钱东
- 作品数：6 被引量：3H指数：1
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- 发文基金：国家自然科学基金江苏省普通高校研究生科研创新计划项目更多>>
- 相关领域：理学生物学自动化与计算机技术更多>>
- 反软子格被引量：1
- 2016年
- 首先给出反软子格的新概念以及两个反软子格分别在限制并和或的运算下仍然是反软子格。其次利用软集的反对偶给出反软子格的等价刻画。再次利用软集的反扩张原理给出反软子格在同态映射下像与原像的性质。最后在全体反软子格组成的集合H上引入链条件并讨论H是阿丁的或诺特的充要条件。
- 童娟廖祖华路腾刘维龙钱东吴修竹吴树忠
- 关键词：同态像
- P53家族基因的三周期性及其分步聚类分析被引量：1
- 2017年
- P53家族基因(p53、p63和p73)与肿瘤密切相关。为研究其相关性质,首先用Voss映射将p53家族基因的蛋白质编码序列(coding sequence,CDS)映射为数值序列;继而对数值序列进行离散傅立叶变换,并计算其功率谱;接着基于功率谱研究p53家族基因的最大功率谱、信噪比、位移偏度和三周期性强度等性质;最后利用p53家族基因的三周期性分析结果,构造其特征向量并进行分布聚类分析。结果显示,p63基因和其他两类基因的性质较为接近,而p53和p73基因的性质差异相对较大。另外,通过实例说明和比较分析的方式证明分步聚类分析对p53家族基因具有较高的有效性。
- 钱东潘以红朱平
- 关键词：P53家族基因DNA序列聚类分析
- 一种兼具生物和物理特征的E基因签名方法——以p53家族基因为例
- 2017年
- 在原来的具有生物特性的基因签名方法上,引入具有一定的物理特性的核苷酸游离电子的平均能量(EIIP),建立了一种新的E基因签名方法。定义了两序列间的E欧氏距离及e均方差公式,并对相关物种进行层次聚类分析。通过对20个物种的p53家族基因m RNA完整的CDS序列进行E基因签名得出,在每种基因中均有,物种关系越近,其基因签名相似度越高。将聚类结果与原来的基因签名方法的聚类结果作对比,发现了E基因签名方法更准确,从而更有利于深入了解p53家族基因的性质。
- 蔡蓉钱东王丹丹朱平
- 关键词：层次聚类分析
- FI代数的新型软滤子
- 2016年
- 为解决软集在代数结构上不足的问题,将软集的参数集赋予FI代数的滤子的代数结构,给出了FI代数的新型软滤子的概念.然后利用软集的交、且等运算,研究了FI代数的新型软滤子的基本性质,并运用对偶软集的方法给出了FI代数的新型软滤子的等价刻画;最后讨论了FI代数的新型软滤子的同态像和原像的性质.研究结论为进一步对软集代数进行研究奠定了基础.
- 罗晴廖祖华马帅王琪钱东李雍
- 关键词：FI代数同态映射
- 蛋白质序列图形变换及其相似性聚类分析被引量：1
- 2018年
- 基于氨基酸的疏水性和相对分子质量,先把20种氨基酸分为8类,按不同间隔角度放置于圆周上。根据z轴坐标的划分,建立一个坐标空间。将蛋白质序列中的氨基酸按排列顺序映射到空间坐标系中,得到序列的3D模型。将3D模型转换为20维矩阵图,分析序列中氨基酸对数量特征及相似性。进一步将空间坐标转换为数值序列,进行离散傅里叶变换(discrete Fourier transform,DFT),得到原蛋白质序列的功率谱,将不同长度的功率谱扩展到数据集中最长序列的长度m维。再通过计算功率谱序列间的欧氏距离来度量序列相似性,构建系统发育树。最后对不同数据集进行验证,结果显示:聚类结果与矩阵图的分析相符,且优于其他算法的效果,表明此算法对蛋白质相似性研究具有一定的有效性。
- 潘以红钱东朱平
- 关键词：系统发育树
- 基于混沌游走表示的p53家族基因的进化差异性分析
- 2017年
- P53家族基因和肿瘤密切相关,为研究其进化差异性,首先利用混沌游走表示的方法,将p53家族基因的CDS序列映射为平面直角坐标系中的点列。继而,利用点列的坐标值构造加权特征向量,以此对CDS序列进行数值刻画。接着,基于欧式距离对CDS序列作聚类分析,并定义组内精度和分组优度来评价聚类分析的结果。最后,结合基因分段和方差分析等方法进行深入研究,从而获得更为理想的分类效果。结果表明,p53家族基因的进化差异性主要体现在CDS序列的前三分之二段和加权特征向量的第2维和第7维上,这对研究p53家族基因序列具有重要意义。
- 钱东潘以红朱平
- 关键词：P53家族聚类分析
