徐方敏
- 作品数：1 被引量：9H指数：1
- 供职机构：江苏师范大学生命科学学院更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 基于高通量测序的陕西花马池和苟池微生物群落多样性分析被引量：9
- 2016年
- 目的:研究陕西花马池和苟池盐湖嗜盐细菌和古菌的群落多样性特征。方法:从两地盐湖采集卤水样品,提取总DNA后对其16S rRNA基因进行PCR扩增,通过Miseq高通量测序和生物信息学分析得到花马池和苟池微生物群落结构。结果:细菌优化序列被分入222个操作分类单位(OTU),花马池细菌优化序列经筛选后得到26 698个序列,其中厚壁菌门(Firmicutes)占主要地位,占总序列数的24.13%,其次20.02%的序列归入变形菌门(Proteobacteria);苟池细菌优化序列经筛选得到31 329个序列,拟杆菌门(Bacteroidetes)是样品中最主要的门类,占总数的60.56%。古菌优化序列经筛选后有81 286条,被归入86个OTU中,绝大多数属于广古菌门(Euryarchaeota)。在属水平上,2个盐湖共有的优势古菌群落包括Halonotius、盐红菌属(Halorubrum)、盐杆状菌属(Halorhabdus)和Halobellus等。花马池特有Halolamina、盐杆菌属(Halobacterium)、Halobellus和Halovenus。结论:研究揭示了陕西花马池和苟池嗜盐细菌和古菌群落组成,表明陕西花马池和苟池盐湖微生物群落分布具有相似性和独特性,同时存在丰富的嗜盐菌资源和潜在的新类群,为新种的挖掘及嗜盐菌的开发提供了理论数据。
- 曹露芬殷婷婷袁振亚严雨薇谢凡凡许心怡徐方敏温洪宇
- 关键词：细菌古菌高通量测序RDNA
