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张雁明: 作品数：10 被引量：91H指数：6; 供职机构：山西农业大学农学院更多>>; 发文基金：国家自然科学基金山西省回国留学人员科研经费资助项目山西省科技攻关计划项目更多>>; 相关领域：农业科学生物学更多>>

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全基因组关联分析:基因组学研究的机遇与挑战被引量：21: 2013年; 全基因组关联分析(genome wide association study,GWAS)是利用全基因组范围内筛选出高密度的分子标记对所研究的群体进行扫描,分析扫描得出的分子标记数据与表型性状之间关联关系的方法。GWAS的出现为全面系统地研究基因组学掀开了新的一页,目前主要应用于人类疾病复杂性状的分析,已鉴定出大量与人类复杂疾病或数量性状相关的遗传变异,成为研究人类基因组学的关键手段。在植物基因组中的研究应用虽刚刚起步,但也取得了良好的效果,应用GWAS发掘植物复杂数量性状基因、为植物分子育种提供依据已成为国际植物基因组学研究的热点。然而,GWAS的结果还存在一些问题,并非早期预测和想象的那样简单。现针对GWAS的特点,对其在人类基因组和植物基因组中的应用及其未来发展进行综述。; 张雁明邢国芳刘美桃刘晓东韩渊怀; 关键词：分子标记功能基因组学

基于PEG胁迫表达谱发掘调控谷子干旱胁迫的泛素连接酶E3基因被引量：1: 2016年; [目的]探析谷子调控干旱胁迫的E3基因。[方法]本文基于二代测序技术获得勾勾母鸡咀（GG）和晋汾16（JF）在PEG胁迫下的转录表达谱数据,运用生物信息学检索筛选出11个干旱相关的E3基因,对其理化性质、功能域、启动子元件、表达模式以及与其它物种E3基因的系统进化分析。[结果]蛋白等电点介于4.78~8.88之间,功能域主要为ZF_UBR型、ZF_RING和U_BOX型三类,启动子序列包含干旱诱导响应元件MBS或脱落酸响应元件ABRE等,其中Si001665m和Si022170m与PUB22/23亲缘关系较近,Si029090m与PUB19亲缘关系较近。[结论]初步确定这些是调控谷子干旱胁迫的E3候选基因,可能受干旱或脱落酸诱导表达,这为进一步研究谷子干旱响应相关的泛素连接酶E3基因提供理论依据。; 宋敏马芳芳侯思宇张雁明刘龙龙耿潞阳江璇宇李红英韩渊怀; 关键词：谷子干旱胁迫表达谱

不同谷子品种抗旱性比较及干旱相关基因表达分析: 谷子起源于中国,在中国有7000多年的栽培历史,主要分布于中国北方干旱和半干旱地区,是典型的抗旱耐瘠作物。目前,谷子的抗旱研究主要集中于抗旱鉴定方法及表型特征等形态分析,对于谷子抗旱分子机制和发掘抗旱关键基因的研究则非常...; 张雁明; 关键词：谷子基因表达; 文献传递

抗拿捕净晋谷21突变体的筛选和分子鉴定: 2021年; 谷子(Setaria italica(L.)P.Beauv.)是我国重要的杂粮作物,具有抗旱耐贫瘠、水分利用率高、适应性广、营养丰富等特点,但谷子田间除草一直制约着谷子的集约化栽培和有机旱作产业规模化的推广与发展。为快速选育抗除草剂谷子品种,本试验以晋谷21突变体M2群体为试验材料,通过喷施0.33%拿捕净除草剂对晋谷21突变群体进行初次筛选和再次筛选,进而快速获得抗拿捕净除草剂突变体植株并对其进行分子鉴定。结果显示,在大田苗期喷施0.33%拿捕净除草剂的初次筛选中,筛选出抗拿捕净除草剂的晋谷21突变体共39个株系;对这39个突变体株系再次喷施0.33%拿捕净除草剂,筛选获得9个有抗拿捕净除草剂特性的株系。对筛选获得的抗拿捕净突变体株系的其中3个株系共15个植株进行分子鉴定,发现有4个突变体植株的ACCase基因编码的第1780个氨基酸-异亮氨酸突变为亮氨酸。该结果可为今后利用分子生物学手段改良名优谷子品种晋谷21、加速抗除草剂谷子品种的选育提供理论和材料基础。; 杨柳亚刘美桃张雁明张彬韩渊怀李红英; 关键词：突变体拿捕净

谷子抗旱研究进展被引量：28: 2013年; 前人对谷子的研究主要集中在抗旱鉴定的方法以及表型特征等形态方面,有关谷子抗旱性分子机制和从谷子中发掘抗旱基因的研究几乎是空白。就植物抗旱的分子机制、谷子抗旱的鉴定方法和分子机理研究进行综述,并对谷子抗旱研究进行了展望。; 张雁明刘晓东马建萍温琪汾韩渊怀; 关键词：谷子抗旱分子机理

