黄宏刚
- 作品数：4 被引量：14H指数：2
- 供职机构：中国农业科学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技支撑计划重庆市自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学医药卫生生物学更多>>
- 猪TIMP-2基因克隆、序列特征和表达分析被引量：1
- 2009年
- 本研究分析了五指山试验用小型猪TIMP-2基因的分子特性和可能的生物学功能。将人TIM-P2 mR-NA全长序列在猪ESTs数据库中检索获得同源性较高的ESTs,用电子克隆结合RT-PCR方法克隆获得包含完整CDS区的猪TIMP-2基因cDNA序列,应用生物信息学方法分析了其核苷酸序列及其编码蛋白质分子结构特性,应用RT-PCR研究该基因在猪不同组织和发育时期的特异表达情况。结果,猪TIM-P2 cDNA序列全长790 bp,包括663 bp的完整开放阅读框,编码221个氨基酸。多序列比对和系统进化分析表明,该基因编码蛋白质与人(97%)、大鼠(97%)、小鼠(97%)等物种TIMP-2蛋白质具有较高的同源性。蛋白质序列预测分析发现,猪TIMP-2氨基酸序列理论等电点(pI)为7.65,相对分子质量(MW)为24.5 ku,它包括27AA的前导序列和194AA的成熟肽段,其前导序列比其它物种多1个亮氨酸(Leu)。结构功能预测发现其具有1个在种间高度保守的NTR_TIMP结构域和N端VIRAK保守序列,序列中存在的12个半胱氨酸(Cys)可以形成6对二硫键结构。表达谱分析表明TIMP-2基因在猪的多个组织和不同发育时期的表达量存在较大差异,在睾丸、垂体、胃、大肠、卵巢、子宫和90 d胚胎骨骼肌中高表达;而在心脏、小肠、脑、肝脏、成年猪骨骼肌中表达量极低;在肾脏、胸腺、脾、甲状腺3、3 d胚胎中中度表达。结果表明该基因在发生组织发育和重构活动相对活跃的组织器官和时期表达水平较高,亦符合其固有生物学功能。
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- 关键词：TIMP-2电子克隆表达谱
- 荣昌猪和两种小型猪遗传背景的微卫星分析被引量：8
- 2008年
- 荣昌猪是我国优良地方品种，巴马香猪和贵州小型香猪为我国独特小型猪品系。本研究采用美国猪基因组协作计划推荐的19个微卫星标记对荣昌猪、荣昌猪B系、巴马香猪、贵州小型香猪及外来猪种大白猪进行了遗传学检测和分析。结果表明：19个微卫星位点在群体中均表现为多态，每位点等位基因数10～23个。5个猪种中荣昌猪B系的遗传多样性最高，荣昌猪次之；2种小型猪的遗传多样性较低，其中巴马香猪的等位基因数（121个）略大于贵州小型香猪（114个），但其遗传多样性指数（平均期望杂合度0．6535±0．0347）小于贵州小型香猪（0．6919±0．0227），反映了巴马香猪较低的基因杂合度和较小的遗传变异；大白猪的遗传多样性最低。从品系的共有等位基因来看，荣昌猪B系基因背景组成中其亲本品系荣昌猪所占比例（30．22％）要大于大白猪（24．37％）；大白猪和其他4个猪群体的共享等位基因数均较低（21．24％～25．12％）；巴马香猪和贵州小型香猪之间共有等位基因数最高（45．06％）。采用基于遗传距离的NJ法和基于基因频率的最大似然法进行系统聚类，除了大白猪明显为独立分支及荣昌猪B系表现出较远的聚类关系外，其他3个猪种间的聚类有所不同。
- 商海涛黄宏刚白小青李琴王金勇魏泓
- 关键词：小型猪微卫星
- 小型猪微卫星标记多重PCR体系的建立与应用被引量：5
- 2009年
- 目的建立实验用小型猪微卫星标记的多重PCR体系和进行实验猪群的遗传监测。方法利用3种不同荧光标记的微卫星引物结合ABI3700遗传分析仪测序的方法,通过筛选和优化反应条件,建立可用于实验用小型猪遗传质量控制的稳定的多重PCR反应体系。在此基础上进一步检测实验用小型猪近交群体的遗传变异以验证建立体系的效率。结果筛选出了2组理想的组合:组合1包括SW742、S0228和S0218座位,复性温度58℃和56℃;组合2包括S0155、SW902和S0227三个座位,复性温度为60℃和58℃。组合内不同座位标记不同的荧光染料。还以此检测了实验用小型猪群体中的遗传变异。结论初步建立了中国三种实验用小型猪微卫星标记检测的多重PCR体系,为快速、大通量、准确的小型猪遗传监测提供了初步的技术基础。
- 公维华张宁波程佳月杨述林黄宏刚冯书堂王爱德甘世祥李奎
- 关键词：微卫星多重PCR
- 猪MMP-2和TIMP-2基因特征与功能分析
- 基质金属蛋白酶-2(MMP-2),又称明胶酶A (gelatinase-A)或IV型胶原酶(type IV collagenase),是基质金属蛋白酶家族重要成员,它能够降解明胶和IV型胶原以调节组织重构活动过程。然而近...
- 黄宏刚
- 关键词：MMP-2基因组结构染色体定位组织表达谱免疫性状
- 文献传递
