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李根

作品数:7 被引量:18H指数:3
供职机构:大连工业大学生物工程学院更多>>
发文基金:辽宁省自然科学基金辽宁省大学生创新创业训练计划项目更多>>
相关领域:生物学化学工程更多>>

文献类型

  • 7篇中文期刊文章

领域

  • 6篇生物学
  • 1篇化学工程

主题

  • 3篇生物信息
  • 2篇生物信息学
  • 2篇生物信息学分...
  • 2篇酶基因
  • 2篇酵母
  • 2篇毕赤酵母
  • 1篇多样性
  • 1篇油脂
  • 1篇油脂提取
  • 1篇正交
  • 1篇正交实验
  • 1篇脂提取
  • 1篇片段
  • 1篇片段克隆
  • 1篇酰基载体蛋白
  • 1篇卤化
  • 1篇结构特点
  • 1篇克隆
  • 1篇基因
  • 1篇基因片段

机构

  • 7篇大连工业大学

作者

  • 7篇薛永常
  • 7篇李根
  • 2篇蔡宏明
  • 1篇唐婧媛

传媒

  • 4篇微生物学杂志
  • 1篇工业微生物
  • 1篇生命的化学
  • 1篇中国油脂

年份

  • 1篇2019
  • 1篇2018
  • 3篇2017
  • 1篇2014
  • 1篇2013
7 条 记 录,以下是 1-7
排序方式:
海洋季也蒙毕赤酵母ACP基因的克隆及生物信息学分析
2017年
酰基载体蛋白是脂肪酸途径中重要的组件,能够结合脂肪酸代谢途径中各种脂肪酰基中间体,在脂肪酸代谢中是不可或缺的辅因子。以本实验室筛选保存的海洋季也蒙毕赤酵母基因组为模板,PCR扩增酰基载体蛋白基因,获得384 bp的目的片段。生物信息学分析显示,其具有完整的开放阅读框,编码127个氨基酸,有磷酸泛酰巯基乙胺结合位点,为非分泌型亲水性蛋白,不存在信号肽,存在9个潜在的磷酸化位点,二级结构和三级结构主要以α螺旋和无规则卷曲为主,与已知的酰基载体蛋白结构有很高的相似性。
陶永佳李根薛永常
关键词:酰基载体蛋白生物信息学
非核糖体肽合成酶缩合结构域基因片段克隆被引量:3
2017年
从大连渤海海域筛选出1株放线菌L1,结合形态观察、生理生化实验和16S rDNA分子鉴定,确定L1属于链霉菌属球孢链霉菌(Streptomyces globisporus)。根据GenBank发布的非核糖体肽合成酶(NRPS)序列设计引物,从放线菌L1的基因组DNA中扩增获得NRPS基因片段。测序结果及比对分析表明该片段属于NRPS缩合结构域部分序列。三维建模显示其结构呈V型,包含缩合结构域核心序列,与数据库已知结构相一致,可以推断该克隆片段为NRPS缩合结构域基因片段,为后续深入研究缩合结构域特异性与相关NRPS功能提供基础。
李根薛永常
大连海域海洋放线菌多样性及分类鉴定初探被引量:3
2013年
海洋孕育着丰富的微生物资源,其中海洋放线菌能够产生各种次级代谢产物及生理活性物质,对海洋放线菌的研究具有重要的实际意义。实验对筛选自大连海域的30株放线菌进行了形态及生理生化鉴定、16S rDNA序列的分析及系统发育树构建,结果表明分离到的海洋放线菌中13株分属于放线菌目链霉菌不同种或亚种,说明大连海域的海洋放线菌具有一定的多样性。
薛永常蔡宏明唐婧媛李根
关键词:海洋放线菌多样性
海洋产油酵母菌筛选及油脂提取条件优化被引量:3
2017年
采用苏丹黑B染色法,从海洋淤泥和岩石附着藻类中筛选得到一株高产油脂的海洋酵母菌,利用生理生化特征结合分子生物学方法进行目的菌株的鉴定,结果证明其为季也蒙毕赤酵母(Meyerozyma guilliermondii)。利用酸热法进行油脂提取,在单因素实验的基础上通过正交实验对提取条件进行优化。得到最优条件为:每0.5 g干菌体需4 mol/L盐酸10 m L,酸热时间10 min,有机溶剂氯仿-甲醇(体积比2∶1)25 m L,0.15%NaCl溶液10 m L。在最优提取条件下,油脂得率为40.12%。
陶永佳李根薛永常
关键词:油脂提取正交实验
非核糖体肽合成酶装配机制研究进展被引量:4
2018年
非核糖体多肽(nonribosomal peptide,NRP)是天然生物活性产物一大类群,组成结构多样,具有多种重要的药用价值。在微生物中催化非核糖体多肽生物合成的是非核糖体肽合成酶(nonribosomal peptide synthetase,NRPS),NRPS是一类模块酶系,模块的组装在非核糖体多肽合成及其环化中起着关键作用。本文主要对非核糖体肽合成酶常规模块组装模式及3种非常规合成模式进行综述,为深入了解和应用非核糖体肽合成酶在抗生素类生物活性物质中的作用提供理论依据。
薛永常李根
关键词:结构特点
非核糖体肽合成酶基因腺苷酰化结构域序列克隆及分析被引量:6
2019年
微生物许多非核糖体肽类次生代谢产物主要是由非核糖体肽合成酶(NRPS)催化合成。参考Gontang发布的非核糖体肽合成酶(NRPS)通用引物设计扩增NRPS腺苷酰化结构域基因序列的特异引物,从海洋链霉菌L1的基因组DNA中扩增获得一个715 bp的NRPS基因序列。测序结果及比对分析表明该片段属于NRPS腺苷酰化结构域部分序列。对其拟翻译的氨基酸序列组成成分、理化性质进行分析,显示其包含AFD class I超基因家族核心结合区,为NRPS腺苷酰化结构域(A结构域)所在区域。对氨基酸序列的二级结构预测和三级结构模拟,发现与数据库中肠菌素合酶F组分的结构相似。为后续研究A结构域的特异性及完整NRPS基因簇克隆提供了参考。
薛永常张成锁李根
关键词:生物信息
海洋链霉菌Streptomyces sp.B-17卤化酶基因的克隆及生物信息学分析被引量:3
2014年
海洋放线菌是生理活性物质重要的产生菌,而海洋放线菌产生的卤化酶可催化生理活性物质的卤化,极大提高了其抑菌和抗癌活性。从大连海域分离出1株链霉菌Streptomyces sp.B-17,从其基因组DNA中扩增一524 bp的基因片段,经与pMD-19T载体连接,转化大肠埃希菌JM109感受态细胞,重组质粒经鉴定证明正向插入到pMD-19T载体。生物信息学分析表明该序列与Actinocorallia herbida DSM 44252的2个依赖FADH2卤化酶基因的同源性为88%,拟编码氨基酸与色氨酸卤化酶(CP001848)的相似性也达到74%,证明所克隆的基因片段为卤化酶基因片段,为后续的基因功能分析及表达奠定了基础。
薛永常蔡宏明李根
关键词:克隆生物信息学分析
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