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舒国平
作品数:
1
被引量:2
H指数:1
供职机构:
山西农业大学农学院
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发文基金:
国家自然科学基金
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相关领域:
农业科学
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合作作者
段娜
山西农业大学农学院
贾举庆
山西农业大学农学院
郭红媛
山西农业大学农学院
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机构
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山西农业大学
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郭红媛
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贾举庆
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舒国平
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段娜
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山西农业科学
年份
1篇
2014
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燕麦microRNAs及其靶基因的生物信息学预测
被引量:2
2014年
microRNAs(miRNAs)是一类长度约22 nt的内源性非编码单链小分子RNA,通过与靶基因互补位点配对结合,在转录后水平负性调控靶基因的表达。根据miRNA在植物中的高度保守性及其前体二级结构特征,用同源预测方法将大麦、小麦、二穗短柄草等已知的植物miRNAs与燕麦表达序列标签(EST)和基因组概览序列(GSS)数据库中的非编码序列比对,采用一系列的标准进行筛选,最后预测得到46个燕麦miRNAs前体,通过在线psRNATarget检索共预测到61个靶基因。结果表明,通过生物信息学方法大大提高了发现miRNAs及其靶基因的效率,补充了燕麦miRNA数据库的不足。
郭红媛
贾举庆
段娜
张怡晴
舒国平
陈潇洒
关键词:
燕麦
EST
GSS
靶基因
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