植物NAC转录因子的研究进展被引量：10: 2012年; 近年来,新发现的NAC转录因子是具有多种生物功能的植物特异性转录因子,其N端为150个左右保守的氨基酸组成的NAC结构域。NAC转录因子在植物生长发育、激素调节和抵抗逆境胁迫等方面发挥着重要的作用。就植物NAC转录因子的基本结构特征、生物学功能及其在植物细胞次生壁生物合成过程中的作用进行了综述。; 邢国芳张雁明张魏斌马新耀韩渊怀; 关键词：NAC转录因子生物学功能

基于表型性状和SSR标记的山西省青狗尾草资源遗传多样性分析被引量：5: 2016年; 利用表型性状和SSR标记对山西省41份青狗尾草资源进行遗传多样性分析。在表型水平,通过分析每份资源的株型、穗型、叶型等14个表型性状指标的测定结果,发现山西青狗尾草资源具有较为丰富的表型多样性,其中叶片绿色的深浅即叶绿素含量遗传多样性指数最高,为2.76,其余性状遗传多样性指数也大多保持在2.0左右;大多数青狗尾草的穗型为纺锤形,籽粒颜色和形状分别是青色和纺锤形。通过表型聚类可将山西青狗尾草资源划分为3个类群:第1类主要表现为株高、穗数等整体指标居中;第2类主要表现为植株小,穗数少,单株干重低等;第3类主要表现为植株高大,穗数多,穗重等。聚类分析发现表型多样性与山西特定生态地理区划有一定相关性。在分子水平,利用20对SSR引物共检测到102个等位变异,平均每个位点5个,基因多样性与PIC的平均值分别为0.66和0.61。虽然聚类分析、群体结构分析和主成分分析均将41份青狗尾草资源分为了3类,但3种方法对狗尾草资源的划分结果并不完全一致,且划分出的3个类群与山西的生态地理区划也不完全一致,表明不同表型和遗传背景的青狗尾草资源在山西混合分布,区域之间没有明显界限。; 张耀元任彦鑫禾璐张雁明张彬王兴春李红英韩渊怀; 关键词：表型性状 SSR标记

谷子ABF3基因对PEG胁迫的响应被引量：12: 2013年; ABF/AREB转录因子在植物抗旱调控途径中起着重要的作用,ABF3主要参与ABA胁迫应答。利用拟南芥ABF3基因序列从谷子基因组中比对获得同源ABF3基因序列。该基因有2种可变剪接形式,分别编码由354个和357个氨基酸残基组成的蛋白质,分子量和等电点分别为38153.65Da、38234.68Da和9.27、6.48。采用实时荧光定量PCR分析SiABF3基因表达,发现该基因在抗旱品种勾勾母鸡咀和干旱敏感品种青谷1号中的表达存在显著差异。抗旱品种在20%PEG-6000模拟干旱胁迫0.5h时,mRNA转录水平达到峰值;干旱敏感品种在干旱胁迫2h时SiABF3基因表达达到最高值。转录因子基因SiABF3在干旱胁迫初期的快速表达可能与谷子抗旱性有着紧密的联系。; 张雁明王莉张彬王海岗彭锁堂李萍韩渊怀; 关键词：干旱基因表达

大豆食心虫侵食大豆荚位对69个品种(系)产量的影响被引量：1: 2013年; 大豆食心虫是危害大豆的世界性害虫,严重影响大豆的产量和品质。试验以69个品种(系)为材料,研究大豆食心虫侵食大豆不同高度豆荚和豆粒部位对产量的影响。结果表明,不同品种(系)的虫食相关性状差异极显著;最高与最低虫食荚位之差占株高的比例与单株粒重呈显著负相关;虫食荚位高度小于40cm与单株粒重呈极显著负相关;株高100～120cm的产量较株高小于100cm和大于120cm的产量高;食心虫侵食豆粒时较少侵食豆脐。; 张雁明任彦鑫祝天天侯思宇张海平韩渊怀; 关键词：大豆食心虫豆荚

玉米昼夜节律钟基因CCA1的克隆及表达分析被引量：8: 2011年; 昼夜节律钟基因CCA1在调解水稻和拟南芥的光周期反应中起着重要作用。本研究利用从水稻和拟南芥中分离到的CCA1基因序列作为靶序列BLAST获取Genbank中的信息,通过RT-PCR方法克隆获得了一条2326bp的玉米CCA1基因cDNA序列。BLAST比对发现其与水稻、大麦和拟南芥的序列相似性分别达73.7%、69.4%和39.8%。利用NCBI中的ORF Finder软件分析,发现该序列包含一个2163bp的开放阅读框,编码720个氨基酸残基,蛋白的分子量约为78819.17Da,等电点为6.468。推测其含有3个myb-DNA结合域、7个N-豆蔻酰化位点、1个G-box蛋白结合域以及1个蛋白跨膜结合域。采用实时荧光定量PCR分析发现,随光照时间的变化,该基因在玉米叶片中的表达量呈现出白天不断降低而夜晚逐渐升高的昼夜变化趋势。本研究为进一步研究玉米CCA1基因在调控玉米光周期敏感现象中的功能,阐明玉米光周期敏感机制提供了科学依据。; 邢国芳杜伟建张雁明韩浩坤韩渊怀; 关键词：光周期基因克隆基因表达

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