张迎新
- 作品数:2 被引量:6H指数:1
- 供职机构:西北农林科技大学农学院更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 基于叶绿体序列分析紫茎泽兰在菊科的系统发育被引量:6
- 2011年
- 为研究紫茎泽兰(Eupatorium adenophorum Spreng)在菊科的系统发育,利用通用引物对紫茎泽兰叶绿体DNA的rpl16内含子及psbA-trnH与trnL-F两个基因间隔区进行PCR扩增并测序,将其序列分别与GenBank中部分菊科(Asteraceae)植物的基因序列进行比对分析。应用Mega 4.0软件进行分子遗传进化分析,采用邻接法构建系统进化树。结果表明,菊科植物在系统分类上呈现出两大类群,滨菊、野菊构成一个大类,和紫茎泽兰关系较远;紫茎泽兰和毛叶泽兰、圆叶泽兰、线叶泽兰等泽兰属植物及油菊的关系最近,与向日葵和银胶菊次之,与莴苣、滨菊、野菊关系最远,表明紫茎泽兰确实隶属于泽兰属;序列组合(rpl16+ps-bA-trnH+trnL-F)长度变异范围为2 140-2 203 bp,排序后的比对长度为2 399 bp,有381个变异位点,190个信息位点,为紫茎泽兰的系统进化提供了一定的信息。
- 谭秀芳杜向红牛善策聂小军张迎新万方浩宋卫宁
- 关键词:菊科紫茎泽兰叶绿体系统发育
- 紫茎泽兰高分子量核DNA制备方法的研究
- 2011年
- 以紫茎泽兰暗培养幼嫩叶片为材料,在细胞核提取缓冲液中加入PVP、抗坏血酸和氨基甲酸钠3种强抗氧化剂,较好地去除了多糖多酚等次生代谢物,经低熔点琼脂糖包埋细胞核及蛋白酶K原位裂解DNA胶块,以获得大分子量DNA;最后分别采用2种不同的限制性内切酶(BamHⅠ和HindⅢ)和5个浓度梯度(0U、0.2U、0.4U、0.6U、0.8U)进行酶切,并对不同的回收方法进行比较分析。结果表明:经脉冲电泳检测,本方法提取的DNA片段长度>600kb,基本无细胞器DNA和蛋白质污染;酶切条件以0.4U酶浓度HindⅢ的效果最好,酶切后的DNA片段主要集中在100~300kb之间,DNA片段大小满足构建BAC文库的要求;对回收方法进行比较分析,电洗脱法回收的大片段DNA浓度远远大于琼脂糖酶切法,大于8mg.L-1,这完全能够满足构建大片段基因组文库对DNA浓度的要求。
- 张迎新贾晓鸥张月荣杜向红万方浩宋卫宁
- 关键词:紫茎泽兰高分子量DNA脉冲场凝胶电泳