王亚菲
- 作品数：7 被引量：19H指数：2
- 供职机构：中国科学院沈阳应用生态研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：环境科学与工程更多>>
- 携带污染物降解基因的可移动基因元件及其介导的生物修复被引量：2
- 2011年
- 可移动基因元件(mobile genetic elements,MGEs)在环境微生物群落中的水平转移是细菌基因组进化和适应特定环境压力的重要机制.在污染土壤和水体中接种携带具有降解基因MGEs的菌株后,随着MGEs的水平基因转移,可使降解基因转移至具有竞争性的土著微生物中并在其中表达,从而不必考虑供体菌在环境中是否能够长期存活.这种由可移动降解基因元件水平转移介导的生物修复为探索新的生物修复途径提供了可行性.本文重点综述了环境样品中携带降解基因MGEs的多样性及其在促进污染物降解过程中的重要作用,介绍了从环境样品中分离代谢MGEs的方法,并列举了在污染土壤、活性污泥、其他生物反应器等生态系统中MGEs水平转移的几个实例.
- 李慧周丽莎王亚菲Eva M.Top张颖徐慧
- 关键词：生物修复
- 一种利用三亲配对接合并以石油烃为唯一碳源筛选携带石油烃降解基因的可自转移广宿主质粒的方法
- 本发明涉及生物学技术和污染土壤生物修复技术交叉领域，具体的说一种利用三亲配对接合并以石油烃为唯一碳源筛选携带石油烃降解基因的可自转移广宿主质粒的方法。选用不同的Proteobacteria亚纲的染色体带有选择标记的受体菌...
- 李慧王亚菲张颖徐慧韩斯琴史荣久杨伟超陈冠雄
- 文献传递
- 一种利用三亲配对接合并以石油烃为唯一碳源筛选携带石油烃降解基因的可自转移广宿主质粒的方法
- 本发明涉及生物学技术和污染土壤生物修复技术交叉领域，具体的说一种利用三亲配对接合并以石油烃为唯一碳源筛选携带石油烃降解基因的可自转移广宿主质粒的方法。选用不同的Proteobacteria亚纲的染色体带有选择标记的受体菌...
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- 文献传递
- 石油污染土壤鞘氨醇单胞菌遗传多样性16S rDNA-PCR-DGGE分析被引量：16
- 2011年
- 鞘氨醇单胞菌是降解多环芳烃(PAHs)的重要功能微生物。然而,采用属特异引物直接从PAHs污染土壤中检测鞘氨醇单胞菌进而研究鞘氨醇单胞菌在污染土壤中的多样性、种群结构及其与PAHs污染的关系鲜有报道。本研究自行设计鞘氨醇单胞菌属特异性引物,通过16S rDNA-PCR-DGGE技术对沈抚灌区石油污染土壤鞘氨醇单胞菌遗传多样性进行了研究。结果表明,自行设计的鞘氨醇单胞菌属引物732f-982r能够特异、灵敏的从环境样品中检出鞘氨醇单胞菌。当沈抚灌区原位污染土壤的PAHs浓度小于5 mg kg-1时,鞘氨醇单胞菌多样性随着PAHs浓度的增加而增加;而初始PAHs浓度高的实验室模拟实验土壤,其鞘氨醇单胞菌多样性较低。鞘氨醇单胞菌种群结构受污染土壤总石油烃(TPH)含量的影响,TPH含量接近的土壤,鞘氨醇单胞菌的群落结构较为相似。
- 周丽沙李慧张颖王亚菲徐慧
- 关键词：石油污染土壤鞘氨醇单胞菌变性梯度凝胶电泳总石油烃
- 一种对石油污染土壤进行生物修复的方法
- 本发明涉及属于分子生物学技术和污染土壤修复技术交叉领域，具体的说是一种利用广宿主自转移降解质粒对石油污染土壤进行生物修复的方法。将携带含有石油烃降解基因和遗传选择标记的广宿主自转移降解质粒的宿主菌接种到待处理的污染土壤中...
- 李慧李小彬王亚菲张玉革杨山姜勇
- 文献传递
- 沈抚灌区广宿主石油烃代谢质粒的分离及鉴定被引量：1
- 2013年
- 本研究采用"三亲配对外源分离法",从沈抚灌区土壤、底泥和水样中共计分离得到8个广宿主(BHR)石油烃代谢质粒,并通过对其进行抗生素抗性检测和抗性遗传标记,将其转移至大肠杆菌(Escherichia coli)EC100宿主中进行操作.不相容性群分析结果表明:pS3-2C、pS4-6G为Inc P质粒;pS3-2G、pW22-3G、pA15-7G为Inc N质粒;pS7-2G为Inc W质粒;pA23-1G和pA10-1C为Inc Q质粒.采用PCR扩增已报道的石油烃污染物降解基因的方法初步分析其石油烃代谢功能,质粒pS3-2G、pS7-2G、pA23-1G、pW22-3G和pA10-1C上含有编码芳香环羟化双加氧酶基因(phdA)和甲苯单加氧酶基因(touA)的片段;pA15-7G含有编码甲苯双加氧酶和甲苯单加氧酶基因片段;pS3-2C含有编码芳香环羟化双加氧酶、苯双加氧酶和甲苯双加氧酶基因片段;pS4-6G仅含有编码芳香环羟化双加氧酶基因片段.通过宿主范围检测,除质粒pS3-2C外,其余7个质粒均可在变形菌纲(Proteobacteria)α-、β-、γ-亚纲的代表性菌株根瘤农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)C58、钩虫贪铜菌(Cupriavidus necator)JMP228、大肠杆菌EC100间进行转移并稳定传代.
- 王亚菲李慧李小彬
- 关键词：水平基因转移石油烃降解
- 一种利用广宿主自转移降解质粒对石油污染土壤进行生物修复的方法
- 本发明涉及属于分子生物学技术和污染土壤修复技术交叉领域，具体的说是一种利用广宿主自转移降解质粒对石油污染土壤进行生物修复的方法。将携带含有石油烃降解基因和遗传选择标记的广宿主自转移降解质粒的宿主菌接种到待处理的污染土壤中...
- 李慧李小彬王亚菲张玉革杨山姜勇
- 文献传递
