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邸超
作品数:
1
被引量:1
H指数:1
供职机构:
清华大学生命科学学院
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发文基金:
国家自然科学基金
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相关领域:
生物学
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合作作者
吴玥
清华大学生命科学学院
鲁志
清华大学生命科学学院
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2014
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拟南芥全基因组范围的non-polyA lncRNA检测
被引量:1
2014年
长非编码RNA(lncRNA)是一类长度大于200nt不编码蛋白质的RNA,它们在生物体内发挥重要的调控作用。Non-polyA lncRNA是lncRNA的一个重要类型。为系统鉴定植物全基因组范围的non-polyA lncRNA,该文优化了拟南芥基因组范围鉴定新型non-polyA lncRNA的RNA样本纯化和测序方法,并且比较了3种不同的方法。结果表明:链特异性的non-polyA RNA长序列测序检测灵敏度更高,可以检测到更多低表达的lncRNA和更高比率的长序列lncRNA。因此,non-polyA RNA长序列测序适用于拟南芥全基因组范围的non-polyA lncRNA检测。该方法也可用于其它物种中non-polyA lncRNA的鉴定,为探究lncRNA功能提供帮助。
鲁志
吴玥
邸超
关键词:
测序方法
拟南芥
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