘠薄,对环境适应性极强,而且其天然更新能力强,生长迅速,对区域的经济、生态均具有着重要意义。但目前云南松林出现衰退的现象,林分内弯曲、扭曲等不良个...
- 邓丽丽
- 关键词:云南松表型多样性SSR标记择伐
- 基于高通量测序的思茅松微卫星位点的特征分析被引量:13
- 2016年
- 以思茅松针叶为材料,采用Illumina Hiseq2000平台测序,得到121 882条无冗余的序列,对这些序列进行SSR位点搜索,共获得3534个SSR位点,出现频率为2.9%,分布平均距离25kb。所搜索的SSR以单核苷酸重复类型最多,其次为三核苷酸和二核苷酸,而四、五、六核苷酸重复类型较少(<1%)。单核苷酸重复类型中以A/T基元较丰富(43.58%);二核苷酸中出现频率最高的是AT/TA基元(14.04%),AG/CT次之,AC/GT和CG/CG较低;三核苷酸重复类型中AAG/CTT最多,AGC/CTG和AGG/CCT次之,以CCG/CGG、ACG/CGT和ACT/AGT较少(<1%);四、五、六核苷酸类型中各重复基元相差不大,均较少。SSR数量随对应的重复类型重复次数的增加而降低,也随重复区段碱基长度的增加而降低。
- 邓丽丽李德龙蔡年辉周军孙琪唐红燕王大玮许玉兰
- 关键词:思茅松高通量测序微卫星
- 云南松不同群体苗木生物量与生长分析被引量:10
- 2015年
- 为了选出云南松苗木质量较高的优良群体,对云南省7个云南松群体的4年生苗木生物量和生长性状进行了测定和分析。结果表明:云南松不同群体的生长性状除主根长外,其余性状均存在极显著差异(P<0.01)。不同群体各器官的生物量、地上部分生物量和总生物量均存在极显著差异,总生物量、地上部分生物量和地下部分(根)生物量从大到小表现为群体BS>GS>KM>LJ>YL>YX>ZD,各器官生物量的分配比例从大到小表现为主干>针叶>根>侧枝。群体间的根、主干和针叶的含水率均存在极显著差异,侧枝含水率差异显著(P<0.05)。苗木生物量结构特征仅有光合器官和非光合器官比差异极显著,枝干比差异显著。综合比较后发现,保山(BS)群体和高黎贡山(GS)群体的苗木质量较好,具有较强的环境适应能力,碳储量和碳汇潜力较大。
- 周丽徐杨邓丽丽李德龙陈诗蔡年辉李悦段安安许玉兰
- 关键词:云南松苗木生物量